Id Trinity | TRINITY_DN49854_c2_g2_i15 |
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Name Transcript | Ll_transcript_342793 |
Sequence | AATTATTAATGTCAACAACAACACCATTCATTAAAATGACTATAATACCCTTTCTGCCGTTTATGACATGTCCCTATATATAAACAAGAATTCCATTTTC ATATCACACACTCCCTCTTCCGTTTATCTCTCTTTATCTAAATACTTTTTCTATTTTCCCTCTTACAAATATTAGTATATTACCCATTACTCCGGGGTGT TGCTTTGGATTGGTTTTAAAAAAATAATAAAATGAGTGATCGTTTGGTGCTGTATGTGGACCGGTTGGTACGGCCGGTGCCGGTTGAGCCGTTGACTCAA CACCCGGCTCAGCCCTCTCCTGAGCCTTCGCCGTCAGTGGATGCTGTCGCCGTGGACAGCGACGGCGAGGCTGAGGAGCATCCGCTGTTGCAGATGGCGG AGTGTCGCATTTGTCAGGAAGAGGACAGCGTTAACAATCTAGAGTCACCATGCGGATGCAGCGGCAGCCTTAAGGTATATACATACATTCTTCGCTTCTA TCAATTTTTAAACTTTTTGTTTTATCATTTGGTATCATTGTGTGGTAAAAATATATTAATAAAGTGGGCTTTTTGTGTTGAAATGTTTTCTTCATGTGTT TGCCTTTGCTCTTTGTTTTAAGTTGCAATTGAATGTTCTACATAAACCGTGATAATGTGGTTGCCTTGTGGTGTGGCTAGCTCAATTCATGTATCAGTGA TGGATTAAGGTCAAGAAGAACCAGTGAAGGTTCTTCATTTTTTTTAAACAATAAAAGATCCTTTTTTTAATTCGCCGTAAAACTAATGATGCAGTGAAGG TCCATGATTATGTTTTCTTCATATGATATTGTGAACATCTAATGCTTCTGGATTACTGATTTTTCGAGGTGGCATTGTGAAGTGAATATGCAGTAGGCTA TATAATAATATACTAGGTGATGGAGATGGAGATGTTTATGTGAAACTGTTTATTTAGCCTACTGACTTGGTTTCCTGTTTTGAACTGTTAATGCTTAGAA TAAAGGAGTAGTCATCTAATTTTGCCTTTCTAATTCATGAACTGTTGGAACAAAATTTGCACAGTATGCTCACAGAAAGTGCATCCAGCATTGGTGCAAC GAGAAAGGTGACATAACATGTGAGATATGTCATAAGGTATGCTTCTTTTATATAAAACTCTCATTTCATAGTGTTATTATAAAAGGGTGGGGATAAGTTA CTCCAAGAATAACTCTTTTAGACTTACTTTTCATCTTAGCCATCAATTTCTTGGAAATCTAATGGTGTAGATCTATTCATTAATTCAAATCATTTGATGT ATCTAGAATTGATGGTTAAGATGAGGAGTAAGTCTAAAAGAGTTACTCTTGGAGTAACTTGATCCCTCCCCATTATAAAATGCAAGGATTGGTTGAGGTT GTTGATGGTCATGATTATCCTTACAAGTATAGCTTTGGAGAACAATAATTCCGTACAATGGTATATCTTCATTTGAGGTATATGATATAGCAATGGTATC ACAATCGGATAGCGCATAAGAGTCCTAGGCATGTGTGACAAATGGCTAAACGCAATTATGAAAAAATAATATTGCTTCTGAGATTCCCACATTGTCAAAG TAGAGGCATTGCATGTCTAGCTTGTTGCTAGGATTGGGATAAGGTGGAATATGGGATGCTAGCTAAAATATCCAAGATACTAAGAAATTTTAGATGCCTG ATATAAGGATGAATTCTGTGTAATGAATCCTTAACTTATTGTGAATCTTAGAATGGAAAAAACTGAGGGTAACAGGCTAATGTAAGTCATATGCACAATA TGTAAAATATGCTTTTAGGAAATTTAACATTTTGCATTGTTTGGTTGTAGTAGTCCACCCGTCACTGTTCAGGTTATTTGTGTCTTTTACATCTCGGGTT GGCGAACATTTATTTGGTTAACGTGGTTATCTTTGCCTCTTTGGATTGAACTTCTCTCTCTATCAGTCTCTCTCTCTCTTTGAGGTTGTCTTTCTCTCTA CTTAACGTTTTCCAGTTATATTAAGTTGTGTTTATCTTTGGTGGCAATTCTTTTTTCTCAGCCCTATCAACCTGGTTATACTGCCCCACCACCTTGTCCA CGTCCTGAAGAAACTACCATCGATATTGTGTAAGCTCAATAAGCTGAATTTTCTATTTTTAAAATAGTCTTTATTCGAGCATGTTAGTTCTATCATTCTA TATATGTATGTATAAGCCTTCTTTCTATTTCATACTCTTGGGGATATTAGTTTGAAACTCTTGTCTCCCCCATAATTTATGACCATATTTGCAGTGGAGG CTGGACAATCTCTGGCACACCTTTGGACTTGCATGATCCTCGACTCTTGGCGATTGCAGAGGCAGAACGGCAATTCTTGGAAGCCGAATATGATGGATAT GCTTCCTCTAATGCCAGTGGAGCTGCATTCTGCCGTTCAGCTGCTCTAATTGTAATTCATAAATCTTGAAGTCTTTTTAATAAGTTATTTGTGGAATTAG TCAAATATATGAGCAGCGGACATAAGTATTCTTAAGGCCATGCATAGTGTTATACAATTGATATATCTACAAAACTATCATGTTTTATGGACATTTATAT TTCATAGTTATTTGGAATTTTATGGAAAACAATTTCACTTGCTGTGTGATCTTTACATTATTGATGAACATGCACATCTTCATTTGTTCACCATTGTTTA TGTCATCTATGCAAATTGCATATATTCTTTGCTAACACTTTGACATGAATTAAGCTTACTCCATTCTATCTGTTGCAGTTAATGGCACTTTTACTCTTGA GGCATGCACTTTTTGTCACGGATGCTGATGTTGATGCTGAAGATGATCCATCCACTTTTTTCTCTCTTTTCTTGCTTCGAGCAGCTGGTTTTCTTTTGCC TTGCTATATCATGGCTTGGGCAATCAGTATTTTGCAGCGTCGGCGACAAAGACAAGTCAGTTTCTATTTTTGTTCCAACTATTTTTGTGAATTCAGTACT GATTATTTTTGGGTAAATTATAATAAGGTCCCTTGAGGTTCAATTATACACATAGTATTCTCTTGTTTAAAAAAACATCAATCTCTTGAGAATTATGTTA TATTATTATACTCACATTCCCTCAGATATATTGAGATTACATTTATATCTTCTAAAAGGGGAGGTGAGTAAATTTTTTAAACAAGAGCAGTGTTGAGTAT AATTGAGTCAAACATCGTGGAAGGTCGATATAATTTCTCGTTTGTTTGTCTCAAATATTGCTACTTTGCTCTGTTATAGTTCATATCTATTAGTCGTATT GCTGGGAAGCTGCAATACATGCAAGTGTATTTACCCATGATGTTCAGAAATTGTTATCATTTTCATGTTACCATGAAACAGGAGGCTGCTGCACTGGCTG CAACCCAAGTTGCTTTTGTTCTACAATCTGGGCATCGCAGGGGTTTACAATTTGCCATAGCACCAGGACCAACGATGGTGAATACACACCAGGAACAAGT GTAGTTTCTATGCAATTATGTATGTACCAATAGAGGTAAGCCCCCATATAAGGAATGATTGTTCAAATGTTCATGATTTTCTCATTTCTAATGTACTTCC ATACATTAGCATGTGCAACTTTAAGGTGGTGATTAATATTTTGGAATCCAGAGCCTTCAACAATTAACATCCTCATTTGTCGTATTAATAACTGCTTCGA GTCTTGGAAATTTGTTGTAGCAACAATGTAGAATTTACTAGGAATATCATTTCATGATAATAAGGTTGTACCTATGTTGTTTTGTTGACTACATAATCGT TATGATTGGAGCAAGCAAAGGGTGGGATTTTATCTTTGTTTTGCTTCCAAACAAATCAGTGTCACTATTGTGTTGTGCCAAAACGTTACTATTTATGAAG CTTGTAGATTGCAGATTTTGTTGTAATGAAGTTGATATTTCTATAGAATGTTGAACGCCTCAATGAGATGCACACATTATATACGCAGAAACACTGTTAT TCATACACTTCATGAATTTTTGTTATATCTACCCCTCATAGTATGGATAATAAAATAATTTTTTTTTGGAGTATATGATTGTCACTCCCAAAGTATTGTT TATAGGAATCAAAATATTTAATTTAGTATGATACTAGATCAGTAAAACCTTACATTCTAGATTATCACCTCGTTAGTTAGATTATATAAAAATGTTTCAT ACATTAATCATGGAAAGATTTAAAATAGTCACGTGATGTAACATTAAATCATTTAAAAATATAAATTGTCATCAAATAAGCCTATAAAGACTCCATGCAT TAAATAAGCCTATAAAGACTCCATGCATTGCCATTTTAAAGTTTATTGCATGTATTTGGTGAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_172740; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_342793
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000254) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019445941.1) |
Pfam | RING-variant domain (PF12906.6) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |