| Id Trinity | TRINITY_DN49772_c0_g4_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_454793 |
| Sequence | CAGCAATTTTGTTGTTACCAACTGAGTTTGACATTCCCAAACAGAGCATAACAAATTAACAATCGAACTGTAGGGCCCACTTCCTAACCATGAGTTTAGT AACGCTCCTTCATTCCGTTAACCACTTCCTTCTCTAGATCTCAACATTAGGGTTTTAAATTTGGGGCAAATTCCCAATTCACTACTAATCCGAGTTTTAT CACCGATGTTTGAATAATTTGAATTCAATCGAAGAATTCACACGTATCGTGACGAAGTTTATATGCAGATATAAATGGAGATGCAGAGAATTATCGAGTT TCACGATAGGATTATGGACAAGAGACCAAGGAAGAAGCCTCGTTTAACATGGGATATGCATCCACAACCACAACCACATCCTCCAATTCCTCCTACTAAG GTTCTTCCCACAATATATCACAACCAGGAGGTTGGGAATGGAGTGGCTCCAAATCATGCCTATCCTTCCATGTTTTTTCGAGGAATGACTCGTAATGGAT CACCCCCTTGGAGGCCTGATGATAAAGATGGTCACTATGTTTTTGCTGTCGGTGACAGTTTAACACCTCGATACAGAATTATCAGTAAAATGGGTGAAGG AACGTTTGGCCAAGTCTTGGAATGTTTTGACAATGAAAAGAAAGAAGCTGTGGCAATCAAAGTTGTTCGGTCCATAAGCAAGTATCGTGAGGCTGCAATG ATTGAAATTGATGTCTTGATGAGGCTAGCCAGACACGACATCAATGGTGCACGGTAAGAGTTATTTTTGGTTGTCTTTCATTGTTGATTGCACATGTTAA AAGCGACTCTGGTATAAATGGTTTCATTCTTTGCAGTTGTGTGCAAATTCGGAATTGGTTTGACTATCGTAATCATATTTGTATTGTAAGTATTTGTTGA TATTTGTAATTTGATTAAGATGATAGGAATGTCTATTCGGTCATGCTTAAATATTCTGGGAGTTAAAAAACTTGCGGATGGATTTAAATGGTTTCAACAG GTGTTTGAGAAGCTTGGACCAAGCTTATATGATTTTCTCCGCAAAAACAGCTACCGTTCCTTTCCCATTGATCTTGTTCGGGAGTTTGGCAGACAACTTT TGGAGTCTGTAGCATGTGTGTGGACATATCCTGTACCCACTACCAAATTATATATTTTTTATACATATTTATGCTCCTTCTCTGTTGGGAGTTTAAGACA TGTGCATATGTAATAACTCATTTGAATCTGGATAATATAATCTTTTGGTATTTGAAACAACCTAAACTATTATTGAGTCGATTTCAAATAAATTTTATTA TAATTGATTATGCGTTTAGGTTACTTATTATGCTACTCATATATGCAGTTATGCATGACTTGTGCTTGATTCACACTGATTTGAAGCCAGAGAATATTCT TCTAGTCTCATCAGAATTTATTAAAGTGCCTGATTACAAGGTATCATCTTCCTAACTATTCTCCTAGAATCCTTATTCAACTTGTAATTCACTTGTCAGT TAATGGAATTAACCTGTTGGTACTAGCAGTGGGTGTTAATATACTTTTGGACCGTGCAGTTGCATTTTTTCTTTTGTAAAAAATAGATAGTGAGATTAAT TCATATTCTAAATTTTAATAAGACAGATTCGGCAACCATGTAAGTTTTCATGCACTTATTCCTCACAATTCTCAAATATCAAAACTTTACATTTGTTCCT TTTTTGTTGGAAATTCTTTATTTGTGGCAATTCAGTTTCTATCACGGACCATGAGAGATGGCTCCTATTTCAAGAACCTACCCAAGTCTAGTGCCATTAA GCTCATTGATTTTGGGAGTACAACGTTTCAACATCAGGATCACAGTTATGTGGTATCAACAAGACACTATCGTGCACCAGAAGTTATCTTAGGTATTGGG TGGAACTACCCTTGTGATCTTTGGAGTATAGGCTGCATACTAGTTGAGCTTTGCTCTGTAAGTAATCATCAGTCTAAACCTTCTTTACTTTCCTTTACTT GTTATGCATGAAGGTTAGAATCACGGTTCCTTAGTAATATCATGCTGTAGCAAGCTCTATAGGATTAAGTGGTGACCCATGAATTCTTGCGCTACTCTGC GTTTCTAGCTTGGCAATTTTGATAAGGCGCTTGGACAATGCTACTATTTGTGTAATAGATATATTGCAACAGCATTTGCTAAGTCTGCCAACTGGAAAAT TATGAAAATTTGCTATTTTTTTATTTGAAGTCTTTCCTAAATCACTTCATCAATCCCCATCCTCCCTCAACGTCATCCATTGGAACTGTCAGAGTTCACT AAGGTCTTTGTTGCCAACAGTGTTTGGTTTTGCTGGTGGAGTCTCTTCTTCCTCTCTTCATGTTGAAGACTTCACTCACTCGCTACCTTCCCAGCTTTTC TGTTGCTCAGTTGCTCTCCTCTACCCTCAACGTCATCCATTGGAACTGTCAGAGTTCACTAAGGTCTTTGTTGCCACAGTGTTTGGTTTTGCTGGTAGAG TCTCTTCTTCCTCTCTTCATGTTGAAGACTTCACTCACTCGCTACCTTCCCAGCTTTTCTGTTGCTCAGTTGCTCTCCTCTACCCTCAACGTCATCCATT GGAACTGTCAGAGTTCACTAAGGTCTTTGTTGCCAACAGTGTTTGGTTTTGCTGGTAGAGTCTCTTCTTCCTCTCTTCATGTTGAAGACTTCACTCACTC GCTACCTTCCCAGCTTTTCTGTTGCTCAGTTGCTCTCCTCTACCCTCTTATCTGTTCTGATTTCTGAGTCCCTATGTTCTGAGCTAGAATTATTGGGTTC TCAGTTTTCTATGCAGCTGCAAAACTTGACCAAGAAACAGAGGATGTGTCTTTCATTGAGTTTTCAGTTTCTAATATTTTGTTTTTATCTAGAGTGCATG CGAAGAAACTTAGTTGAGGTTGTTTTATTTCAATACTTTTAGAATTCATGACATATACAGATTCGACAAAGTTTAACGTTGACTATCGACTTCCTAACAT AACATTAATCTTTTATCTGGGCTTAGGATCGGCTATGTATAACATCAAGCATGCATTGGCAGGTCTGACTGTTGCTATAATAAGAGTTCATGGCTTATGT TTGTTTAAAATAGATTAAATAATGCTTTCAAAATGTTGCTACACTCGGGAGGGCTCACTGTTTCCATCACCAGAATTGCCCTATCATACCACACAATTGG GATTGGATTGGGCTGGAGTTGTCAGTTTTGTTTTTCTTTGGGGTTGGCAAGATTATCTTATTTTCCCATCCTTGTTATTACTTCGACCAGCAAAACTTTA AGATTTCCTGAGTGACTTGAGAAATTTTACTTCAGATCCCCTCCCCTCCCGCTTTTTTTTCCTAATGTTCCTCTTATGTGTATATGATCAGGGTGAGGCA CTTTTCCAGACACATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGAGTTTTAGGGCCACTACCTCCCCATATGGTTGTCCGGGCCGAGTAAGAGATTT TGGGTTCTCTTTGCTTTGAGAAATATTTATTGTATTCCATTTCCTGTGGATTCTCATGTAATGCCTGTTGTTGCAGTCGACGAGCTGATAACTATTTTAG AAGGGGCACACGGTTAGGTTGGCCGGATAGTTCAACTTCAAGAGAAAGCATGAGGGCAGTTTGGAAATTGCCTCGTTTGCCGAACCTTATAATGCAGCAC GTTGATCATTCTGCTGGTGATTTGATTGACCTCTTGCAAAGGCTCTTAAGGTATGACCCTACAGAAAGGATAAAAGCAAGGGAAGCATTAAGACACCCCT TCTTCTCAAGAGATACTAAAAGACATGGTTACCCTTTTTAAGTACCACAGACATTATAATCGCTTGGTGGAGAAAACACTGTTGAGAATGAATGTTGTAG CAACACAAATGCTTGAAATCCTTTGATTGTTTGCTCCACTGTATAGTGAAATGTATTTTGTTTTGTAATTGTGTTTGTTTTTTTTCACTCCCTTTTTCTT CTCATATTATTGGTGTTTGAGCAAGTAAATAAACCTCAGTTTTAACCACCTATCTGGTTGAAGTGGATTCATATCTTGTCCTCTTAGTATGATGATTGTT ATGGTGCGGTTGTTTTATACTTCTATGGTGTCAAATTAAGTTCAAAAGAATCATATTTGTAAAAGTATTATGATCATAATTGATATTTCTAGTTACTAGG TGTTTCAGAAAACTTGTT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_172068; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_454793
| Blastp | Serine/threonine-protein kinase AFC1 from Arabidopsis with 68.12% of identity |
|---|---|
| Blastx | Serine/threonine-protein kinase AFC1 from Arabidopsis with 65.12% of identity |
| Eggnog | CDC-like kinase(ENOG410XQF2) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT3G53570) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019444388.1) |
| Pfam | Protein kinase domain (PF00069.24) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |