Ll_transcript_342789

• Id Trinity: TRINITY_DN49854_c2_g2_i11
• Name Transcript: Ll_transcript_342789
• Sequence: AATTATTAATGTCAACAACAACACCATTCATTAAAATGACTATAATACCCTTTCTGCCGTTTATGACATGTCCCTATATATAAACAAGAATTCCATTTTC ATATCACACACTCCCTCTTCCGTTTATCTCTCTTTATCTAAATACTTTTTCTATTTTCCCTCTTACAAATATTAGTATATTACCCATTACTCCGGGGTGT TGCTTTGGATTGGTTTTAAAAAAATAATAAAATGAGTGATCGTTTGGTGCTGTATGTGGACCGGTTGGTACGGCCGGTGCCGGTTGAGCCGTTGACTCAA CACCCGGCTCAGCCCTCTCCTGAGCCTTCGCCGTCAGTGGATGCTGTCGCCGTGGACAGCGACGGCGAGGCTGAGGAGCATCCGCTGTTGCAGATGGCGG AGTGTCGCATTTGTCAGGAAGAGGACAGCGTTAACAATCTAGAGTCACCATGCGGATGCAGCGGCAGCCTTAAGGTATATACATACATTCTTCGCTTCTA TCAATTTTTAAACTTTTTGTTTTATCATTTGGTATCATTGTGTGGTAAAAATATATTAATAAAGTGGGCTTTTTGTGTTGAAATGTTTTCTTCATGTGTT TGCCTTTGCTCTTTGTTTTAAGTTGCAATTGAATGTTCTACATAAACCGTGATAATGTGGTTGCCTTGTGGTGTGGCTAGCTCAATTCATGTATCAGTGA TGGATTAAGGTCAAGAAGAACCAGTGAAGGTTCTTCATTTTTTTTAAACAATAAAAGATCCTTTTTTTAATTCGCCGTAAAACTAATGATGCAGTGAAGG TCCATGATTATGTTTTCTTCATATGATATTGTGAACATCTAATGCTTCTGGATTACTGATTTTTCGAGGTGGCATTGTGAAGTGAATATGCAGTAGGCTA TATAATAATATACTAGGTGATGGAGATGGAGATGTTTATGTGAAACTGTTTATTTAGCCTACTGACTTGGTTTCCTGTTTTGAACTGTTAATGCTTAGAA TAAAGGAGTAGTCATCTAATTTTGCCTTTCTAATTCATGAACTGTTGGAACAAAATTTGCACAGTATGCTCACAGAAAGTGCATCCAGCATTGGTGCAAC GAGAAAGGTGACATAACATGTGAGATATGTCATAAGGTATGCTTCTTTTATATAAAACTCTCATTTCATAGTGTTATTATAAAAGGGTGGGGATAAGTTA CTCCAAGAATAACTCTTTTAGACTTACTTTTCATCTTAGCCATCAATTTCTTGGAAATCTAATGGTGTAGATCTATTCATTAATTCAAATCATTTGATGT ATCTAGAATTGATGGTTAAGATGAGGAGTAAGTCTAAAAGAGTTACTCTTGGAGTAACTTGATCCCTCCCCATTATAAAATGCAAGGATTGGTTGAGGTT GTTGATGGTCATGATTATCCTTACAAGTATAGCTTTGGAGAACAATAATTCCGTACAATGGTATATCTTCATTTGAGGTATATGATATAGCAATGGTATC ACAATCGGATAGCGCATAAGAGTCCTAGGCATGTGTGACAAATGGCTAAACGCAATTATGAAAAAATAATATTGCTTCTGAGATTCCCACATTGTCAAAG TAGAGGCATTGCATGTCTAGCTTGTTGCTAGGATTGGGATAAGGTGGAATATGGGATGCTAGCTAAAATATCCAAGATACTAAGAAATTTTAGATGCCTG ATATAAGGATGAATTCTGTGTAATGAATCCTTAACTTATTGTGAATCTTAGAATGGAAAAAACTGAGGGTAACAGGCTAATGTAAGTCATATGCACAATA TGTAAAATATGCTTTTAGGAAATTTAACATTTTGCATTGTTTGGTTGTAGTAGTCCACCCGTCACTGTTCAGGTTATTTGTGTCTTTTACATCTCGGGTT GGCGAACATTTATTTGGTTAACGTGGTTATCTTTGCCTCTTTGGATTGAACTTCTCTCTCTATCAGTCTCTCTCTCTCTTTGAGGTTGTCTTTCTCTCTA CTTAACGTTTTCCAGTTATATTAAGTTGTGTTTATCTTTGGTGGCAATTCTTTTTTCTCAGCCCTATCAACCTGGTTATACTGCCCCACCACCTTGTCCA CGTCCTGAAGAAACTACCATTGATATTGGGTAAGCTGGATTTTCTATTCAAAGTCTTTATTCAAGTAAGTTGTATCACTTCTATGTGTGTATGAGCATTC TTTCTATTTCAAACTCTTAAGGAATATTAGTTTGAAACTCTTGTCTGCCTCATAAATTATGACCATATTTGCAGTGGAGGTTGGAGAATCTCTGGCACAC CTTTGGACTTGCATGATCCTCGACTCTTGGCAATTGCAGAGGCAGAACGCCAATTCTTGGAAGCCGAATATGATGGATATGCTGCGTCTAATGCCAGTGG