Ll_transcript_533835

• Id Trinity: TRINITY_DN50086_c0_g1_i19
• Name Transcript: Ll_transcript_533835
• Sequence: TAGCCATCAGGGCTTCGGCTTGGACTCTTTTCTCCGTCCTCGGTATCCCTCTTGCGGTAAGTACTTAGAGCATCTCCATTCGAGAATATATCAAATATAA GAATGCGTAAATGAGTTGAATACTTTTTCATTTGTTATCATAAGTTTTGAAGACCATATTTTAATATTTTTACACATTATAGGGTAAAGTATAGCTGCTT GTATATGTTTAAAACTTGTTTGATAAGCTTTTTTTGAGTTGGTAGAAAAGGTAAAAAAAAAGTAAAGAAAAGGAACATGAATATAGAAAAGATAAGAGAG GTTAAGAAAACACTTAGTAACCTATTTTTTGGGGTAACCTTTTGGGTTTGCTAAAGGAAAATGGAGTGGCCCTTGCATGGATGAAAGTCATGTGAAGTTT ACAATCTTCATAGATTTGTTTTTTTGTGGCTGATAGTGACATATTGTGAACAGTTAGGTACTTGGACCCTAGGAGTAAAATAAATGAGAGCAGAGAATCT GGAACCTAACGTGTGGACTATTTTCTGATGCATTATTTGGATTTTGGACTCTACTTGAAATATATATATATATATATATTTTCCTTCTTGTCTTATTTTT TGTTTGAAGTGAAACAACAATTGTCAAATATTTTTTGAAATTGTTTTTATTGTGATCTCTTTTTATTATAAATTGTCAGTTTGATTTTAATTAGCCGGAA TGACATTAATAGATTAGTTTTGGAATAAAGGTGCATAGGGGGTGGCAATATTCCTTACCCTGATATAATCTTTTTAATAAAGAAAACAAAAGGAACCACC CTTTTACTTATCCAAATGTCATAGACAGAGTTTATTTATTAAGATTGTATTTAATACACTTAACTTTTACTTCAAGCTACAGCTAGCATAGCTTTTCCGT GATCCTACCTATTTTAAAAAACAGCTACTTCTTTTGTTCTCTTCATTGGTCCAAAAAAACAGCTAAAAGTTCATCATTAATTAACAAGGATAAGAAGAAT TGCAAGCCTAAGAAAAAAGTTCAAAAACTTTATGCATGTGTATGTTATAGACTTATAGTAGTAGTAAACTAACAATCTTTTTTATGCATGTGTGTGTTCA GATTACTTACAGCATACCCTTTGCTCTGGCATCTATTTTCTCCATCACTTCTGGTGCTGGCCAAGGTAAAGAATATGATAATCATTTAGATAAGCAATAC TGTTATATTAGGTAATCTTAAACTAAAAGGCTTTTGTCCAAAACATTCAGGGTTATCTCTTGGAGTTCTCAATCTTGCTATTGTCATACCACAGGTTAGA ATTAAGTTCATTTCATTTCATATGTTTAGAACATATATAGTGTGAATTTAATTAATGACTAATTATATTGTGCATATGTCTATATAGATGATTGTGTCAG TGCTTAGTGGACCATGGGATGATGCTTTTGGTGGTGGTAACTTACCAGCATTCGTGGTGGGCGCGGTGGCGGCCGCAGCCAGTGGGATATTATCCATAGT CCTGCTGCCATCTCCACCACCAGAATTGGCCAAGGCTGCAACTGCTACTGGAGGAGGGTTCCATTAATAATAAGTGCAAAATAATGTTCATCTATCTCTT TTTTTGTCCTCATGTTTAAAAATGCATTAAGAAAAGAGTTTTTTATTTCAAGCTGTTGTGTACAATGAATGCATTTAGGTCCCATGAATGCTACAAAATG CCTTTTTTTGTGGCATCAATGACTAATAACAGTCATTTTAGTTGTAAAGTTTAATGTGGCTGTACATAACCCTGTTGAAGCAGGACCAGCCCTATCTTTA ATTTATATAATATTTGGTATTTTTGGGAGCTAAGAGGTATGTAGTGATAAAGTATGCATGGTTGCATGGATGGTTACTCTACTAATGATTAATAATAATA CATGTTGGAAGAATTCTGAAAAAATGCTTACATAATTTGAAATAGTTGTATTATTATTATCACTGAATATCTTGTTAAAGAGGATATTTAAGTTTTATAT ATTAACTCTCATGCTATTTATCATAACTTCATCTAAAGTGGATCTCTCGGAATATAACTTAAATGCAGTCTATAAATTTGGTTTAAGTCACTCAAATATT CAACTATTCTAATACATTCTATTTTGGTAGTGCACAAACCTAACTTAGTGTTGGGATGCTTAATAACTATGTCATCGCTACATTATTACTTTATATGTAT GTCATTTCTTGGTACCTTGCTTTATAAATATGTCACCCCCTCATAATGGATACTACAGAAAAAGAAAACAAACCAATATATCTATTATCTAAGGATTATT TATTTTGGAGTTGGATTTTGGAGTAGAATGATAAGAGAACAATTGAGAACTATGAAATAAGTTATTAACATAAGCTAAGCTAGTTAAGTTGAGAGTGTGA GTGTTGGATGGGGATGTCCCGAACCCTGTCCTTAATTATGTAGGCATGTATCAAACCAATCACAATACAGAAAAATAAATAAAATAATAAATGTTGAATT TTTTAATTAATGTGATATATTTTTATTGGCTTGGGATAGACTTTGGGACAAGGTTCGGGATATCAGATCCTTCTCGGTGAGCGTGCAGATTCAAACTCCC AAAATTACACTCTGACCCTACTTCCAAGAAAAAAAATGCATGCTTATTAGAAAAACATAAAGTTGGTCATATGTCATCTCTTCAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_174586;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_533835

FPKM

• PAB: 0.4
• PNAB: 0.6
• PS1: 0.3
• PS2: 0.4
• PS3: 0.3
• PW1: 0.7
• PW2: 0.7
• PW3: 1.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_533835

• Blastp: -
• Blastx: Sucrose transport protein from Spinacia with 46.38% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0000577)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019452732.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;