Id Trinity | TRINITY_DN49772_c0_g4_i7 |
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Name Transcript | Ll_transcript_454825 |
Sequence | CAGCAATTTTGTTGTTACCAACTGAGTTTGACATTCCCAAACAGAGCATAACAAATTAACAATCGAACTGTAGGGCCCACTTCCTAACCATGAGTTTAGT AACGCTCCTTCATTCCGTTAACCACTTCCTTCTCTAGATCTCAACATTAGGGTTTTAAATTTGGGGCAAATTCCCAATTCACTACTAATCCGAGTTTTAT CACCGATGTTTGAATAATTTGAATTCAATCGAAGAATTCACACGTATCGTGACGAAGTTTATATGCAGATATAAATGGAGATGCAGAGAATTATCGAGTT TCACGATAGGATTATGGACAAGAGACCAAGGAAGAAGCCTCGTTTAACATGGGATATGCATCCACAACCACAACCACATCCTCCAATTCCTCCTACTAAG GTTCTTCCCACAATATATCACAACCAGGAGGTTGGGAATGGAGTGGCTCCAAATCATGCCTATCCTTCCATGTTTTTTCGAGGAATGACTCGTAATGGAT CACCCCCTTGGAGGCCTGATGATAAAGATGGTCACTATGTTTTTGCTGTCGGTGACAGTTTAACACCTCGATACAGAATTATCAGTAAAATGGGTGAAGG AACGTTTGGCCAAGTCTTGGAATGTTTTGACAATGAAAAGAAAGAAGCTGTGGCAATCAAAGTTGTTCGGTCCATAAGCAAGTATCGTGAGGCTGCAATG ATTGAAATTGATGTCTTGATGAGGCTAGCCAGACACGACATCAATGGTGCACGGTAAGAGTTATTTTTGGTTGTCTTTCATTGTTGATTGCACATGTTAA AAGCGACTCTGGTATAAATGGTTTCATTCTTTGCAGTTGTGTGCAAATTCGGAATTGGTTTGACTATCGTAATCATATTTGTATTGTAAGTATTTGTTGA TATTTGTAATTTGATTAAGATGATAGGAATGTCTATTCGGTCATGCTTAAATATTCTGGGAGTTAAAAAACTTGCGGATGGATTTAAATGGTTTCAACAG GTGTTTGAGAAGCTTGGACCAAGCTTATATGATTTTCTCCGCAAAAACAGCTACCGTTCCTTTCCCATTGATCTTGTTCGGGAGTTTGGCAGACAACTTT TGGAGTCTGTAGCATGTGTGTGGACATATCCTGTACCCACTACCAAATTATATATTTTTTATACATATTTATGCTCCTTCTCTGTTGGGAGTTTAAGACA TGTGCATATGTAATAACTCATTTGAATCTGGATAATATAATCTTTTGGTATTTGAAACAACCTAAACTATTATTGAGTCGATTTCAAATAAATTTTATTA TAATTGATTATGCGTTTAGGTTACTTATTATGCTACTCATATATGCAGTTATGCATGACTTGTGCTTGATTCACACTGATTTGAAGCCAGAGAATATTCT TCTAGTCTCATCAGAATTTATTAAAGTGCCTGATTACAAGGTATCATCTTCCTAACTATTCTCCTAGAATCCTTATTCAACTTGTAATTCACTTGTCAGT TAATGGAATTAACCTGTTGGTACTAGCAGTGGGTGTTAATATACTTTTGGACCGTGCAGTTGCATTTTTTCTTTTGTAAAAAATAGATAGTGAGATTAAT TCATATTCTAAATTTTAATAAGACAGATTCGGCAACCATGTAAGTTTTCATGCACTTATTCCTCACAATTCTCAAATATCAAAACTTTACATTTGTTCCT TTTTTGTTGGAAATTCTTTATTTGTGGCAATTCAGTTTCTATCACGGACCATGAGAGATGGCTCCTATTTCAAGAACCTACCCAAGTCTAGTGCCATTAA GCTCATTGATTTTGGGAGTACAACGTTTCAACATCAGGATCACAGTTATGTGGTATCAACAAGACACTATCGTGCACCAGAAGTTATCTTAGGTATTGGG TGGAACTACCCTTGTGATCTTTGGAGTATAGGCTGCATACTAGTTGAGCTTTGCTCTGTAAGTAATCATCAGTCTAAACCTTCTTTACTTTCCTTTACTT GTTATGCATGAAGGTTAGAATCACGGTTCCTTAGTAATATCATGCTGTAGCAAGCTCTATAGGATTAAGTGGTGACCCATGAATTCTTGCGCTACTCTGC GTTTCTAGCTTGGCAATTTTGATAAGGCGCTTGGACAATGCTACTATTTGTGTAATAGATATATTGCAACAGCATTTGCTAAGTCTGCCAACTGGAAAAT TATGAAAATTTGCTATTTTTTTATTTGAAGTCTTTCCTAAATCACTTCATCAATCCCCATCCTCCCTCAACGTCATCCATTGGAACTGTCAGAGTTCACT AAGGTCTTTGTTGCCAACAGTGTTTGGTTTTGCTGGTGGAGTCTCTTCTTCCTCTCTTCATGTTGAAGACTTCACTCACTCGCTACCTTCCCAGCTTTTC TGTTGCTCAGTTGCTCTCCTCTACCCTCAACGTCATCCATTGGAACTGTCAGAGTTCACTAAGGTCTTTGTTGCCACAGTGTTTGGTTTTGCTGGTAGAG TCTCTTCTTCCTCTCTTCATGTTGAAGACTTCACTCACTCGCTACCTTCCCAGCTTTTCTGTTGCTCAGTTGCTCTCCTCTACCCTCAACGTCATCCATT GGAACTGTCAGAGTTCACTAAGGTCTTTGTTGCCAACAGTGTTTGGTTTTGCTGGTAGAGTCTCTTCTTCCTCTCTTCATGTTGAAGACTTCACTCACTC GCTACCTTCCCAGCTTTTCTGTTGCTCAGTTGCTCTCCTCTACCCTCTTATCTGTTCTGATTTCTGAGTCCCTATGTTCTGAGCTAGAATTATTGGGTTC TCAGTTTTCTATGCAGCTGCAAAACTTGACCAAGAAACAGAGGATGTGTCTTTCATTGAGTTTTCAGTTTCTAATATTTTGTTTTTATCTAGAGTGCATG CGAAGAAACTTAGTTGAGGTTGTTTTATTTCAATACTTTTAGAATTCATGACATATACAGATTCGACAAAGTTTAACGTTGACTATCGACTTCCTAACAT AACATTAATCTTTTATCTGGGCTTAGGATCGGCTATGTATAACATCAAGCATGCATTGGCAGGTCTGACTGTTGCTATAATAAGAGTTCATGGCTTATGT TTGTTTAAAATAGATTAAATAATGCTTTCAAAATGTTGCTACACTCGGGAGGGCTCACTGTTTCCATCACCAGAATTGCCCTATCATACCACACAATTGG GATTGGATTGGGCTGGAGTTGTCAGTTTTGTTTTTCTTTGGGGTTGGCAAGATTATCTTATTTTCCCATCCTTGTTATTACTTCGACCAGCAAAACTTTA AGATTTCCTGAGTGACTTGAGAAATTTTACTTCAGATCCCCTCCCCTCCCGCTTTTTTTTCCTAATGTTCCTCTTATGTGTATATGATCAGGGTGAGGCA CTTTTCCAGACACATGAGAACTTGGAACATCTTGCCATGATGGAAAGAGTTTTAGGGCCACTACCTCCCCATATGGTTGTCCGGGCCGATCGACGAGCTG ATAAGTATTTTAGAAGGGGCACACGGTTAGGTTGGCCGGATAGTTCAACTTCAAGAGAAAGCATGAGGGCAGTTTGGAAATTGCCTCGTTTGCCGAACCT TATAATGCAGCACGTTGATCATTCTGCTGGTGATTTGATTGACCTCTTGCAAAGGCTCTTAAGGTATGACCCTACAGAAAGGATAAAAGCAAGGGAAGCA TTAAGACACCCCTTCTTCTCAAGAGATACTAAAAGACATGGTTACCCTTTTTAAGTACCACAGACATTATAATCGCTTGGTGGAGAAAACACTGTTGAGA ATGAATGTTGTAGCAACACAAATGCTTGAAATCCTTTGATTGTTTGCTCCACTGTATAGTGAAATGTATTTTGTTTTGTAATTGTGTTTGTTTTTTTTCA CTCCCTTTTTCTTCTCATATTATTGGTGTTTGAGCAAGTAAATAAACCTCAGTTTTAACCACCTATCTGGTTGAAGTGGATTCATATCTTGTCCTCTTAG TATGATGATTGTTATGGTGCGGTTGTTTTATACTTCTATGGTGTCAAATTAAGTTCAAAAGAATCATATTTGTAAAAGTATTATGATCATAATTGATATT TCTAGTTACTAGGTGTTTCAGAAAACTTGTT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_172068; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_454825
Blastp | Serine/threonine-protein kinase AFC1 from Arabidopsis with 68.12% of identity |
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Blastx | Serine/threonine-protein kinase AFC1 from Arabidopsis with 65.12% of identity |
Eggnog | CDC-like kinase(ENOG410XQF2) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G53570) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019444388.1) |
Pfam | Protein kinase domain (PF00069.24) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |