Ll_transcript_279488

Id TrinityTRINITY_DN50189_c2_g2_i10
Name TranscriptLl_transcript_279488
SequenceAAGGCATTAAAAAGGAATGGTAACAATCTGTTACCTCCTTTCACGTAAGAAAGGGTGGAAATCTCTAAATAGAAGATTTGGGGAAATTCCCAAATTCGTC TCCTTCTCCTTTTCGCACCTTCTTCGTCTCATAGGCGGCGATGAGTTCACACCGACGGTAATAATGCCTCAGAGCCGTCGTCCATCCATCTCTCTTCCTC GATGCATCTTCTTCCTCGGTGCATCTTCTTCATGATCTATTCCTCTCCAGTCCACCTCCGTACCCGCCGGTGCCTTCGTCGCAAACGCCTGACACCCTAC GGACAGATTTGGCCGGATTCCGTTGAGAACCAGCGATCTGCACGGGCTCAACAGTGGCGATAGACCTTCCGTCGAAGCAAACTCTGGTTTCATTACCTGG CAACATAGATTCACCGTCGGAGATTTCCACACCGCCGCCGCGCTAACCGTCGCAGTGGTGTCTCCTGATGTGGAATCTGATGATATTGGAGTCCCGGCAA GGCTTCCGATCTTGGTAGAGATTCCTACATCAACAAGAAACAATCACTGATACAGATGTATGACCGGCTGCTCCATCAACAACAAAATTGTATGCCTAAT GCATTTGTTTCGGGGCCGGACAAAAATGAGTGTTCACACATTTTGCTCTGAGTCTCCATTGATAGTTGTGTCGTGATTGGAAAAAATATCTTCACCAATT AATGGTGGGATGTGTTTTGAATCACCTTTTTAAAATTAAATGTGTGGTGGAGAGAGTTTGTCCACTGGCACACAGCTTGGAGCACTGCCCAAGGCATTAA TTGAAGGAAATAATTGAGTGGATTGATTTAAATCAGGAGAGAGAATAGGACTAGACAGTCTAGATTGATCCATTAATTTAAAGAGTGGTGAGTGTGTTAG GCGGGTTCCATGAGGCAGTGTACCTTGCGAGTGAAGTGGGGAGTTAAAACACTTTTACTCCCAATTAATTCATTTTCATTATTTTCTCTGAGGGAAACCA CATACTCCTTCTTTTTCTCTTCCTTCATCTTTCCCAACTCTTCCACTATCTTCTCTTTTTTAACACACTTCTCTTCATCTCTAGCCATTTCAATCGGTGA AGGAGTATCTTCATCAGTCACCATTGTATTTTCAGAACCTGTGATAAGAGGATGAGCCTCCTCATGTCCAACCATATGGTTCTCGGTTGCTGTCCTTGTT CCATTTTCGTTTTTAGAACCTGTGATAAGAAAATGAGCCTCCTCATGTACAATCATCCGCTTCTCGGGTTCTGTCCTTGGTCCATTTCCCCCCCCCCCCC CTTCTTCAACAGTGTTCTGGGAGGAGCCATTTAAATCAGTTGGAGCCATGTCAAAACCTGGTGGTAACTCCATGGCGGTCTCAGGCGCTGGGTCGTGGAA ACATCTCTAAGCTGAAATGTGGAAAACAGGGTGAACCCGTGACTGAGTTGGTAAGGTCAGTTCACACACAACTTGTCCTATCCGTTTCACAACCTTGAAT GGACCGAAGTATCAGCATGAAAGCTTCTTGGATGGCCTTCGGAAAACTGATTGTTGGTGATATGGTTGTAACCGTAACAAGACTCAGTCTCCTGGAGTAA AGGTAATATCATTTCTCTTTGTATTGGCTTGTGATTTCATTCTCATTTGTGCATGTGTCAAATGTTTTTTAAGATTTGCTAAAAACTCAGCTCTTTGATG CAAGGTGTCACTAATCACCGTGTTAGTTGTTGTGTCGGGAATGTAATATTGGAGTTTGGGAGGAGCTCAATCGTACAAGGCCTCAAACGAAGATAGTTGA ATGGTCGAATGGTAGCTGGTGTTGTACCAGAACTCAGCTAACGGTAGACAAGTGAACCACGTTTCGGGGCGAGAACTTGTGAGGCATCGAAGGTAAGTCT GTAACCCTCTATTTATTACTTCTATTTGACCATCTGATTGAGGATGATATGATGTACTGTAGCAAAGTGTAGTCCCTAACAATGTAAACAATTCCTTCCA AAACGCACTTAGGAATATTTTATCACGGTCTGAGACAATTGTCTTGAGAACCCCATGAAGCCGACAGATTTCGTTGAGAAATCAATGAGCTAGGCTCTCG GCTGTAAACTTAGTTGGAAGGTCAATGAAGTGGACATATTTAGTGAGTCTATCCACAATGACCCAGATCACAGTATGCCCATGAGACATTGTCAGATGTG TCACAAAATTCATAGATAGATCCTCCCATACCTTTTCTGGAATTTGTAGTGGTTGTAACATGCCTTGGTATTTCTTGGGAAGGTACTTGTTGGATTGACA GACACAACATTAGTGGACAAAAAGCTTAACTTGCTTAGTGATGCCTGACCAAGAGAAAGCAACCGAGAGTCTGACTAGGGTGGCCTTCCAACCCGAGTGA CCTGCTATTGGAGTATCATGATATTCATGGATCAAGGAGATACGCAGGTTGTCGAGGTCAGGTATAAAAATTCGTCCCTTGTAGAACAATAAACCTTGTG AAAAATGGTATGACCTATGCTCACTGTTTTCTGATTCTTGTTTCTTGATGATGGCATGCCCTTCCGGTGAGGAAAAGAAATGCCTCAAGCGGTCAATAAG TTAAGGAAATGGGGAGAACAAGGATACCATGATGGGAATGTCTTCACTACTACAACGAGATAAGGCATTTGCAACCCGATTTGAAGTACATGTCCTATAC TTGATAATATACTAAAATCCTATTAACTGTGTTGCCCATTCCTGCTGCTCTAGTGTTTGAAACCCTTGAGTCATCAAGTGTCTAAAACTTTGTTGATCAG TATATATTGTAAATTGTTTGCCTAATAAGTATTGTCTTCATTTCTTAACATATTCTGTCACAACAAACATTTCACGGACATAAGCAGAGGAATGTTGCAT CCTGGTGAACATCTTCTTGTTGAAATAAGCTAGAGGATACCCATGTTAAGAGAGCACTGCCCCAATTGCCACAGCAGACGCATTGGTTTCAATGACAAAG GGTGACAAGAAATCAGGAAATTGCAACACTGGTGTTATTGTCATAGATTTTTTGAGATTTGCAAAGGCGGATTGTGCCTCGTTTGTCCATGTAAACTGTT GTAATCTTAACAAATCAGTGAGTGGAGCAGTGATAAAGGTATAATGCCGAACAGACTTTCGATAGAACCCTGTGAGGCCCAGGAAGCCCCTGAGAGTCGT GAGAGAACGAGGTGGTGGCTAATCCACCATTGCTTGTATCTTATCTGGGTATGGTTGCACCTTGCCTGATGTGATAATGTGTTTGTGATAAGTAACAGAC GCAACACCAAAAGAGCACTTAGAAAATTTGGCATAAAATTGATTAGCAACCAATAGGTCCAATACAACATGCAAATGAGCTAAATGATCATCTAAACAAG TGTTGTACATAAGTATATTATCAAAGAATACCAATATGAATCGCCGCAGATGTGGCCTTAAAAGGTTATTCATAGCCGCCTGAAATGTAGACGGCATATT AGTTAGCCCAAATGACATAATTAGGAACTCATAATGTCCATCAAAGGTACGAAATGTCATCTCGTGTGTATCCCCTGAATGCACACAGATTTGGTGGTAT CCCGAGCGGAGATTAATTTTAGAGAATATAGTGGCAACACCAAGTTCACCCAGTAACTCCTCAATTGTCGGAATAGGAAAATGGTCCCGAACTGTCAGGG CATTCAGTGCCCGATAATCCACACAGAATCTCCATGTCCCATCTTTCTTTTTAACCAGTAAAACAGGGAAAGAGAAAGGGCTGGTACTTGGGGTTATTAT GCCCTCGTTGGTATTGAGGGTATCTATAGGGCTTCAGTGATAACGGGGTAGAATTTGGAAGAAGAGTAATATGATGGTCATGTGGTCTAGGTGGAGGTTG GCCTTATGGGTTTTGTAATAATGGTTGTAAGGTGGAGAGTAGGTTAGTTATAGCTGGATGGACATTGGAATTGTTAGGTATATCAGGTGAGGTTTTAGTT GTCATGGGTAAGGAAGGTAATTGTGTGTAAGGAAGCTATTGTGTCAGTGTGGAATAGGCGGTTGAGATGGTTTAAAGTAGAGGGTGAGTAGGATTGTGAG GAGTCCCCTTGGAGAGTGATAGTGTTGTCGCCCACCTTAAATGACATTGAAGGAATAGCAAAATCTGATGTTACCAGCCCAAGTGTCCCTAGCCACTCAA TTCCTAGGATGACATCTACTCCCTTTATATGAAGTAAATATAGAGGAATGTGAAATAACTGATTTTGCATCATAATTGGGGTGTTGGAGCACAACCCCGA GCAATAAATATGCGCCCCATTTCTCACCATGACTGGAAATTGTGGGGTAGGGGAAATCTTTAGTTGCTAGTAGTTCGCCAACCTTGGTTGTATAACATTA TGTGAGCTTCCAGTATACACTAAAATTGTGACCGGTTGTCCTGCAATAGAGCCCTGAAACCGAAGTGTTTTGGGAGAGGGTTGTCCCTCTAGGGCTTGTT CAGAAAGTTGAAAATGTATAAATTCATCTTGGTTGTCTTGGTGTTCAACTTCTGTATTCTCAAGACTGGACATAAAAGTGTCTGTCGGTGGTGGTGAATC ATCCACCATAACCAGTAAGAAACGCTGGCATTTAAGTCCAGCGTGAAATTTCTCATCACAATTGTAGCAAAGTCTTTGTGCCCGTCGCTCCTACATTTGT GCAGTTGTGAGGCGATGTATGGGTATAGTTGGTTGTTTTGTTTGAGTGGGTGGAACTTGGTTTGGAAGTGTGTTTGGTTTTGTGTATTGGAATGGCTGAG TAGTGTTTAGGTAATGAGGTTGTTTAGTGAAGGGTGTTTTAGAGTCCTTGATCTTTGATTCAACCAACTTAGCTAGGCCCAATTAATCAGTAATATTAGT GGGACAAAAGATAGGAAGTTCCCTTTGAATTTCAACATTAAGACCAAATAAAAAATAATTAAGAATTACCTCTAGTGGTTAACCCCAAATTAATTTACAA TTTTTCTCAAAGTGTTGTTGATAGTTTGCAACAGATCCTATTTGGCGGAGCTTAAAGAGTTATGTCTGATGATTTTCATAGCATGATGGTCCAAAACGTG TCTCTAGTGAGCGAGTGAAACTCTCCCAATCAGTAAAGTTGTAGTTGTGAAAAGCCCACTTAAACCAACTAAGTGCCCCTCCCTTCATATAGAATGAAAT AAGATGTAGGCGTTGGTCTGGAGGAATTTGACATGGCTGAAAAGTTGTTCAGCTTGAAAAAGTCAGTCTAGAGGTTTGGAGCCATCAAATGGAATTAGTT GAAGCTTCAGAGGTCTTGGTTGAGGTGGAGGGTTGGTCGTAGGAGTGTAGATTGGACGGACATAGGGGTTATGTGTGAAAAAAAGGGGAAACATGGAGTT GGTATAGTTGGGAAAGAAGTTAGGTGTTGTTTGTGGTTGTGGAAAGGGTGGAACAACATTTGTGGGGTTGGGAGGAGATGTAGTGGATGAACTAGTTGTG CAGAAGGTGGAGGAGTTGGATCTGGGGTTGAGGAGGGGGGAATGGTTATTGTGGCTAATTTATCAGTGGTTCTATGGAGGGCCTCCGCAATTGCTTCATG CCTAAAATCCTATTGATCTTGATGCTCCTTAAGTTCTCTGTAAAAAGTTGTAACAATGTATCATCCATCTCCTTGCTAACAGCTTTGGGAGGCATGATAC AAGAATGAAAGCACCAGAATGTTACAGAATTTCTAGTGAGAAGAGATTAAGAACCTAGAATTATTGAAATAACTATCTAACCAAGGATAGAAAATACTGA ATAATACTTCATTGATTGTTTTTCTGCAGCAACAACCACATACATATATACTTTCAAGCAGTTTTTAGGGTTTACATCCTAATTGGGCTTACGTATTGGC CCAATATTTTAATTGAAATAACAACTGAAAATATATTAAAATTCATTTAATATAATCTACAAGTCATTTACCTCTTTGTCTATTTCTTTTGGGTCTAGTT GGGTCATCTGCTCTTGGACTATTATCAGTCTTTTGTCTTAAACTTATTAACAAGGTGGCCTTTAACCTGTTCAATCTTCATAGTGTTGTTTCCGGCTAGC ACTAGATCATCTACATATACTAAAAGAGCTGTAAAATCCTTCCTGTAAGCTTTAGTGAATGAGGAATGATCATGATGAGATTGATTGTACTCAAAGGAAA GCAAGAAGTTGGATAACTTGTTGTACCATTGTTTGCCTGAGTCCATAAAGGGACTTATGCAGTTTGCAGACCCTTCTGCAGTCTACTAAAGTGGGCGCTT TGTTAACATTGACATAGAATAAGTGAACCCTAAGTTTTCATTGAACAAAACAGTCAGCACTACGGTGGACACAAGACCGACACTAATTAAGTCCTCAACA TCAGTTTATTTCTTTCTAATTTTGTGTTGCCTAGCAAAAGCCAACGCTAATAGCCAATTTTCTTGTAAATTTCTTGTAGGTTGAAATTGTCATAGTAGAG AGCACCGAGTCTCATTAAAGTTATGAGTGTAATATTTATGCACTAATAATATAAAGATTTATATATAGTCAATATATTATCCACTTTTATTTTAATTAAA TGTATGGTGAATGATATATTGACAGTGTTAACATATCTTACAGGGTTATCATATGCATATTTTCCTCTAAAAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_175276; 
Additional information-

Expression of Ll_transcript_279488

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_279488

Blastp-
BlastxTransposon Tf2-6 polyprotein from Schizosaccharomyces with 29.98% of identity
Eggnog-
Kegg-
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019450597.1)
Pfam-
Rfam-
GO-