Id Trinity | TRINITY_DN50189_c2_g2_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_279457 |
Sequence | AAGGCATTAAAAAGGAATGGTAACAATCTGTTACCTCCTTTCACGTAAGAAAGGGTGGAAATCTCTAAATAGAAGATTTGGGGAAATTCCCAAATTCGTC TCCTTCTCCTTTTCGCACCTTCTTCGTCTCATAGGCGGCGATGAGTTCACACCGACGGTAATAATGCCTCAGAGCCGTCGTCCATCCATCTCTCTTCCTC GATGCATCTTCTTCCTCGGTGCATCTTCTTCATGATCTATTCCTCTCCAGTCCACCTCCGTACCCGCCGGTGCCTTCGTCGCAAACGCCTGACACCCTAC GGACAGATTTGGCCGGATTCCGTTGAGAACCAGCGATCTGCACGGGCTCAACAGTGGCGATAGACCTTCCGTCGAAGCAAACTCTGGTTTCATTACCTGG CAACATAGATTCACCGTCGGAGATTTCCACACCGCCGCCGCGCTAACCGTCGCAGTGGTGTCTCCTGATGTGGAATCTGATGATATTGGAGTCCCGGCAA GGCTTCCGATCTTGGTAGAGATTCCTACATCAACAAGAAACAATCACTGATACAGATGTATGACCGGCTGCTCCATCAACAACAAAATTGTATGCCTAAT GCATTTGTTTCGGGGCCGGACAAAAATGAGTGTTCACACATTTTGCTCTGAGTCTCCATTGATAGTTGTGTCGTGATTGGAAAAAATATCTTCACCAATT AATGGTGGGATGTGTTTTGAATCACCTTTTTAAAATTAAATGTGTGGTGGAGAGAGTTTGTCCACTGGCACACAGCTTGGAGCACTGCCCAAGGCATTAA TTGAAGGAAATAATTGAGTGGATTGATTTAAATCAGGAGAGAGAATAGGACTAGACAGTCTAGATTGATCCATTAATTTAAAGAGTGGTGAGTGTGTTAG 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GAGCGAGTGAAACTCTCCCAATCAGTAAAGTTGTAGTTGTGAAAAGCCCACTTAAACCAACTAAGTGCCCCTCCCTTCATATAGAATGAAATAAGATGTA GGCGTTGGTCTGGAGGAATTTGACATGGCTGAAAAGTTGTTCAGCTTGAAAAAGTCAGTCTAGAGGTTTGGAGCCATCAAATGGAATTAGTTGAAGCTTC AGAGGTCTTGGTTGAGGTGGAGGGTTGGTCGTAGGAGTGTAGATTGGACGGACATAGGGGTTATGTGTGAAAAAAAGGGGAAACATGGAGTTGGTATAGT TGGGAAAGAAGTTAGGTGTTGTTTGTGGTTGTGGAAAGGGTGGAACAACATTTGTGGGGTTGGGAGGAGATGTAGTGGATGAACTAGTTGTGCAGAAGGT GGAGGAGTTGGATCTGGGGTTGAGGAGGGGGGAATGGTTATTGTGGCTAATTTATCAGTGGTTCTATGGAGGGCCTCCGCAATTGCTTCATGCCTAAAAT CCTATTGATCTTGATGCTCCTTAAGTTCTCTGTAAAAAGTTGTAACAATGTATCATCCATCTCCTTGCTAACAGCTTTGGGAGGCATGATACAAGAATGA AAGCACCAGAATGTTACAGAATTTCTAGTGAGAAGAGATTAAGAACCTAGAATTATTGAAATAACTATCTAACCAAGGATAGAAAATACTGAATAATACT TCATTGATTGTTTTTCTGCAGCAACAACCACATACATATATACTTTCAAGCAGTTTTTAGGGTTTACATCCTAATTGGGCTTACGTATTGGCCCAATATT TTAATTGAAATAACAACTGAAAATATATTAAAATTCATTTAATATAATCTACAAGTCATTTACCTCTTTGTCTATTTCTTTTGGGTCTAGTTGGGTCATC TGCTCTTGGACTATTATCAGTCTTTTGTCTTAAACTTATTAACAAGGTGGCCTTTAACCTGTTCAATCTTCATAGTGTTGTTTCCGGCTAGCACTAGATC ATCTACATATACTAAAAGAGCTGTAAAATCCTTCCTGTAAGCTTTAGTGAATGAGGAATGATCATGATGAGATTGATTGTACTCAAAGGAAAGCAAGAAG TTGGATAACTTGTTGTACCATTGTT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_175276; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_279457
Blastp | - |
---|---|
Blastx | Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 from Sophophora with 37.03% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_020222267.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |