| Id Trinity | TRINITY_DN50189_c2_g2_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_279465 |
| Sequence | AGGAAAGGGTGGAAATCCCTAAATAGAAGATTTGGGGAAATTCCCAAATTCGTCTCCTTCTCCTTTTCGCACCTTCTTCGTCTCATAGGCGGCGATGAGT TCACACCGACGGTAATAATGCCTCAGAGCCGTCGTCCATCCATCTCTCTTCCTCGATGCATCTTCTTCCTCGGTGCATCTTCTTCATGATCTATTCCTCT CCAGTCCACCTCCGTACCCGCCGGTGCCTTCGTCGCAAACGCCTGACACCCTACGGACAGATTTGGCCGGATTCCGTTGAGAACCAGCGATCTGCACGGG CTCAACAGTGGCGATAGACCTTCCGTCGAAGCAAACTCTGGTTTCATTACCTGGCAACATAGATTCACCGTCGGAGATTTCCACACCGCCGCCGCGCTAA CCGTCGCAGTGGTGTCTCCTGATGTGGAATCTGATGATATTGGAGTCCCGGCAAGGCTTCCGATCTTGGTAGAGATTCCTACATCAACAAGAAACAATCA CTGATACAGATGTATGACCGGCTGCTCCATCAACAACAAAATTGTATGCCTAATGCATTTGTTTCGGGGCCGGACAAAAATGAGTGTTCACACATTTTGC TCTGAGTCTCCATTGATAGTTGTGTCGTGATTGGAAAAAATATCTTCACCAATTAATGGTGGGATGTGTTTTGAATCACCTTTTTAAAATTAAATGTGTG GTGGAGAGAGTTTGTCCACTGGCACACAGCTTGGAGCACTGCCCAAGGCATTAATTGAAGGAAATAATTGAGTGGATTGATTTAAATCAGGAGAGAGAAT AGGACTAGACAGTCTAGATTGATCCATTAATTTAAAGAGTGGTGAGTGTGTTAGGCGGGTTCCATGAGGCAGTGTACCTTGCGAGTGAAGTGGGGAGTTA 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GTGGAACAACATTTGTGGGGTTGGGAGGAGATGTAGTGGATGAACTAGTTGTGCAGAAGGTGGAGGAGTTGGATCTGGGGTTGAGGAGGGGGGAATGGTT ATTGTGGCTAATTTATCAGTGGTTCTATGGAGGGCCTCCGCAATTGCTTCATGCCTAAAATCCTATTGATCTTGATGCTCCTTAAGTTCTCTGTAAAAAG TTGTAACAATGTATCATCCATCTCCTTGCTAACAGCTTTGGGAGGCATGATACAAGAATGAAAGCACCAGAATGTTACAGAATTTCTAGTGAGAAGAGAT TAAGAACCTAGAATTATTGAAATAACTATCTAACCAAGGATAGAAAATACTGAATAATACTTCATTGATTGTTTTTCTGCAGCAACAACCACATACATAT ATACTTTCAAGCAGTTTTTAGGGTTTACATCCTAATTGGGCTTACGTATTGGCCCAATATTTTAATTGAAATAACAACTGAAAATATATTAAAATTCATT TAATATAATCTACAAGTCATTTACCTCTTTGTCTATTTCTTTTGGGTCTAGTTGGGTCATCTGCTCTTGGACTATTATCAGTCTTTTGTCTTAAACTTAT TAACAAGGTGGCCTTTAACCTGTTCAATCTTCATAGTGTTGTTTCCGGCTAGCACTAGATCATCTACATATACTAAAAGAGCTGTAAAATCCTTCCTGTA AGCTTTAGTGAATGAGGAATGATCATGATGAGATTGATTGTACTCAAAGGAAAGCAAGAAGTTGGATAACTTGTTGTACCATTGTTGCCTGAGTCCATAA AGGGACTTATGCAGTTTGCAGACCCTTCTGCAGTCTACTAAAGTGGGCGCTTTGTTAACATTGACATAGAATAAGTGAACCCTAAGTTTTCATTGAACAA AACAGTCAGCACTACGGTGGACACAAGACCGACACTAATTAAGTCCTCAACATCAGTTTAT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_175276; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_279465
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Transposon Tf2-9 polyprotein from Schizosaccharomyces with 28.4% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450597.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |