Id Trinity | TRINITY_DN49769_c0_g1_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_453598 |
Sequence | AAAAAAAATGGCACCTAAAATATTTGCTCTTCTTGGGAAAGTCAATTAATATTATTAATATATATTTAATATTTCCCCGTAGAGACGAAAAGAGTGTGCG AGAGAGAGAGAGGAAGAAGCTCTTTCGATCTACCATCGTCACCGGGAATTTAACTCTCTTCTCTCCATCTCTGAGATTTCACCATGATTTCTTCATCCAA ACTCAAATCCGTCGATTTTTACAGAAAAATCCCAAGAGATTTGACCGAGGCGTCGTTATCAGGAGCTGGATTATCCATAGTGGCTGCTCTCTCCATGATG TTTTTATTTGGAATGGAACTAAATAATTATTTGTCTGTCAGCACATCTACATCTGTGATTGTTGACAAGAGTTCCGATGGAGATTTTTTACGTATAGATT TCAATATCAGTTTTCCATCACTTTCATGTGAGTTTGCATCTGTTGATGTGAGCGATGTGCTGGGAACAAACAGGCTCAATATAACGAAAACAGTTCGTAA GTTTTCCATCGATTCAAATTTAAGACCCACTGGTACTGAGTTTCATTCAGGAACAGTTGCAAATGCTGTTAAGCATGATGATGAAGTAGATGGAGATTCT GTTGAAGGTTCTTTATCTCTCACTACGCAGAACTTTGATAAATATGTTCACCAGTTTCCAATTACAGTTGTTAACTTTTATGCACCTTGGTGTTCCTGGT GTCAACGTTTGGTAATTATTTAATACTGATTTTTTAGCCCCTCTTCACATAAGGAAATAAGAGCAGTACCATATCTTTGTTGCTTCCTAAATAGTGTGAC TTTTATTATTCTTTTTCAACAATATCTTACTGCCCCTAAAAAATTAAGTGCCCCTTAGGTGCAAGCCCAGTAGTAGTGGCAAAGGCTAATCCAAGACCTT 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CCTCCACTAATTTTTTGTATTCGTTCTTGGTTGAGTTGAAAAATGTTGATATGATATAGGATGCTGAATAATTTTGAATGTAAAATTCGGATTATATTGG TGATAATCTGGACTTGTCAGTGAAGCTTTTTGCATATCACGTTATACTAAGAATTTGTTCTGTG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_172045; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_453598
Blastp | Protein disulfide-isomerase 5-4 from Arabidopsis with 64.23% of identity |
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Blastx | Protein disulfide-isomerase 5-4 from Arabidopsis with 78.41% of identity |
Eggnog | Endoplasmic reticulumgolgi intermediate compartment protein(ENOG410XP7X) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G27080) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019413484.1) |
Pfam | Endoplasmic reticulum vesicle transporter (PF07970.11) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |