Ll_transcript_533310

• Id Trinity: TRINITY_DN50009_c0_g6_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_533310
• Sequence: TCAAGGAGCAGTGGAGCCCAGCATTAACCATCTCCAAGGTTTGATTTTTCGTTGCTTGTTTATCTTGATATATAATAACTCTGCATAATTTTGGAGTTTG TATGTCATTTGCGTCCCCAAGTTAGATATAATTACTGAATTACCTGTGTGATATTCTGTCTGTTATGAACAAAATTACTGTGTTTCACAGTTTTGTTATC TATTCTTACTGCTGAAACAGAGAAATACAAAGTTTGTGGTTTCTTTGGTCCCTAATTGTCAGGGAATTGATGATTTTATTTAAGATCCGGATCCGGGGCT TATTCTTAATCTTATTTGTATAAATTGTTATTATATCATGCATGTATCTTCATGTATTTTTTTGTGTCTCGTGTATCTTCATATATTTTTTGTGTCTCAT ATTTGGAGTGTTGATTTATTGGTTTATCTGTTTGGTTCTTGAATTAGATTTCTCGTTTACGCTATTGAGCAGTGAGTTTCATGTCACCTTGAGATCATAT GACAATAAAAATCTGTTTATTTAAGCCCTGATCATATGATAACAAAACCTGTTTATTTACTCTTTTTTCTGGAACTGTGATCTAATGAGTAGTCTGATAA GCTTAAGCTGAACAGTAACACCTTGATGAAACTGATTCCATTATGTTTAGGTCCTTTTGTCAATTTGCTCATTGTTGACGGATCCCAACCCCGACGATCC GCTTGTGCCTGAAATTGCACACATGTACAAGACTGACAAGACCAAATATGAAGCCACTGCTCGCAGCTGGACTCAGAAGTATGCCATGGGTTGATATCAT GCATGTCTTCTTAGCTGTTAAATGAAACAGCCAAATCTTTCATTTATGTTAAAGAACAAGATATATTTTCAATGAGTGCAGATGCTTTGTCTTTTCTCGT GTCAATGGTAAACTCAACAATGGTAAGGAAGCCTGTTATCATTTGTGAATATTTATCTGTAAAACAATTTGATTGATGAAATTGTAATGTTATGCAAACC TTCTACCTTTTGACCCATGTTATTTCAAACTAGTGGCATAGAGGTTAGGTAAACATTAAGATTTTGTTGCATAGATTTAGCGAACAATTATGTCATTGTA AAAAAACTAGGTGGGTTAAGATGTAAAAATGGTGATCAAGTGCACAAGGCTACTAGTGATGTCTTGGAAAGGTATTGTATGTAGTTTATTTCCAAGATTT TAACCAAGTGATGAGGAAACCTTATAATTTTATCAGGTCGAACCTCTTTGGTTTAACTTTTTAGCCTAATGTATAGTTCATGCTTAGGGGTAGACATTGC CCTGTCATCGAGATTCGAGAAAGAGTAGAGAGCCATAATATCGAGCTATGTTGATGGTAATCACCAGCCAGTGCAACCGTTGAAAGTCTAATTTCTGTTG TTGAATTAGTAGTTTTTCTTGATGATCACTGAATTAGTAGTTTAGCAGGCGTATATTGTGTGATTCAAATCCATCTGGTAAAGTTTGTTGAATGGTAGTT TAGCTAGCAGACCTTTTTGATAGAGTATGGCATCATTCGATCATGAACCTGACCCCATCTACTCTATCTAATAGGATTAAGGCTTGATTGTTGTATAGCT CTCATCTAAAACAACCCGTCCTTTAAAATAGGAAAACCCTTATGATAACGGTATTTGGTAAATTTTGTTAAATTTGCTGTCTAAGTCTTCTTTCCGAGTT TTTGACAGTTAGTTCAAATTGTGGTTAATTATTCTTTGTAGTTTCTCTGCATAATACTTTAAGAAGATTATTGATTTCCGCCTCAAGACTCTAATTCTTG TAGCTTATATTACTTACAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_173942;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_533310

FPKM

• PAB: 7.8
• PNAB: 5.5
• PS1: 4.8
• PS2: 3.6
• PS3: 5.3
• PW1: 6.2
• PW2: 6.9
• PW3: 4.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_533310

• Blastp: -
• Blastx: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 10 from Arabidopsis with 95.74% of identity
• Eggnog: ubiquitin-conjugating enzyme(COG5078)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G53300)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002933)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_004500383.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;