Ll_transcript_279695

• Id Trinity: TRINITY_DN50116_c1_g4_i7
• Name Transcript: Ll_transcript_279695
• Sequence: CTACTTTGTTAATAGTGGCTTTCTTTGCATGTGACACATCCTCTTTTGCGTTCTCACCACCGTTTACTTTATTTTCCACCCTCTTGAATTCAATAACGGA ATTTATTAAATAAAACAAAAGAGCATAGTCAAAGGAAGAAGATTTCTGTTGCACCATGATGTTTCCACCTCTTTTCCCAAGAAATGTGACAACATGAAAA AGGTCCCGTGGTCCTATGTGACGATACTTTTTCAAATAAAAACAAAACTATAATAACTTGTGGTAAGAGTTGTCTGAGTCTTATATACATTTGACTAGTA TGTGGAACTTATCTTAACATTTTGCATGTTATCAATCATTGCTGTGTAAGTTAAATGTTACTAATCTATGTTGATTTTGTGATTAACAGTCAGTGCCACT ATATCTCTCTGAGATGGCTCCCTACAAATACAGGGGAGCTTTGAACATTGGCTTCCAAATGTCCATCACAATTGGTATTCTTGTAGCCAATATATTGAAC TACTTCTTTGCAAAAATCAAAGGTGGTTGGGGATGGAGGCTAAGTTTGGGTGGTGCAATGGTCCCTGCCCTTATAATCACAATTGGCTCATTAGTCCTTC CAGACACTCCGAATTCGATGATCGAACGCGGCGATCGCGATGCAGCCAAGGCGCAACTTCAGAAAGTGCGTGGAGTTGATGATGTTGATGAAGAGTTCAA TGACCTTGTGGCAGCTAGTGAAGCCTCTATGCTAGTGGAGAACCCTTGGAGGAAATTGTTGCAAAGGAAGTACAGACCTCACCTCACTATGGCCATATTG ATTCCATTCTTTCAGCAATTTACTGGAATCAATGTGATTATGTTTTATGCACCTGTGCTTTTTAGCTCAATTGGGTTTAAGGATGATGCTTCTCTCATGT CAGCTGTGATCACTGGTGTTGTTAACGTTGTTGCTACTACAGTGTCAGTTTACGGAGTTGATAAGTGGGGTAGGAGAGCCCTTTTCCTTGAGGGTGGAGC CCAGATGCTCATATGTCAGGTACCCTTTTTCTTAACCTTCAATGTAATAATTAATTGGATGAATTATTCAATGAAGTACCTAATTTGGTAACTGCATTTG TTGAGATAGTTTATTATTGCTTATTGAATGATTTTAGAACAAAGATTTTGCTATCTTTGGTCCTTTCTCATATGGTGTCTCGGACCAATAAAAACATGTC ATGTTGATTTAAAATTTGAAAATTCATTAATATTGTTATTTTTGCTTCATTGGTCCATGATACCATGGGATAGAATCTGGGACAACAAATATATGTTTAT GATTTTAAGCTTAGAAGTCAGGAATAAGGATCTATTGTCCCAAATCTTGTCCAGCACTAATGAAAACGTCATATCAATTGAAAAAATTCAAAATTCATTA TTTTTCTGTTTTTGCTTCAATGTCATTGGTGGGAGACATGGTTTGGGACAACAAATCCTTGTTCAGAAGTCGGAACAAGTGTATGGTGACATTTAATTTT GTCACATTTGAGTGGCATCCTATTTAATTGTTAACCCAATGCTTGTTGATGTGCACAGGCTGTAGTTGCAGCTGCTATTGGAGCCAAGTTTGGAATTGAT GGAAATCCTGGTGATTTGCCAAAGTGGTATGCTGTAGTTGTGGTGCTATTCATATGCATTTATGTAGCTGGTTTTGCTTGGTCATGGGGCCCCCTTGGGT GGTTGGTACCTAGTGAGATCTTCCCCTTGGAGATTCGTTCTGCTGCACAAAGTATCACTGTCTCCGTAAACATGCTCTTCACGTTCCTTGTGGCGCAAGT CTTCCTGTTAATGCTTTGCCACATGAAGTTTGGCTTGTTTATCTTCTTTGGTTTCTTTGTATTTGTGATGACATTGTTTATTTACTTCTTCTTGCCTGAA ACTAAGGGCATTCCTATTGAAGAGATGGGAAGGGTATGGAAGGAACACCCATACTGGTCAAGATTCGTTGAACATGAAGATTATGGCAATGGAGTTGAGA TGGGAAAGGGAGCTACTAAGAATGTGTAATTAGTGCTGATTTTAAGTTATTTTTATTCAGTGACTAGTTTTCATTTTGTTTCCATGTACAACATATTATT TGTGTCAATGTCAAGGTCATATAATGTATTGATTTGGTTCCAAGAATTAGAAGGTTATTTTTATCCTGGTATCAGCAAACAGAATACAAGTTTAAAGGAT CCTTTTTCTAATATTGTATAGTTTATTATGTGTCTACTACATTTGAAATCTTGGTTTTCATTTCATAAAACGTTTACATAAATCTATGTTCACTACAAGA CTTTATGGGTTACATCG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_174795;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_279695

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.3
• PS1: 0.3
• PS2: 0.2
• PS3: 0.1
• PW1: 1.4
• PW2: 1
• PW3: 0.6

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_279695

• Blastp: Sugar carrier protein C from Ricinus with 83.66% of identity
• Blastx: Sugar carrier protein C from Ricinus with 84.36% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (8275367)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019434600.1)
• Pfam: Sugar (and other) transporter (PF00083.23)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;