Ll_transcript_280430

• Id Trinity: TRINITY_DN50136_c2_g1_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_280430
• Sequence: ATTATTCTCATTTTATTTTGAGTCACATTCATCACTCGTCATTTTCTCATTTGACTCGTTCTGCTAACGAAATTCCATTGCTTAGTTTGAGGTTAATCCA ATTACATTAGGTGGTTCCGATTGGTTAATTTGGCTTTTCAGATTTTCGGGACCCACATAATTAAACTACGCATAATATTAGGGATCAAATTGAAATTTTA CTAGGGGCTAGTTGATCTTAAAAAAATAGGAAATAGGAAAAGGAAAATATTTAGTAAAAAGAAGTTTTTTAATATTTTAAAACACTTTTCTTCCACATTA GCAAATATTTAAGTTACTGTAATAATAATTAAATAAAAGGTTTTGCAATAAGTAAACTTATTAATGAATACTTAATAAACAAAAAAGAGTTAATACAATC AAAAGAATTAAAGAGTGACCAATCATGCTTGATTCCCCTTAAGCAAAGTCTTGTGTTCAATTTTTGTGAATGGAAAAATATCACCGAGAGAGTTAGCTCC ACGTACTTATGGATTTCTGGCTTGGACATGATGATCTCGGTGCGAATATACATGTGAGAAACCATAAAAAAAATTAAAGAGTGTAATATATATATATATA TCATTCATAATTTATTTGTGTTACTTATATTCAAGATTAATGATGATTAAATAAATATGAACGATAAACAACACAATGACAGTGTAAAAAAATTGTACGT ACATTATTGGGGGATACAATTGTGTTTAATAGTGTAAAAGGTTTGGGTAATTGTATACTTCTTCTAGAATGAATACTCTCTAATCTCTATGTTCCAAAAC TTGATATTTAAGGTTATGTGTATATTTTTAAAAATCAATAAATGATGTTGAATACAATTGGACTAAAGTAACATCTTTTAATACTCATTGGAAAGAGAAA TGATGGTGAAACAGATGAGTAAAACATAAAAATATAATTTGAAAGTAAAATAACATGAGAAAATTAACTTAAGTTTAGTCATTTCTGAAACATTCATGAA GTAAAATTTATTTACAAAATAAATGCATTCCAAATATTCATCATTCATTTCAAGCGAATTGCCATAATTTTTTGGTCACTAAGGTATATCCAATGGTTGA TAAATTTCCAAGACAGTGAATTTATAGTATTGGATCCTATTCTATCATGTGGTTAATGAAGTAGGATACAGAATATTTTATAGTCAGTATTCAGAGAACA GAATAAAACTTATATAGCCATGTTGTCTATGTAAGTCTAATAGACACGTGCCTAATAGACATGTGCCTATACAGGTTTTTCTCTGGTGGCATTCATGATT CCTGTGTCTCATTGTTCCCTAATGTGCACCATTATTCCAATTTGTTGTTATGCTCTTTACATCATCACTTGCACATGCTCATTGAGGTGGCATAAACTCT TTTCTTTAACATGTTCTGTCATGTAATTCATAATCTCCAAACCTGTCCTTTGTGACTTTGTTTATCTGCTTCAGGCTCAGAGACATTATGGAAGGCAAGC CCATGTTGTGTAGAATGTTGTAGAGGGTTCAAAAAATGTGGTGTAATGATAATAGTTAAATAATAATGAATTGTGCCATTGATTTGTGTTTTATTGTCTT GCTTTGACTCAATTAACTTGAGTGTTAAACTATTACTGATCTGAGGACCTGTGTTATTCAGGTAAGTGATTATAATTTTTCATTCATTTTCAAATGGGAA GTTGAAAGACTTTCTATGAATTTATTCGACAAGCATCTGTGTTTTAGCGCCTTTTTTACACGTCTTGCAAAACTTGTTATAATATATACTACCTCCAGTC CTTTTTACAGGACCTTTTTTAGAGATTGGTTTTGATGCTTTTTATAAGATCATTTTGAGATTTCTCTGTACATTAATTATTTTGTTATCAAAACATCCTC ATTAATTAGCTTGTAATGGAAAGAGAAAATGTAGTTTATCAAATTAAGGGCTACTACATCCTTTCTGTCACTTAAGAAACAAACTATCTTAAAGGAGCCT TTTCGGCATATCTTGTACCACCAAATGCTGTGATGGCTGGCCAGCAACTCTTAAACCTTCTTTACTTCAACCTAAGCTTTAGTTGGTTGATGGGACTTAG GCCAAAACCTTCTTATTAGGTGTATACTTTTATTGGTTTAGGGATAGATATGCCTTTTCAACTAATGCATATTAGGCATGTCTGCTTTGTTAAATGAGGC TTGCAATGTTCCTAACATTCATCATGCTTTAATGCATAAAGTAAAAGAAATTAATGTGATGAACTTTCATTTTAACAGAGATGGTAATTTTGCAGGTCTG TAAAGCCAAATATCAAGAGTTGCTAGAGCGATATTCCGGGAGCAAGGCTTGGTTTGAGGAGCTTAAAAAGGAAGGGATGGCAGAGCTTAAGAGAGCTTTG GAGCAATCTGAAAAATCAATTGGGTCTCTTAAATCAAAGCTTGAATTCCTTAAGACCGAGAAGAATGAGACAAAAAGTGATTGTCATCTTGACAATGTCC CAGCTGGACCAGAATTACGTGTTCCTTCACAGAATTTGGAGAGAGTGGAATCATCCAATAAAGAGACTTCGAAGGATGGGCTATCTGCTGGGAGTTTCAC GCATGAAACCCGGACAAACTGGTCTCCTGAAGGTACCCAGTCTGCTGAACAAGAGAAAGTTTTGAATGTACTTAAGTTGGAAGATCCTATAGGTGAAGGA CAGGTAGGGGGCTTAAAAAAGCAAAGAGGGAAAAGGAAGAGGAAGGATTCTGACAGTAATATTAATAAAACAAGTGTTCGAGAAAGTGATGTGTTACATT CAGTAGATGTGTCCGGATATAAAGAAAGTTCAACTAGCAACAGTGACGAAATTGCAAAATTTTGTAGCAAAGATAAGAAGAATCATAACTCGAGAAAGGA TAGTATGAAAGATATCATGGAGATTCTGGACTATATTTTGCAATCTAAGGGTGCTTCTTCTTTCCATCGCAAACATGATAGCCAGAAAAGAGGCAGGTAC AGGAGCATGATCCGGAAGCACATGGACCTTGACACTATAAGGTTAAGAATCAGCAACCGAACGATTAAATCGGTCATGGAACTTTTCAGAGACTTATATC TACTCATCAACAATGCTCTAGTCTTCTACTCCAAGAGCACTCGCCAGTATAAAAATGCTCAACTGCTTAGAGACATGGTCAATGAAACATTAAAAGAATG CATCAAAGATTTTAGAAGCAGTGTTACCAATGCTGATGTCTCTATCACATTACCTGTCGATGAGCCTCCCCTGAAACTCAGAAGTGTATGCCCTGGTAAC CGGAAGGTTGTCGCAAAGGAAGCCGGTGGTGGCAGCAAGTCTGCTTCTGAGGTCTCACATGGAGCTAAGGTACCCAACAAAGTGAATCCCCCACTTTCAG AGGAATCCTTGCCCATCAAGAAATCTTTTGGTCGATCGAAAAAGGTTGGACGTGAAACCACAGGAAGTCAGAGACCCGCTATGGCAATGAAGAGAAGGAG AACAGTGAGAGCCAAAGATGATAATGCTGAGGATTTGGTTCCATCTAAAGCTTATCCATTAGGTCTTTAAGGGCATCTTTGTACTAAGACTACCCATCTT TATTAATCTTTTTTTGTTTGATGAGCCTTCATGCAACCAGAAGGGAACTAGGGCATCAAAGTTCAAACATGAAATAGTTATAAATTATAGTAGCTAAACT AGATAAATTTCCAAATATAGTAGCAGGTACTTCTCCTTTTATCAGTATCTAAATAAATTGTACATTGTAATTATTAACTTAGTGGGAAGTATGCTAAGTT AAATTGACACCAATGGGTATATTAACTTGTTTATCACAAGGGATATTATTTCACTTAATCTTTTTGAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_174898;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_280430

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.6
• PS2: 0.3
• PS3: 0.1
• PW1: 0.3
• PW2: 0.1
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_280430

• Blastp: Bromodomain-containing protein 8 from Mus with 27.03% of identity
• Blastx: Bromodomain-containing protein 8 from Mus with 27.03% of identity
• Eggnog: Bromodomain containing 8(ENOG410Y97J)
• Kegg: Link to kegg annotations (78656)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019445628.1)
• Pfam: Bromodomain (PF00439.24)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;