Ll_transcript_278846

• Id Trinity: TRINITY_DN50179_c1_g1_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_278846
• Sequence: CTTCCTAGTTCTTACCTAGTGGCTACTTGTTAGATGCAGACAAGTTGAAATTAATTTTGTTGCATATTATTTACCTATATATCAGTGGTCATGCATGAAT CTTCGAAAAACAAAATCACTTTTTGCTCTCTCTTATTATTTCTACAGATTTCATCCCCTTTAAAGGAATATCTCCCAATATTTCCTCTGCTCTTCTTTCC TTTTTTTTTCCTATTTCCTTTTGTAATCATCGAAACATCACCTTCACGTTTTATTTCCAACCTCTTTATTTACCTTTCCTCATTTTTCTTCTCTGTCTCG GCTTGAATCATTTCATAACCTTTTCAATTTGCCTAGAATTCGAACACAGAGATTGGGTTTTAACTTTTCTCTGTTCGAATTCTTTGGACTTTGTTTTCCT TCTCTTCCTCAAATCATCTATACTACAAAAAAAGCAAAGGTTTCCTGAAATGCCCTTTCTTTTCATGATTTCGGGATTCATTTGTTGATGAGATCAATTG GTGCTTAGAATGGACAGCTCAGAGATATAAATTTGAACTCAAAATTTGATTTTGAAGTTTTAAACTCTTCAATCATCCGAATTTGTGTAATTGTTTATTG TTAGAGAGGGTGGACAAAATGGCTTTTGGTTTAATCTCTGCAGTTTCAAAACTGCAAATGGTATCCACTTCGGATCATGCATCTGTAGTCTCAATGAACC TGTTTGTTGCACTTCTGTGTGCTTGTATTGTCATTGGTCATCTTCTCGAGGAGAATCGTTGGATGAATGAGTCTATCACTGCCCTTTTGATTGGTCTTTG CACTGGTGTAGTCATTTTGCTGCTTAGTGGTGGTACAAGCTCACACGTTCTTGTTTTCAGTGAAGATCTTTTCTTTATATACCTTCTTCCACCTATAATA TTTAATGCTGGGTAAGTTTTTTGCACTATCTCTTTTTCTAGAAAGGGATGAATTATATTTGATGTTGTGTTTATCACTGTTGAATTAAGAGTGAGGGGTG TTTTGCATCTTTAGGAGCCATTAACTGGTGACAAAGTGAAGATTCGTCTGCAGAAATCCCAATACTGTATCTGAAAGTGGTCCAAAAGATTTCAATTTTT TTTGTTTAAAACAATGTATTTCTGAAGAACCACTCCATAGTTAATGATATATAATTAATGGCAGATACCATGTTGGTGATTGAAATGTAGCTGGTACTAG CACTCTGTTGAATTGCTTTGCTTGCACTTACGCAAGTGGCTGGTGACTCAGTCCAGTGTTTGGGGATTTCCCTCTTTCACTATTTCAATAATGTTGAAAA ATATACAACCTCAATAAATTCTACTTAGTCTTCCTGATGCTTTCTTGGAGATACCGTGTCTGTTCCATCTTTGCTGAGTAATGATTGTTTATATCAGAAT GAATTGTATTACACCATATGAAAAATTTCAAAAACATATTGTCTCCACGCCCTAAAATTCTTGTTCTGCACTGAGAACTTGTATTATTTCCTAGTGTGTA TGGTAGATTGAAGTTATTGTTTTGTTATTAATATGTTCTATGTAATTTATTCCAGGTTTCAAGTGAAAAAGAAGCAGTTTTTTGTCAACTTTATGACCAT CATGTTGTTTGGTGCTATTGGTACATTAATATCTTGTACCATCATAACCTTGGGTGTTTCTCAAATTTTTAAGAGGATGAATATCGGTCCGCTGGAAATA GGGGATTATCTAGCAATTGGTGCAATATTTGCTGCGACCGATTCTGTGTGCACATTGCAGGTGCTAAATCAGGATGAAACACCTTTACTGTACAGTCTTG TATTTGGGGAGGGTGTTGTGAATGATGCTACATCAGTGGTGCTTTTCAATGCAATCCAGAGCTTTGACCTCGAGCAAATTGACACGTCAATTGCCTCACA ATTTATTACCAACTTCTTGTATCTGTTCGTGACAAGCACATTGCTCGGGGTTTTGTCAGGTCTTCTCAGTGCCTACATCATTAAAAAGTTGTATATTGGC AGGCACTCTACCGATCGAGAGGTTGCTCTCATGATGCTAATGGCATACCTCTCCTACATGCTGGCCGAGTTATGCTATCTGAGTGGCATTTTAACTGTAT TCTTTTGTGGGATTGTTATGTCTCATTATACTTGGCACAATGTGACTGAGAGCTCAAGAGTCACCACGAAGCATGCTTTTGCAACCTTGTCGTTTGTTGC TGAGATCTTTATCTTCCTTTATGTTGGTATGGATGCTATGGACATTGAAAAATGGAGGTTTGTCAGTGATAGCCCTGGAACATCCGTAGCAGCAAGTTCA ATATTGTTGGGTCTAGTACTTGTTGGAAGAGCAGCGTTTGTTTTCCCGTTATCCTTCCTATCGAACTTATTTAAGAAGTCACAAAGTGAGAAGCTCTCCT TCAGACAGCAGATTATCATTTGGTGGGCTGGTCTTATGCGAGGTGCTGTTTCCATGGCACTTGCTTATAATCAGTTCACTATGTTGGGTCATACACAACT GCGTACCAATGCAATCATGATCACTAGCACAATCACTGTTGTGCTTGTCAGCACAGTGGTGTTTGGTTTGATGACTAAGCCACTGATAAGGCTTTTGCTT CCTCATGGCCCTCCTAAAGGCACAAGCAGCATGATAAGCACAGATCCATCCACTCCAAAATCATTCACTATCCCACTTCTAGGAAGTGCTCAAGAATCTG AAGCTGATATCGGTGGCCATGAAATTCATCGTCCAAGCAGCATCCGTGCCTTACTAGCCACTCCAACGCACACCGTTCACCGACTATGGCGCAAGTTTGA TAATGCATTCATGCGTCCTGTTTTCGGCGGCAGAGGTTTTGTTCCCGTGGAGCCTGGCTCACCATCTGAACGCAATGGTCATCAATGGCGTTGAGAGAAA AGCCAACAAGTTTGTAAAAATGTATTTTAACTACGTTTATGCATAATGTATGGTAAAGTACGTGCATTTTTTGGAGATCAAGCAATGCATGTATGTATTT AAGAGCCATGCAATGTAATTTTGTTAAGCTTTTTGGGTAGTGATGAGAGTTGGAAAGCTTGTGTGAACCATAAGTCACCACCTCTCTTTTGAAGCTCTAT TATTTGTATTATTAGATTCTTTGATTTATTATCATAAGAGTCATGTTAATTTTCGTGAGTAGTGTTATTTAAACATCATGCTTTAGATATTGTATTTAAT ATTATATACATTTATCTTCATCTTTTGTGTATTTTTAATCTTTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_175221;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_278846

FPKM

• PAB: 0.9
• PNAB: 0.3
• PS1: 0.1
• PS2: 0.1
• PS3: 0.4
• PW1: 0.3
• PW2: 0.4
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_278846

• Blastp: Sodium/hydrogen exchanger 2 from Arabidopsis with 74.61% of identity
• Blastx: Sodium/hydrogen exchanger 2 from Arabidopsis with 74.25% of identity
• Eggnog: Sodium hydrogen exchanger(COG0025)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G05030)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019427838.1)
• Pfam: Sodium/hydrogen exchanger family (PF00999.20)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;