| Id Trinity | TRINITY_DN49772_c0_g4_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_454774 |
| Sequence | CAGCAATTTTGTTGTTACCAACTGAGTTTGACATTCCCAAACAGAGCATAACAAATTAACAATCGAACTGTAGGGCCCACTTCCTAACCATGAGTTTAGT AACGCTCCTTCATTCCGTTAACCACTTCCTTCTCTAGATCTCAACATTAGGGTTTTAAATTTGGGGCAAATTCCCAATTCACTACTAATCCGAGTTTTAT CACCGATGTTTGAATAATTTGAATTCAATCGAAGAATTCACACGTATCGTGACGAAGTTTATATGCAGATATAAATGGAGATGCAGAGAATTATCGAGTT TCACGATAGGATTATGGACAAGAGACCAAGGAAGAAGCCTCGTTTAACATGGGATATGCATCCACAACCACAACCACATCCTCCAATTCCTCCTACTAAG GTTCTTCCCACAATATATCACAACCAGGAGGTTGGGAATGGAGTGGCTCCAAATCATGCCTATCCTTCCATGTTTTTTCGAGGAATGACTCGTAATGGAT CACCCCCTTGGAGGCCTGATGATAAAGATGGTCACTATGTTTTTGCTGTCGGTGACAGTTTAACACCTCGATGTATGTCATTCGTCCTCATTTACTATAT AAAGTCTCTCAGGTGCACGCGATGTTAGTGAACTCGTAGCACAAAATTTCCATAACCCCTCTTTTTTAATCATCGAAAATATGAGTATGAATGATTATTT CCAACAATTAAATACATGACCATTTTCATTCATTTGTGTGGTGTTTTTGTATTAGTTATCAGCGCTTATGTCACACATGGCCTTGTCTAAATTGTTTCCC CTTATGTTTGCAGACAGAATTATCAGTAAAATGGGTGAAGGTGGGTAGTGCTTCAGTTTCGAAGAATGTTATTTCAAGTTCAATCCCCCTCCCTTTCTAC ATCTTCTATGTTAAAATACTTTTTAAGCTTATTAAGATTTAACATCACATTTTGCATGTTTATCTGTATTCTTGGTATATTGGTCATTTGTCCTAACGTT GATGTCCAAAATTTATCAAAATTTATGCAGGAACGTTTGGCCAAGTCTTGGAATGTTTTGACAATGAAAAGAAAGAAGCTGTGGCAATCAAAGTTGTTCG GTCCATAAGCAAGTATCGTGAGGCTGCAATGATTGAAATTGATGTCTTGATGAGGCTAGCCAGACACGACATCAATGGTGCACGGTAAGAGTTATTTTTG GTTGTCTTTCATTGTTGATTGCACATGTTAAAAGCGACTCTGGTATAAATGGTTTCATTCTTTGCAGTTGTGTGCAAATTCGGAATTGGTTTGACTATCG TAATCATATTTGTATTGTAAGTATTTGTTGATATTTGTAATTTGATTAAGATGATAGGAATGTCTATTCGGTCATGCTTAAATATTCTGGGAGTTAAAAA ACTTGCGGATGGATTTAAATGGTTTCAACAGGTGTTTGAGAAGCTTGGACCAAGCTTATATGATTTTCTCCGCAAAAACAGCTACCGTTCCTTTCCCATT GATCTTGTTCGGGAGTTTGGCAGACAACTTTTGGAGTCTGTAGCATGTGTGTGGACATATCCTGTACCCACTACCAAATTATATATTTTTTATACATATT TATGCTCCTTCTCTGTTGGGAGTTTAAGACATGTGCATATGTAATAACTCATTTGAATCTGGATAATATAATCTTTTGGTATTTGAAACAACCTAAACTA TTATTGAGTCGATTTCAAATAAATTTTATTATAATTGATTATGCGTTTAGGTTACTTATTATGCTACTCATATATGCAGTTATGCATGACTTGTGCTTGA TTCACACTGATTTGAAGCCAGAGAATATTCTTCTAGTCTCATCAGAATTTATTAAAGTGCCTGATTACAAGGTATCATCTTCCTAACTATTCTCCTAGAA TCCTTATTCAACTTGTAATTCACTTGTCAGTTAATGGAATTAACCTGTTGGTACTAGCAGTGGGTGTTAATATACTTTTGGACCGTGCAGTTGCATTTTT TCTTTTGTAAAAAATAGATAGTGAGATTAATTCATATTCTAAATTTTAATAAGACAGATTCGGCAACCATGTAAGTTTTCATGCACTTATTCCTCACAAT TCTCAAATATCAAAACTTTACATTTGTTCCTTTTTTGTTGGAAATTCTTTATTTGTGGCAATTCAGTTTCTATCACGGACCATGAGAGATGGCTCCTATT TCAAGAACCTACCCAAGTCTAGTGCCATTAAGCTCATTGATTTTGGGAGTACAACGTTTCAACATCAGGATCACAGTTATGTGGTATCAACAAGACACTA TCGTGCACCAGAAGTTATCTTAGGTATTGGGTGGAACTACCCTTGTGATCTTTGGAGTATAGGCTGCATACTAGTTGAGCTTTGCTCTGTAAGTAATCAT CAGTCTAAACCTTCTTTACTTTCCTTTACTTGTTATGCATGAAGGTTAGAATCACGGTTCCTTAGTAATATCATGCTGTAGCAAGCTCTATAGGATTAAG TGGTGACCCATGAATTCTTGCGCTACTCTGCGTTTCTAGCTTGGCAATTTTGATAAGGCGCTTGGACAATGCTACTATTTGTGTAATAGATATATTGCAA CAGCATTTGCTAAGTCTGCCAACTGGAAAATTATGAAAATTTGCTATTTTTTTATTTGAAGTCTTTCCTAAATCACTTCATCAATCCCCATCCTCCCTCA ACGTCATCCATTGGAACTGTCAGAGTTCACTAAGGTCTTTGTTGCCAACAGTGTTTGGTTTTGCTGGTGGAGTCTCTTCTTCCTCTCTTCATGTTGAAGA CTTCACTCACTCGCTACCTTCCCAGCTTTTCTGTTGCTCAGTTGCTCTCCTCTACCCTCAACGTCATCCATTGGAACTGTCAGAGTTCACTAAGGTCTTT GTTGCCACAGTGTTTGGTTTTGCTGGTAGAGTCTCTTCTTCCTCTCTTCATGTTGAAGACTTCACTCACTCGCTACCTTCCCAGCTTTTCTGTTGCTCAG TTGCTCTCCTCTACCCTCAACGTCATCCATTGGAACTGTCAGAGTTCACTAAGGTCTTTGTTGCCAACAGTGTTTGGTTTTGCTGGTAGAGTCTCTTCTT CCTCTCTTCATGTTGAAGACTTCACTCACTCGCTACCTTCCCAGCTTTTCTGTTGCTCAGTTGCTCTCCTCTACCCTCTTATCTGTTCTGATTTCTGAGT CCCTATGTTCTGAGCTAGAATTATTGGGTTCTCAGTTTTCTATGCAGCTGCAAAACTTGACCAAGAAACAGAGGATGTGTCTTTCATTGAGTTTTCAGTT TCTAATATTTTGTTTTTATCTAGAGTGCATGCGAAGAAACTTAGTTGAGGTTGTTTTATTTCAATACTTTTAGAATTCATGACATATACAGATTCGACAA AGTTTAACGTTGACTATCGACTTCCTAACATAACATTAATCTTTTATCTGGGCTTAGGATCGGCTATGTATAACATCAAGCATGCATTGGCAGGTCTGAC TGTTGCTATAATAAGAGTTCATGGCTTATGTTTGTTTAAAATAGATTAAATAATGCTTTCAAAATGTTGCTACACTCGGGAGGGCTCACTGTTTCCATCA CCAGAATTGCCCTATCATACCACACAATTGGGATTGGATTGGGCTGGAGTTGTCAGTTTTGTTTTTCTTTGGGGTTGGCAAGATTATCTTATTTTCCCAT CCTTGTTATTACTTCGACCAGCAAAACTTTAAGATTTCCTGAGTGACTTGAGAAATTTTACTTCAGATCCCCTCCCCTCCCGCTTTTTTTTCCTAATGTT CCTCTTATGTGTATATGATCAGGGTGAGGCACTTTTCCAGACACATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGAGTTTTAGGGCCACTACCTCCC CATATGGTTGTCCGGGCCGAGTAAGAGATTTTGGGTTCTCTTTGCTTTGAGAAATATTTATTGTATTCCATTTCCTGTGGATTCTCATGTAATGCCTGTT GTTGCAGTCGACGAGCTGATAACTATTTTAGAAGGGGCACACGGTTAGGTTGGCCGGATAGTTCAACTTCAAGAGAAAGCATGAGGGCAGTTTGGAAATT GCCTCGTTTGCCGAACCTTATAATGCAGCACGTTGATCATTCTGCTGGTGATTTGATTGACCTCTTGCAAAGGCTCTTAAGGTATGACCCTACAGAAAGG ATAAAAGCAAGGGAAGCATTAAGACACCCCTTCTTCTCAAGAGATACTAAAAGACATGGTTACCCTTTTTAAGTACCACAGACATTATAATCGCTTGGTG GAGAAAACACTGTTGAGAATGAATGTTGTAGCAACACAAATGCTTGAAATCCTTTGATTGTTTGCTCCACTGTATAGTGAAATGTATTTTGTTTTGTAAT TGTGTTTGTTTTTTTTCACTCCCTTTTTCTTCTCATATTATTGGTGTTTGAGCAAGTAAATAAACCTCAGTTTTAACCACCTATCTGGTTGAAGTGGATT CATATCTTGTCCTCTTAGTATGATGATTGTTATGGTGCGGTTGTTTTATACTTCTATGGTGTCAAATTAAGTTCAAAAGAATCATATTTGTAAAAGTATT ATGATCATAATTGATATTTCTAGTTACTAGGTGTTTCAGAAAACTTGTT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_172068; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_454774
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Serine/threonine-protein kinase AFC1 from Arabidopsis with 66.43% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019444388.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |