Ll_transcript_342150

Id TrinityTRINITY_DN49800_c1_g1_i11
Name TranscriptLl_transcript_342150
SequenceAGCGAGGATACTCTCTCTCTATTGTGTGTGTTTGTGTCAATTATCGCGACCCACATCGAGGTTGTCATTGGGGTTAGTTTATTTCCTTCAATTCTCTTAT CTTCATGTTGAAAACATTCAAATCCTCTTCCAATCTCACTTCACCCATGCTAATTCGTTTCAAAATCCAATCTTTTCTACTCTCCACTACTACACTTGAT AACAAGGATTTCATCAATGATAATACTATTGACACTGATTGGGAAAGATTGCTTCAACCTTTTGACCATAAACAACTCCTTAGGTCACTTCACCCCATTA GCCCAATTCAGCTCTCTAAATTATTGCAACTCCCACTAGATGTTCCTACCTCAATGGAACTGTTTCAAAAGGTTGGTGCCCAAAAGGGTTATTGCCACAC CTTCAATGTGTATCACATTTTAATTCATAAGCTTGGTGCTGTTGGGGAGTTTAAGATTATAGACAATTTGTTGAAACAAATGAAGCAAGAAAAAGTTGTG TTTAAAGAATCACTTTTTATTCTGATTATGAGATGTTATGGGAAAGCTGGGTTTCCTGGCCAAGCAACAAGGCTTTTGTTGGATATGTGGACTGTTTATT ATTGTTTCCCTACTTTTAAGTCCTACAATGTTGTTTTGGAAATTCTTGTTGCTGGAGATTGTCCTAGAGTTGCACCTAATGTGTTCTATGATATGCTTAG TAGAGGTATTTCTCCGACTGTGTATACATTTGGTGTGGTCATGAAAGCATTGTGTATGATTGATGAGGTTGATTCGGCTTGTTCGCTTCTAAGGGACATG ACAAAGCATGGCTGTGTTCCAAATTCTGTCATTTACCAAACCCTTATTCACGCACTTTCGCAAAACAATAGGGTGAACGAAGCGATGAAGCTTTTGGAGG AAATGTTTTTGATGGGCTGTGAACCTGATGCTCAGACCTTTAATGATGTTATTCATGGCTTCTGCAGGGCTGGTCGGATTCATGAAGCAGCCAAGCTGCT TGATCGAATGCTTCTTCGGGGGTTCAGCGCTGATGCTCTAACTTATGGGTTCTTAATGCATGCGTTGTGCACCAATGGGCAAATTGATGAAGCAAGGGCC TTGCTAGATAAAATTCCCAATCCGAATACTGTGCTCTATAACACATTAATAAATGGCTATGTGGCTAGTGGGCGGTTTGATGAAGCTAAGGATCTTTTGT ACAATAACATGGTAGTTACAGGCTATGAGCCAGATACCTTCACGTTTAACATACTGATCAGTGGACTTTGCAAGAAAGGGTTTTTGGTCTCTGCTCTTGA GTTCTTACATGAGATTGAAATGAAAGGATTTGAACCCAATGTGGTCACATACACCACATTGATAAATGGTTTCTGCAAGCAAGGTCGATTAGAGGATGCA GCTGAAGTTGTGAATAGCATGTCAGCCAAGGGTCTCAGTTTAAATACTGTGGGGTACAATTGCTTGATTAGTGCTCTTTGCAAAGATGGGAGGATTCAAG AAGCTTTGCATATGTTTGGTGAAATGTCAAGCAAAGGAAGTAAACCCGACATTTATACATTCAATTCCTTAATATATGGACTATGCAGGAATGGTGAGAT GGAAGAGGCCTTGGGTTTGTATCAGGACATGTTCGTGGAGGGTGTTATTGCCAACACTGTAACATACAACACACTCATTCATGCATTTCTCAGGAGAGAT TCAATCCAACAAGCGTTTAAGCTTGTTGATGAAATGCTATTCAGAGGGTGCCCTCTTGACAATATTACATATAATGGCCTTATCAAAGCTCTCTGTAAAA CCGGGGCAGTAGAAAAAGGATTGGGCTTGTTTGAAGAAATGCTTGGGAAAGGGATTTTTCCTAATGTTAGCTCTTGCAATATTCTGATCAACGCCTTCTG CAGAGTTGGAAAAGTAAACGACGCTCTTCAATTTCTCCGGGATATGATTCATCGTGGTTTGACACCAGACATAGTCACTTATAACTGCCTGATCAACGGT CTTTGCAAGATTGATCGTGTTCAAGAGGCTTTGAACCTTTTTAACAGGTTACAAGTTGAAGGAATCCATCCCGACGCAGTTACATACAACACACTGCTAA GTAGGCACTGCTATGAGGGTTTATCTGATGAGGCATGTTTACTTTTACATAAAGGTGTGGATAATGGTTTCATACCTAATGAAGTCACTTGGAATATATT GATATGTCATTTTGTGAAAGAAGGGGTCAAGGGGAGTAAAATATTCTTCTAGGGTTGTTATGGTGGAATAGAAAGCTGCTTTCCTTTGAAGCCAAAACAT TCCTTTCAGGTCTCTTTATTTTGCTCCTTGACCCCATTTGATTTGTGTCTTGGCTATCAATTTACTATTAGCATGGGGAATATGACTGCAGAATTTGAAT GATAAGTGAGTGGGGGCAACTAGTAATAGTGTTGATTCTTCAGAAAAAAACACCATCCTTCTCTGGATCTACCTTCTATACAACTAGAACTAGTTATAAC AACTTTGTAATATTAACATGTTCACTTTGAAATATTTGTTAAGCTTATGTGCAGCACTCTTCTCTTAAACATGTAAAGCAATAGGAAGAAGGGTCCTGGT TTAGAACATGGTTATGAAATTGAGATGCTAAATTAGCTCATCAATATTTTTCATCTGAGATCAAAGTCCATGTAGTCGATCCCACTTAGTAGGATAAATG TTTGGTTGTTGTTGTTGATTGATGAAGGATAAACACTTTACAAGAATCAATTGAAAAAATCAGCTTATTTGTGATTTTGAAGATATATTTTCTTAATCTT TGGATGAAAATATTTTGAAGGTTTTGCAGGCTATTTGGAGAGCAATAAGATATAATGGCTGCTAGGATACCTGGTTTAATTGCTTTATTTGATGTTGATG GAACTCTTACAGCTCCGAGGAAGGTGGTTACTCCAGAGATGTTAAAGTTCATGCAAGAACTACGGAAGGTTGTAACAATTGGAGTTGTTGGTGGATCCGA TTTTGTGAAGATATCTGAGCAACTTGGGAATACAGGTTAGCTATAACCAGTTATTTGGTTTCTGATACTGTCATGGTAAACCACTTTAAGAAAATTGATT TTAGATTCTCTTTGCATGAGTTAATTAATTCCTACCTTTACTTCTGTTCTTGTTCCTGTGTTGTGTATTCCAGCG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_172311; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_342150

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_342150
BlastpPentatricopeptide repeat-containing protein At5g64320, mitochondrial from Arabidopsis with 59.91% of identity
BlastxPentatricopeptide repeat-containing protein At5g64320, mitochondrial from Arabidopsis with 59.91% of identity
EggnogPentatricopeptide repeat-containing protein(ENOG410Z7Z7)
KeggLink to kegg annotations (AT5G64320)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_004508428.1)
PfamPPR repeat family (PF13041.5)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;