Id Trinity | TRINITY_DN49956_c4_g1_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_456139 |
Sequence | CACCCACAAAGAAAAATAGCTTCCATAATAACAAAAACAACAAAATTAAAATATTCTCTCCCCTTTTTTCTCTTTGCTCTTCCTTCATTCCTTGTCCCTT CTATATATATATAACATTTTCTTCACTTCCCTTATCATTTATCATTTTCCTTTCTCATCTCATTTTTATCAATGCATTGTTCTGCTTCTCTTTTCTTTTG ATTAAGAAGCAGAACATAATTTTATATTGTTTTTTCATACATGTGTGTTTGGTTCAAGACAACATAAAATCTTGTTCCTTTAACAAACTCTAGTCCTATT CTCATTGTGGTTTATAGATATATAGAACCTTGTTTGGTTTTGTGAAAAGCAAAAAAAAAAAAGTTTTGTATTTTATGATCTAGCATTGTTTTATCTTTGT GGGTTTTAAGCTATAGTTACTAACATTTCATATTCTATACCATAAAGAAAAAAATATTCCTTTTTCTTTAACCAAAGTTTGTTCTTATAAACCCTTTTTC TATATAATCTTGGTTCTACTTATTAGCTTCCAATTCATTCATTGAATTCCCTATCTTTGGAAGAACATTTTCTAATGGATCAACTTTCTTCTTCTACTAC TATTCTTCCTGAAGCATTTCATGGGGCCAAAGATGATATTACTATGCAAATTTCTTTGATTTGGAGCCAAATCAAAGCACCATTGATTGTCCCTTTACTA AGAATATCAGTGGTTTTGTGCTTATGCATGTCTGTGATGATGCTTATAGAGAGGGTTTATATGGGAATTGTGATTAGTTTGGTGAAGTTATTTGGTAGAA AACCTGAGAAACGTTATAAATGGGAGCCAATGAAAGATGATGTTGAGTTAGGAAACTCTTCTTATCCAATGGTCCTTGTTCAAGTCCCTATGTACAATGA AAGAGAGGTTTATCAACTATCAATTGGTGCTGCATGTGGCCTTTCTTGGCCTTCAGATAGGATCATCATACAAATCCTTGATGATTCCACTGACCCAACA ATCAAGGAGTTGGTGCAACTAGAATGCCAAAGATGGGCAAGCAAAGGAGTGAACATAAAGTATGAGGTAAGGGACAATAGAAATGGGTACAAAGCAGGGG CACTAAAAGAAGGAATGAAGCGTAGCTATGTTAAGCAATGTGATTATGTTGCTATATTTGATGCTGATTTTCAACCAGAGCCTGATTACTTATGGCGCAC CATTCCTTTCCTTGTTCATAATCATGAACTAGCCCTCATTCAAGCTCGTTGGAAATTTGGTGAGTTATTAAACATTTCATGAACTTTGTTTAACTTTTAT TACAAAATTAGTTTAATCGAGTGTTTTACAATTCATCTTTCGTGTAATATTTACTTTAGATAGAGTCGGCTATATAAGTAGAACAATATCGAACGATAAT TATATTTTGCTTAACTTAGGTTGTTGTTGGATTCTCTAATGTAATTTAGAGTGTTGGAATCTCTTAATGGTGGCTATCTTAGGATTATTGGAATGTCTTA GGTAAGTTAATTAATAAATCCTAAAAAGAGAGGATGGTTTTAAAATGTGTCGGTGGGTAGTTTTTATTTGGAAAATTTGAGTTTGGTTAGGGTAGCAAGG TCCCACTTTATGGTTCAACGACCAAGCAAATATCACAGCCTAGAAGCACTTCAAACCTTCATGATTGCCTTAGATTTAAGCCACGTATCCCTTCTCTTAT GGTTCTTTTTTGTAACTTTTGTGCCTATGGGACCCACCTATTTACTCTTCCCACCAAAATATTACACATATAACATGTCTCATTTTCTATCCCAACTAAT AAAAATGAGAATGAATCATCTCCATTAGAGACAAGTATTATATAATAAAACATAAAAATACACTTTTAATATTTTATTTATTATAAAATCACATTTTTTA TCAGTAAAAATATGAGGAAAAATAACCACTCACCTTTCCATTAATCAAGAAGATCCTTACTCAATAAAAATATGTCAGTCCATTAAAAAAATTAAATATT AATTATTATTTTTATATATGTTTCATTATCACCGGTATGAGATAATATATGGCAGAAAATCTAGAACATATGATATATCTTAAATATTAGAAGGCAAAAA AATGAGGGTTATTTTTGGTGTAATTTACCTCCTTAGATTTTTCTTTACTAAATTTCATTTGTTTGGTCTCTTTTGTATTATGATATGTTATTAACCATGA TATTAAAATCATGGCTTTCGTGTATATTGTCCTACCTAAATCCTCATCATTCATTTATAGCAGAAATAAGGTATGGTTGTGCCATTGTGTGGCAGAAAAT TTAGATAAATATTGTACCACTATTTATTAGGGAATAGGTAAATATATTTGGAGTAAAGGGCATGAACCCAATAAATGAAAAATGTATATACCAATAAGAG TTTTTCTATTATATTTGTCTTGAATATATAGATAATATAAATGGTGAATGATTATATTTGTCTGCTTTGTCCTTACACTGTTTTAGGTAGGAAATTGAAT ATAAAATATGCATGTCCAAATCCAAAATTTTTTGTTATTAGTAATTTCTGTGACAAAAGCAGAACATAAAATATGCATGTATGTTTTAATTTAAAGGGTA TCTATGTCTTATGACTTATGAGAATAACACAGTTGTTGTTGGGAATAGCATTATGGGGACAAAGATTATATGTCCCGAAGAGAATAATAATTTTTATTAT TTTTTGTTTTTAACTTTTTTATTCTTGTATTAATACGTAATTGGTTTGGGACAAGATATAAGATACTATCCAGACAGAAATCCACATAGGTATTATTGTG GTAGTTGATGTCATAATTGTTGTTCTTATTGTGTTCTAGTGCTTCCTTTTTAACTCTACTTTCTCTAACACTACTACTTCTGCCAATTGCATGTGCAATT TTAATAGTGGACCTAATTGCTTATGTCTCAGTCACTGTCTACCCCAACTAACCGACAAACTGAATTTATTTCCAACTATCTTTTTCACCTTATGTCTTTT GTCTCGAATTTCACACTAATACAAACATAATATTTAATTAAAAAATTTAAATATTTTTTATTATTTTGTTTTTTTTCGTTATTATTATAATAAATAATAT TTGAGATATGATCTGGGACAGCTGAAATATTTACGAGAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_173537; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_456139
Blastp | Glucomannan 4-beta-mannosyltransferase 9 from Arabidopsis with 76.55% of identity |
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Blastx | Glucomannan 4-beta-mannosyltransferase 9 from Arabidopsis with 76.55% of identity |
Eggnog | Glycosyl transferase, family 2(COG1215) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G03760) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019456632.1) |
Pfam | Glycosyltransferase like family 2 (PF13641.5) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |