Ll_transcript_457683

Id TrinityTRINITY_DN49915_c1_g1_i4
Name TranscriptLl_transcript_457683
SequenceCCCTGAACAGAGGTTCTCATTTCCCAACAACAATGGCGATTTCCCTAAATTTCTAAAACCCTAAAACCCTCTTTTTCTCTGAATTCGCCATGAACTTCGA TCCTTCCTCCGCTTCATCATCACAAGCTCTCAACACTATAAAGGAAATTTCATCTTCCTCGCGAAACATTCCTTCCGACAAGGACTTCAAATTATGCTAC ACCTCCGACGAGTTCAAACGCCCTATCGATGAAATCGCCAGAAAATCGAACTCAATGTTGCAAAAAATCGGCGCCGCGAAGCATATTTGGGGCTCGGAGG AAGCTGGTTTTCCCGTCGGAATCGACGACGCGTATGAATGGCTTGTTGATGTGAATCAAGAGGTTTTTGGACGGGTTGATGAGTCGATTAAGGAGTTGCA GAAGATTATGAAGTTTGAGGATGATGAAATGGAATTGGAAAATGGGAAGAAGAAAAAGATGAAGAAAGTGAAAGTGGAAACTAAGGATAAGGAGAAAGTT TCGTTTCATATATCGGCGATTGAGAAGCCTCAGAATAAGTATAACTTTTTGGTTAATAATGCAAACCAACCTTTTCAGCATGTTTGGTTGGAGAGGAGTG ATGATGATCAGAGGTTTATTCATCCATTGGTTGGTTTCACTGAACATGGATTTGTTGATATGTTATGTTGAAATTATGTTGCCTTTTGAGTTTTAACGAT TTTAATGTGTTGTTTTAATTTTAATTAATGTTTACTTTGCTAGTTTATCATTATAATGTTGGTGTTCTGGGAAACTCTTCCTGCATGTTTCTTTTTTTAT GTCTTTCTTCTTTTGCACTCTTTGTAATTCTTTCTCTACGTCTTGATTAAAAGGTTATTTAAAAATAATGGGTTCAGAGGTGGAAAAGTTTTTGGTATTT ATTTGTGAAGTTAATTCATGGTATAGGAAAATAAATGCATATTTCTAATGAGTTGGTCAAGCAAGTAAGCAACTTCTACTGGTGCCATGGTCGTATTGAT GTTTTGACTTCTTTTTTAGTTCTCTGGCATGTGTGATATAATGTTCAAATTGTTAACTGTTGATTTTGCTCTTTAAGATAGACTTCACTGTTCTTTGGTG TATAACTGTATTTGTCTGGAACTCTGGATAGGCCTCAATGGCTTCTTTTGTTAAAAAAATATTATTAGAATAGAAAGGCCTCAATGACTCGTTTTCTACC TTAGACATCATTTGGGATAGGGTTATACTGCATGCACACACACATGCTTACCGACATGTAAATGCAACATGAATGTCAGTACTATTTACTATCCATGATG TTGTTAGAAATTAAGAATTTGAATGGAAGGAAAATTGTGGTTTGATATGGACATTGTTTATCCTTGAATATACTTCTCCTTTCAATCAAGAGGAGATAAT GATGCAAGTTGAATGGGGTATGCCTTACTCCTCCTCCTGAACTTCACACTGACTGTTTTATCATTTTGCCACCCTTTTTATCCTTTTCAGTTGTAATATT GTATGTCCTTTAACAGTCGTGAGTCTTTGTGGATTTAACAAGCCTTAATGAAATTGTCTTTCTTACACATTAATTACGGAGTCCTTTTTTGGTATTAAAT CTTGATACTGGCAGAAGTACCCTTTTTGTTCTGAACTTGTTTTGCATTAGTAATCTACAGTTCTACTTTTATATTTCTTCCATTAGTATGAGTGTGTGAT AGCAAAAATTTTTCAGAATTTTGCTTGTGTTCAGTTGGGTTGTCTTTATTTTATCGTGTAATTAATTAATTATTTTTCAGGAGAAACTCTCTGTTTTAGA TTTTGTTGATAAAGATGTTGAGGATCTTGTGCCAATAGAACCCCCCTCATTAGAAAGCACCCCTTTCAAGCTTGTGGAAGAAGTCAAAGGATTGAAGGAG TTGGCTGCTAAGCTTCATTCCGTTAATGAATTTGCGGTGGATTTGGAACATAATCATTATCGGTCTTTTCAAGGTTTGACTTGCTTGATGCAAATCTCAA CAAGGACTGAAGATTTTATTGTAGATACCCTGAAGCTTCGCGTTCATGTTGGACCTTACCTGAGGGAACTCTTCAAGGATCCTACCAAGAAGAAAGTCAG ATGCTCATGATTGATGTTTCTTTTCATTCAACAGAGTTGTTTCTTTTCTCTTGATCATATTTATGGTTAATTAGGTCATGCATGGAGCAGATTCAGATAT TGTGTGGTTGCAACGAGATTTTGGCATTTACGTTTGTAATTTGTTTGACACTGGCCAGGTTTGTTTGAGAAGCTCTGGATATTCAATATTGAAGTTAATT CCCTGATTAATTATCAAGGAAAGAAAATTCTATAATGAAAAATATAGTTGTTATTCAATATTGTTTAAAATAATTGATCTGATCAGTCTTTGGGTGATAA GGTATGTCTGTTTGCTGCAGTCTTGTAGAAAATGCTTGAAATGCGCCCCATCATGATGTCCATGTGGCTTTGCTTTTGATTGAGCTTTTGCTTGCTATTC TGATTTAATGACTGTGGAGTTTCTGTAAAAAAATCTTTTCATTTTGGTATAACCGGAAAGCTTTCCAGGGTTTATATTTTCATGCAATGTATGTGTTGAT CTGTTCTGTGGCATTAGAAATGTTGAAACAAACTTTCAAGTTCTTCCGATGTAGATTGTCCTTGTCATAATCTATCCTGCATGCATGTTAGGAATTTATT TTATAATCTTGTTTTTTTATCAAACAAGACTAATATATATTTTTATTGCATTGTTCAGGCTTCAAGAGTGTTAAAATTGGAGAGATTTAGCTTGCAATAT CTTTTGCTTCACTATTGTGGGGTTACTGCAAACAAAGAATACCAGAAAGCAGATTGGAGACTACGGCCTCTACCCGATGTCATGCTGAGGTGCAATTTTT TCCAAGCGTGTCATATTTCATCCTTTTTTATTCTCGTGGTTGTTTCCTTTTCTTATCTTTTATTCTTTATTTACTACTGGCTTTTTAATGTGTATTTTAG CCTCGACTAATAATCGCAGGGTATATAACCTAGATTTCCGGGTATGGGTTTGATTGGTTATTTTAGTTACCATTTTCATCGTACATGGAAGCATTTCACT TAAGACTAAAGAATTTCATATATATTTAAGTAGAACCAGCCATGATCATACATATAGATACAGGAATATGTTTCATAATGAAGCTTCTATTCTTTAGGTA GCATCTTCAACACTCAAGGATTTGTGAGCTAGTGGCTTGGATGTGAGCATCCGAGTTAACTAAGAGGTTTTGTTCATATGGGGTTCTATTCTGAAAAGTT ATGACAATTTGTCATTCATATGGGATTCATTCTCATTCTAGAAAAGTTAGTAAATAATTTCCTTGTAACAACTTGGCTGCTTGCTAATAATGAAGTCACC ATGATGGATATGAAATGGGAATCATGGGGTGTGACTTGTGAGAAAGGAATATGTGGATTATGGAAATAAAGTATATTTGTGCTTATGGAAATTAGTTGTA AGATGTATGTTGAGTATTAATTAAAATATATTTTGTTATTTCTATTTGAAATTTGGACTACTTGACTATCAAGTTGGGTTATTTTTTATTGATAGTAGAG TTTCACTGTTTACTTGTTCTCTTAGATACTGAGCCTATGTATTGGAAATATGATTACTATTTAGTTATTTCTGATTCCCTCCTTTCCATCTTTAGACTTT CCTTCCGTAATCTTTCTTCCTAGTGTCTTTTCCTTTTCCTCTACTGTGTCTATTTGACCCAAGGCACATCTTACATTGGATTATTTTCAGAATTATACCT ACAGTGTGAAAAAAATGGACTAGTTACAAGAATTGGTGATTTCTACTGTTATAACAAATCTCTGTATAAATTATAATTCCTCCTTGTCTCTCTTCCCTTA ATAAAATGAAAAACCAGAACAGTAGTCGAACATTTGAGCTCGTTCTTTTTTATTCATTTGTGAGTTTTGATTGTAAGCCTAAGGTCTTATGCGGTAATTG ATTGTTAGAGGGTGAGCCTCGGCACAACGGTAAGGTTGCTTGCCTTGTGACTGGAAGGTCATAGGTTCTAAACCCGG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_173247; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_457683

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_457683

BlastpProtein RRP6-like 2 from Arabidopsis with 43% of identity
BlastxProtein RRP6-like 2 from Arabidopsis with 78.3% of identity
EggnogExonuclease involved in the 3' processing of various precursor tRNAs. Initiates hydrolysis at the 3'-terminus of an RNA molecule and releases 5'-mononucleotides (By similarity)(COG0349)
KeggLink to kegg annotations (AT5G35910)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019458438.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;