AGCTGCATTTTTCCGTTCAGCTGCTCTAATTGTAAGGCAGCAATCTTGAAGTCTTCTTCAACAAATTATTTGTGGAATTAGTCATATATATGAGCAGAGG ACATAATTTTTCTTGAGGTCATGCATAGTGTTGGGCAATTGATATATCTACAAAACTATCAACTTTTATGGACATTTATATTTCTTAATTATTTGGAATT TTAAAGAAAACAATTCACTTGCTCGGATCTTTACATTATTGATGAACATGCACCTCCGCATTTGTTCACTATTGTTTATGTCATCTATGCAAATCCAATA CTTTCACATGATTTAAGCTAACTCCATCAGTCCATTGTACTCGTTGCAGTTAATGGCACTTTTACTCTTGAGGCATGCACTTTTTGTCACGGATGCTGAT GTTGATGCTGAAGATGATCCATCCACTTTTTTCTCTCTTTTCTTGCTTCGAGCAGCTGGTTTTCTTTTGCCTTGCTATATCATGGCTTGGGCAATCAGTA TTTTGCAGCGTCGGCGACAAAGACAAGTCAGTTTCTATTTTTGTTCCAACTATTTTTGTGAATTCAGTACTGATTATTTTTGGGTAAATTATAATAAGGT CCCTTGAGGTTCAATTATACACATAGTATTCTCTTGTTTAAAAAAACATCAATCTCTTGAGAATTATGTTATATTATTATACTCACATTCCCTCAGATAT ATTGAGATTACATTTATATCTTCTAAAAGGGGAGGTGAGTAAATTTTTTAAACAAGAGCAGTGTTGAGTATAATTGAGTCAAACATCGTGGAAGGTCGAT ATAATTTCTCGTTTGTTTGTCTCAAATATTGCTACTTTGCTCTGTTATAGTTCATATCTATTAGTCGTATTGCTGGGAAGCTGCAATACATGCAAGTGTA TTTACCCATGATGTTCAGAAATTGTTATCATTTTCATGTTACCATGAAACAGGAGGCTGCTGCACTGGCTGCAACCCAAGTTGCTTTTGTTCTACAATCT GGGCATCGCAGGGGTTTACAATTTGCCATAGCACCAGGACCAACGATGGTGAATACACACCAGGAACAAGTGTAGTTTCTATGCAATTATGTATGTACCA ATAGAGGTAAGCCCCCATATAAGGAATGATTGTTCAAATGTTCATGATTTTCTCATTTCTAATGTACTTCCATACATTAGCATGTGCAACTTTAAGGTGG TGATTAATATTTTGGAATCCAGAGCCTTCAACAATTAACATCCTCATTTGTCGTATTAATAACTGCTTCGAGTCTTGGAAATTTGTTGTAGCAACAATGT AGAATTTACTAGGAATATCATTTCATGATAATAAGGTTGTACCTATGTTGTTTTGTTGACTACATAATCGTTATGATTGGAGCAAGCAAAGGGTGGGATT TTATCTTTGTTTTGCTTCCAAACAAATCAGTGTCACTATTGTGTTGTGCCAAAACGTTACTATTTATGAAGCTTGTAGATTGCAGATTTTGTTGTAATGA AGTTGATATTTCTATAGAATGTTGAACGCCTCAATGAGATGCACACATTATATACGCAGAAACACTGTTATTCATACACTTCATGAATTTTTGTTATATC TACCCCTCATAGTATGGATAATAAAATAATTTTTTTTTGGAGTATATGATTGTCACTCCCAAAGTATTGTTTATAGGAATCAAAATATTTAATTTAGTAT GATACTAGATCAGTAAAACCTTACATTCTAGATTATCACCTCGTTAGTTAGATTATATAAAAATGTTTCATACATTAATCATGGAAAGATTTAAAATAGT CACGTGATGTAACATTAAATCATTTAAAAATATAAATTGTCATCAAATAAGCCTATAAAGACTCCATGCATTAAATAAGCCTATAAAGACTCCATGCATT GCCATTTTAAAGTTTATTGCATGTATTTGGTGAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_172740;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_342789

FPKM

• PAB: 5
• PNAB: 0.2
• PS1: 1.8
• PS2: 0
• PS3: 0
• PW1: 3.6
• PW2: 1.9
• PW3: 0.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_342789

• Blastp: -
• Blastx: -
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0000254)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019445941.1)
• Pfam: RING-variant domain (PF12906.6)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;