Ll_transcript_278946

Id TrinityTRINITY_DN50178_c0_g1_i9
Name TranscriptLl_transcript_278946
SequenceCAAGCTTGCAAAGGTGGCAAAGGAAGAAAAGTATTGGCATTAGCTTGAACCATCCAATAAGATATCACCTTATCCTATCCATTATCTTCCCTCACATCAC ACAAGAGCCACCAAATAATTGTCCCCTCCTCATTCTCCAACACAAAAACACTTCCAAACTACATAGTTTGGAAAACACTGAGAACATTGGTGTGACAATA GCAACAATGGCATCCTCACTACAAGCAGCCGCTACTTTCATGCAACCCACCAAGTTGGGCCGTAGCAACACTTTACAGCTCAAGTCTACTCACTCCATTT CTAAGGCTTTTGGGTCAGAATCCTCTGGAGCTAAGGTCACTTGCTCCCTTCAGGCTGATCTTAAGGACTTGGCTCACAAGTGTGTTGAAGCCACCAAAAT TGCAGGGTTTGCTCTTGCTACCTCTGCTCTAGTTGTCTCTGTATGTTGCTTTAACCCTCTTCTAAATATTCTTTGATTCACTGTTATATTCATCCATTTC ATTAAAAATGGTGTCTTTTTTTTCTGTTTAATTTCAATTATGACATAGTTCAAGGTTCCACTATAACATCCTAGCAGTGTTTTAAAATGTGGACCGCATC ACGTGATACCAAATCACAGTAACACAACCGCAACTGTCGTAATGATCGCAATTGCAGTAAACGCAACCGCAATTTAAAACACTGAATCCTAGGAATTCCC TGAACTGGATTTAGACTTGGGCCTTAGACTATATACTTTCATCGTCTGCAAAAAAAAATCAAAGTTCTGTTTTTTTCTTTTAATGCTTTGTTATTGTTTA ATTAAATGTGATGAATGATGTAGTTGTATGCAAGTTACTAAGTTGTAACAATCAATTTGATTAAGGAGGTCAATGATAAACAAAATTGAAATCCAATCAA ATTATCTTATAATTAATAATCTATATATGTATATAGTGTACATTAATAATCTATCTGTAATTTGACATTTTTAACTGAAGAGCTTTATGATCATGATGCC AACTACTCCTTTGATATGCAATCTGCACCATATATTTTCTCTAGACAGAAATCTTGTATAAAAGTTACTAAGTATCAGTCCCTTTGTCACCAATGAGTGT AGAAGATTTCAGTTTCACTTGTCTGTGATACTAATTCAAGTAATTAAATGTTGTTGGGATGTTTGAAATATATTATTATGAGAAGTCTCAAATTATCTAT TATTGTAGTGGAGGAAAGAGGTCAAAGTTATAGATTGGACTTAAGTTCTTTGTTATAACTTACACCAATTAGAAGCACCATATGAGTTTTGAGTCATGAG TGTGCTAGAGCTTGTACTCCTACTATATAATAATATGTTAGTAGCTTCTCAACCCTCCCGGTGACATAAACACAATTGTTCGAGCTATGTTAACAAATTA TATTGTCTTATTCTCTTATATTTATTCTTATTCCCTTGATTTAATTACTCGTGGTTAAAGCTGCACATTGGTCGCTTCAGTTGCGTCAACATTTGTATCG TGGCCAATTGATATTTGACATTTAACCCAAGGGCCATATTCATGGTGGAGAAATTCAAATGAACTTGTAACTTTGAAGTGTGGCAAACAAAGGTGAAAGA TGTGTTGGTTTGACAAGGTATGTCAAAGGTTGTAGGTGAGCATATGGTAAAATCATGGTGGGGAACACATTCATGTTGGATCTAGAACCTCAAATGTTTA TGTATTGGATTGCGACCTAAGTGGAGCATCAAACTATGAGACAAGTTCTAGGAATATCTCTGTAGGTGTTAGAGATGATGATATCATTTGTGATGAGAAA TTGTGTATCCTTATGGTGTTTACATGGCGTTATGGGTAATGATGTTAATTGTTAGCAGGCCCATAAAATCACAAGAGCATTAGCTGACTTTGATACAGGG TATAACACATGCATTAACGTGGATGCAAGGTGTAACATGAGCATTGATAGAGATGCAAGTTGTGACACGGACATTGGCTTGTATAGAAGAGGTGTGACAC ATGCATTGCTTGACATTGGCACAAGGTATGTTGTGGGTATACTCCTTAAAATGAAGTATGATAGTTCTTTTGGATTATGATTGTCAGAGTAGACAATGGT GGTAGTGGTTGGGGCTTTCGAAGAAGCTCCAAGTTTTAGATTGACTGAGTTTTGAAACGGCAATTGTTGGTGAGATTTGGTGATATGGAGGTTCACATCA TATGTATTGCTCTACGAGATTGAGGTAGCTATGCTCGAAATTTGAAGAAGAGTTGCTCTTGGCGACATCGTCAAAGATGCTAGGAAAGACTTATGTTAAA GGGGGACATGCTCTTATATGGAGGAGATGATAAAGAGCGCTATACATTTAGCAAGATAAAGCGGAAAATTCATTAAGATAAAGATTATTGCATAGGAAAT TTCCTAAGGAACTATTTATTTTCTCTCCATTTATTCTTATACCCTTTATTTGATATCGCTCATGGCCTACACCCTGCAACGAATGCTTCCACTACACCAA CAAATGTTAACTTAGATTTGCCTATTAAGACGTGTTTACTAGTTCACCAAGAGTTTCTTATGTAATTTTTATGCAAGGAAAAATCCTTTTGTCTATTGTC TACTAACCCTTTTTACATTGAACATACCAATAAATACATAAACTTATGACCTATTGCTTCTCTATTTGTAACATGCATATAAATAGGACTCTTTTAGAGA AAAATCCTATTGATCTATTTAGTACATGAGTGACTGTTAACCTTGTTCAATGTTCAGGGAGCAAGTGCTGAAGGTGTTCCAAAGCGGCTAACCTACGACG AAATCCAGAGCAAGACATACTTGGAAGTGAAGGGTACCGGAACTGCAAACCAGTGCCCAACTATTGATGGTGGAGCAGACTCATTTTCCTTCCCTGCTGG CAAATACACTGCCAAGAAGTTGTGCCTTGAACCTACTTCATTCACAGTCAAAGCTGAGGGTGTAACCAAGAATGCCCCACTTGAATTCCAAAACACCAAA CTCATGACCCGTTTGACCTACACCCTTGATGAGATTGAAGGGCCATTCGAAGTTTCACCCGATGGCACAGTCAAATTCGAGGAGAAAGATGGCATTGACT ATGCTGCAGTCACAGTCCAGCTCCCGGGTGGCGAGCGTGTCCCGTTCCTTTTCACCATCAAGCAATTGGTGGCATCAGGGAAGCCAGAGAGCTTCAGTGG GGACTTTCTAGTGCCATCATACCGCGGTTCGTCTTTCTTGGACCCCAAGGGAAGGGGTGCCTCGACAGGCTACGACAACGCGGTTGCGTTGCCTGCTGGT GGAAGAGGAGATGAGGAAGAACTAGGCAAGGAAAACAACAAAAGCGCTGCTTCATCCAAAGGGAAAATCACGTTGAGTGTGACCAAGAGCAGGCCTGAGA CTGGTGAGGTTATTGGAGTGTTTGAGAGCATTCAGCCTTCTGACACTGATTTGGGAGCTAAAGCTCCTAAGGATGTGAAGATCCAGGGCGTATGGTATGC TCAGCTTGACTCATAGAGAGGCTCTTTTTTTATGCTTTCAATTTGTATTTTGTTGGTTCAGATTTTGATGTAACTCCTAAAGATGTTACTGAATTGTCGT TTGACCAAATTGGAATTACCATCATGTTTGTATATGATGCCTATTTTCAAATAGTACTATAAAAACTGGTTGGGACTAGCTACTCCTATCCGCTCAACCG GAAATTGGATATCAAATCAATTTGATTCTCTCACCTTGACGGTTAATTTAAATCTAAAATTGGTGAAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_175218; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_278946

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_278946

BlastpOxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic from Pisum with 95.29% of identity
BlastxOxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic from Pisum with 92.91% of identity
Eggnog-
Kegg-
CantataDBLink to cantataDB annotations (CNT0000045)
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019446753.1)
PfamManganese-stabilising protein / photosystem II polypeptide (PF01716.17)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;