Id Trinity | TRINITY_DN49906_c0_g1_i13 |
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Name Transcript | Ll_transcript_457031 |
Sequence | CACCTACAACACTTTTTGGTACCTAACTTTTTAGTGATTTTATTGTAATTTTTAATCTTATATTTGAATTTGTGGATTCAAGGTTGTTAGAGGTGGTAGA AGGGTTGAGATCTCAATATATGATATTGTTGTTGGTGATGTTATACCACTTAATATTGGTAACCAGGTCCCTGCTGATGGAATCCTGATTACTGGTCACT CTCTTTCAATTGATGAATCAAGTATGACTGGTGAGAGCAAAATTGTCCATAAGGATTCTAAGGACCCTTTTCTGATGTCTGGATGTAAAGTTGCAGATGG CAGTGGCACCATGCTTGTAACCGGTGTTGGTATTAATACTGAATGGGGGCTTCTAATGGCTAGCATTTCAGAAGACAGTGGTGAAGAAACACCTTTGCAG GTCCGCCTAAATGGTGTAGCCACCTTCATTGGTATTGTTGGACTTTCTGTTGCTTCTGTTGTCCTTATTGTGCTACTGGCCAGATATTTCTCTGGGCATA CTAAAAACCCAGATGGTAGTGTTCAATTTAAAGCAGGAAAGACTAAAGTTGGTGATGCTATTGATGGAGCAATAAAGATAGTAACTGTTGCGGTCACCAT TGTCGTTGTTGCAGTTCCTGAAGGGCTTCCCTTAGCAGTGACCTTAACACTGGCCTACTCAATGAGAAAAATGATGGCTGATAAAGCTTTGGTGAGGAGG CTTTCTGCCTGTGAGACAATGGGCTCTGCCACAACCATTTGCAGTGATAAGACTGGCACATTGACCATGAATCAGATGACAGTGGTCGAGGCTTATGCTG GTGGGAAAAAGATTGATCCTCCTCACAACAAGTCAGAGCTCTCTCCTATGCTTCACTCTTTGCTCATTGAAGGTGTTGCACAGAATACCAACGGCAGTGT TTATGTACCCGAGGTTGGTAATGATGTCGAGGTTTCTGGATCACCAACAGAAAAGGCAATTTTACATTGGGCACTAAAGCTTGGGATGAATTTTACGGAA GCTAGATCACAATCATCTATCGTACATGTCTTTCCTTTCAATTCAGAGAAAAAACGAGGCGGAGTTGCAATACAGACGGCCAACTCTGAAGTCCACATAC ATTGGAAAGGTGCTGCTGAGATAGTCCTAGCTTGCTGTACATCGTATATTGATGCAAATGAGCAGTTGGTGGAGATGGATGAGGAGAAGATGACATTTTA CAAAAAAGCTATTGAAGACATGGCTTCTGATAGTCTACGTTGTGTTGCCATTGCATATAGACCATATGAAAAGGAGAGTGTTCCAACTAGTGAAGAACTA CTTGCTCATTGGTCTTTACCGGAGGATAATCTTGTTTTACTTGCTATTGTTGGTCTTAAGGATCCTTGTCGACCTGGTGTCAAAGATGCAGTGCAGCTTT GCCAAAAAGCTGGGGTTAAGGTTAAAATGGTGACTGGTGACAATGTCAAAACTGCAAAAGCTATTGCTGTGGAATGTGGTATACTTGCTTCATTTGCTGA TGCCACTGAGCCAACCATCATTGAAGGGAAAACATTTCGTGCCTTGTCAGATGCCCAGAGAGAAGAAATTGCTGAAGCGATATCGGTTATGGGACGATCA TCTCCTAATGACAAGCTCTTGCTTGTGCAAGCATTGAGGAGGAAGGGACATGTTGTGGCTGTAACTGGGGATGGAACAAATGATGCTCCTGCACTTCATG AGGTTTGAATAGCATCTCATGCTTTTTGTGCGTGTGATTAAGCTTGTGTTATTTTAGTTTTGACAATATTTTAATGGTACACTGGGTGAGTATAGCTATG CAACTGCTGTCTATTATATTTTTGTAGTGTGCTGATCTTATATGATCTTATGATGACAAGTCCTTATGTGGAATGATTCTGTTGAATATTATCATGGTTT TGTAATTTAAAAGTTTGAACTTATTAATTACTACTATTCCAGTGCAGGAATATTTGTTGTAGTGAAGTAAACAAGTTTTTTTTAATTGTTATTTTCTGAT TGTGTTTTTAAATTCTTTCTATTCTGAATATAGGCCGATATTGGTCTTGCAATGGGTATTCAAGGTACAGAAGTTGCCAAAGAGAGCTCTGATATCATTA TTTTGGATGACAATTTTGCTTCAGTTGTGAAGGTTAGTTCTCTTTAGTTTTAACTGTTAAATTGTGGAGATTTGGTTCATTGTTAATGAATAGTTCATGT TTAACACTGACCTGGAAGAACTATTTTTGGCCCTACAACTCTACAAGAAGTAGAAATGGAGAACTACAAGTTTTTTGATACTTACTATTTTATGGGTAGT CTATATATTGAGGTGCGCTGCTTAGCTTTGGATATTATTTTATCCGAGCTGGAAATAAATTGATATCTGAAGTAGTGGTGGCAATGACTTCCAGTTTTCT CCAAAAAATGTAGGTTGTCAGATGGGGGCGGTCTGTGTATGCCAATATTCAGAAATTTATCCAGTTTCAGCTTACTGTCAATGTGGCAGCTCTTGTTATA AATGTTGTTGCTGCAATTTCCTCTGGTGATGTCCCACTGAATGCAGTCCAGCTCCTTTGGGTTAACCTTATTATGGATACTTTGGGTGCACTAGCCTTGG CTACTGAACCACCAACTGATCACCTCATGGATCGTCCTCCAGTGGGTCGAAGAGAACCTCTCATAACAAATATCATGTGGAGAAATTTATTGATACAGGC TATGTACCAAGTGTCTGTATTGCTTGTTCTCAATTTCCGAGGTGTGAGCATTCTGAGATTGGGCCATGAGAAGCATGACCATGCCATCAAAGTAAAAAAC ACTTTGATCTTCAATGCATTTGTTTTCTCTCAAGTAAGCCCTTATCTTCACCCTTTAATTAATGGGAAAATATAGAATTCTCAGCTTAGTGATGCGATTT CATATGTCATATTAATTTTCTTTGTTTTGTGTTTATGGGGACTTGGGGTGGGAAGGGGGAATACATGCTTGTAACTAAAAGTATATAAATGCGGGGAAAA TTCAAGGTGGAATCATGACCTTACTTATTTGTCTCACACTAGGGTTTTCTGATTAAAAGCTCTATTACAAATTTAATTTAATTTGATTCGAGAAAAAAAA AGTTATCGTGTTTAAGGAAGAAAATTTGTTATCATTTTCATCCTCTTCATTTTCTATTATAGTAGCGGTTTAACACGTATGATATTCATGATTACCGATT ATCTTCTGAACTACTAATAGGTATGCATGATTGTACAAATA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_173176; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_457031
Blastp | Calcium-transporting ATPase 8, plasma membrane-type from Arabidopsis with 74.29% of identity |
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Blastx | Calcium-transporting ATPase 8, plasma membrane-type from Arabidopsis with 75.32% of identity |
Eggnog | ATPase, Ca transporting, plasma membrane(ENOG410XNNC) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G57110) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019431135.1) |
Pfam | E1-E2 ATPase (PF00122.19) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |