Id Trinity | TRINITY_DN50189_c2_g2_i4 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_279467 |
Sequence | AAGGCATTAAAAAGGAATGGTAACAATCTGTTACCTCCTTTCACGTAAGAAAGGGTGGAAATCTCTAAATAGAAGATTTGGGGAAATTCCCAAATTCGTC TCCTTCTCCTTTTCGCACCTTCTTCGTCTCATAGGCGGCGATGAGTTCACACCGACGGTAATAATGCCTCAGAGCCGTCGTCCATCCATCTCTCTTCCTC GATGCATCTTCTTCCTCGGTGCATCTTCTTCATGATCTATTCCTCTCCAGTCCACCTCCGTACCCGCCGGTGCCTTCGTCGCAAACGCCTGACACCCTAC GGACAGATTTGGCCGGATTCCGTTGAGAACCAGCGATCTGCACGGGCTCAACAGTGGCGATAGACCTTCCGTCGAAGCAAACTCTGGTTTCATTACCTGG CAACATAGATTCACCGTCGGAGATTTCCACACCGCCGCCGCGCTAACCGTCGCAGTGGTGTCTCCTGATGTGGAATCTGATGATATTGGAGTCCCGGCAA GGCTTCCGATCTTGGTAGAGATTCCTACATCAACAAGAAACAATCACTGATACAGATGTATGACCGGCTGCTCCATCAACAACAAAATTGTATGCCTAAT GCATTTGTTTCGGGGCCGGACAAAAATGAGTGTTCACACATTTTGCTCTGAGTCTCCATTGATAGTTGTGTCGTGATTGGAAAAAATATCTTCACCAATT AATGGTGGGATGTGTTTTGAATCACCTTTTTAAAATTAAATGTGTGGTGGAGAGAGTTTGTCCACTGGCACACAGCTTGGAGCACTGCCCAAGGCATTAA TTGAAGGAAATAATTGAGTGGATTGATTTAAATCAGGAGAGAGAATAGGACTAGACAGTCTAGATTGATCCATTAATTTAAAGAGTGGTGAGTGTGTTAG GCGGGTTCCATGAGGCAGTGTACCTTGCGAGTGAAGTGGGGAGTTAAAACACTTTTACTCCCAATTAATTCATTTTCATTATTTTCTCTGAGGGAAACCA CATACTCCTTCTTTTTCTCTTCCTTCATCTTTCCCAACTCTTCCACTATCTTCTCTTTTTTAACACACTTCTCTTCATCTCTAGCCATTTCAATCGGTGA AGGAGTATCTTCATCAGTCACCATTGTATTTTCAGAACCTGTGATAAGAGGATGAGCCTCCTCATGTCCAACCATATGGTTCTCGGTTGCTGTCCTTGTT CCATTTTCGTTTTTAGAACCTGTGATAAGAAAATGAGCCTCCTCATGTACAATCATCCGCTTCTCGGGTTCTGTCCTTGGTCCATTTCCCCCCCCCCCCC CTTCTTCAACAGTGTTCTGGGAGGAGCCATTTAAATCAGTTGGAGCCATGTCAAAACCTGGTGGTAACTCCATGGCGGTCTCAGGCGCTGGGTCGTGGAA ACATCTCTAAGCTGAAATGTGGAAAACAGGGTGAACCCGTGACTGAGTTGGTAAGGTCAGTTCACACACAACTTGTCCTATCCGTTTCACAACCTTGAAT GGACCGAAGTATCAGCATGAAAGCTTCTTGGATGGCCTTCGGAAAACTGATTGTTGGTGATATGGTTGTAACCGTAACAAGACTCAGTCTCCTGGAGTAA AGGTGTCACTAATCACCGTGTTAGTTGTTGTGTCGGGAATGTAATATTGGAGTTTGGGAGGAGCTCAATCGTACAAGGCCTCAAACGAAGATAGTTGAAT GGTCGAATGGTAGCTGGTGTTGTACCAGAACTCAGCTAACGGTAGACAAGTGAACCACGTTTCGGGGCGAGAACTTGTGAGGCATCGAAGGTAAGTCTGT AACCCTCTATTTATTACTTCTATTTGACCATCTGATTGAGGATGATATGATGTACTGTAGCAAAGTGTAGTCCCTAACAATGTAAACAATTCCTTCCAAA ACGCACTTAGGAATATTTTATCACGGTCTGAGACAATTGTCTTGAGAACCCCATGAAGCCGACAGATTTCGTTGAGAAATCAATGAGCTAGGCTCTCGGC TGTAAACTTAGTTGGAAGGTCAATGAAGTGGACATATTTAGTGAGTCTATCCACAATGACCCAGATCACAGTATGCCCATGAGACATTGTCAGATGTGTC ACAAAATTCATAGATAGATCCTCCCATACCTTTTCTGGAATTTGTAGTGGTTGTAACATGCCTTGGTATTTCTTGGGAAGGTACTTGTTGGATTGACAGA CACAACATTAGTGGACAAAAAGCTTAACTTGCTTAGTGATGCCTGACCAAGAGAAAGCAACCGAGAGTCTGACTAGGGTGGCCTTCCAACCCGAGTGACC TGCTATTGGAGTATCATGATATTCATGGATCAAGGAGATACGCAGGTTGTCGAGGTCAGGTATAAAAATTCGTCCCTTGTAGAACAATAAACCTTGTGAA AAATGGTATGACCTATGCTCACTGTTTTCTGATTCTTGTTTCTTGATGATGGCATGCCCTTCCGGTGAGGAAAAGAAATGCCTCAAGCGGTCAATAAGTT AAGGAAATGGGGAGAACAAGGATACCATGATGGGAATGTCTTCACTACTACAACGAGATAAGGCATTTGCAACCCGATTTGAAGTACATGTCCTATACTT GATAATATACTAAAATCCTATTAACTGTGTTGCCCATTCCTGCTGCTCTAGTGTTTGAAACCCTTGAGTCATCAAGTGTCTAAAACTTTGTTGATCAGTA TATATTGTAAATTGTTTGCCTAATAAGTATTGTCTTCATTTCTTAACATATTCTGTCACAACAAACATTTCACGGACATAAGCAGAGGAATGTTGCATCC TGGTGAACATCTTCTTGTTGAAATAAGCTAGAGGATACCCATGTTAAGAGAGCACTGCCCCAATTGCCACAGCAGACGCATTGGTTTCAATGACAAAGGG TGACAAGAAATCAGGAAATTGCAACACTGGTGTTATTGTCATAGATTTTTTGAGATTTGCAAAGGCGGATTGTGCCTCGTTTGTCCATGTAAACTGTTGT AATCTTAACAAATCAGTGAGTGGAGCAGTGATAAAGGTATAATGCCGAACAGACTTTCGATAGAACCCTGTGAGGCCCAGGAAGCCCCTGAGAGTCGTGA GAGAACGAGGTGGTGGCTAATCCACCATTGCTTGTATCTTATCTGGGTATGGTTGCACCTTGCCTGATGTGATAATGTGTTTGTGATAAGTAACAGACGC AACACCAAAAGAGCACTTAGAAAATTTGGCATAAAATTGATTAGCAACCAATAGGTCCAATACAACATGCAAATGAGCTAAATGATCATCTAAACAAGTG TTGTACATAAGTATATTATCAAAGAATACCAATATGAATCGCCGCAGATGTGGCCTTAAAAGGTTATTCATAGCCGCCTGAAATGTAGACGGCATATTAG TTAGCCCAAATGACATAATTAGGAACTCATAATGTCCATCAAAGGTACGAAATGTCATCTCGTGTGTATCCCCTGAATGCACACAGATTTGGTGGTATCC CGAGCGGAGATTAATTTTAGAGAATATAGTGGCAACACCAAGTTCACCCAGTAACTCCTCAATTGTCGGAATAGGAAAATGGTCCCGAACTGTCAGGGCA TTCAGTGCCCGATAATCCACACAGAATCTCCATGTCCCATCTTTCTTTTTAACCAGTAAAACAGGGAAAGAGAAAGGGCTGGTACTTGGGGTTATTATGC CCTCGTTGGTATTGAGGGTATCTATAGGGCTTCAGTGATAACGGGGTAGAATTTGGAAGAAGAGTAATATGATGGTCATGTGGTCTAGGTGGAGGTTGGC CTTATGGGTTTTGTAATAATGGTTGTAAGGTGGAGAGTAGGTTAGTTATAGCTGGATGGACATTGGAATTGTTAGGTATATCAGGTGAGGTTTTAGTTGT CATGGGTAAGGAAGGTAATTGTGTGTAAGGAAGCTATTGTGTCAGTGTGGAATAGGCGGTTGAGATGGTTTAAAGTAGAGGGTGAGTAGGATTGTGAGGA GTCCCCTTGGAGAGTGATAGTGTTGTCGCCCACCTTAAATGACATTGAAGGAATAGCAAAATCTGATGTTACCAGCCCAAGTGTCCCTAGCCACTCAATT CCTAGGATGACATCTACTCCCTTTATATGAAGTAAATATAGAGGAATGTGAAATAACTGATTTTGCATCATAATTGGGGTGTTGGAGCACAACCCCGAGC AATAAATATGCGCCCCATTTCTCACCATGACTGGAAATTGTGGGGTAGGGGAAATCTTTAGTTGCTAGTAGTTCGCCAACCTTGGTTGTATAACATTATG TGAGCTTCCAGTATACACTAAAATTGTGACCGGTTGTCCTGCAATAGAGCCCTGAAACCGAAGTGTTTTGGGAGAGGGTTGTCCCTCTAGGGCTTGTTCA GAAAGTTGAAAATGTATAAATTCATCTTGGTTGTCTTGGTGTTCAACTTCTGTATTCTCAAGACTGGACATAAAAGTGTCTGTCGGTGGTGGTGAATCAT CCACCATAACCAGTAAGAAACGCTGGCATTTAAGTCCAGCGTGAAATTTCTCATCACAATTGTAGCAAAGTCTTTGTGCCCGTCGCTCCTACATTTGTGC AGTTGTGAGGCGATGTATGGGTATAGTTGGTTGTTTTGTTTGAGTGGGTGGAACTTGGTTTGGAAGTGTGTTTGGTTTTGTGTATTGGAATGGCTGAGTA GTGTTTAGGTAATGAGGTTGTTTAGTGAAGGGTGTTTTAGAGTCCTTGATCTTTGATTCAACCAACTTAGCTAGGCCCAATTAATCAGTAATATTAGTGG GACAAAAGATAGGAAGTTCCCTTTGAATTTCAACATTAAGACCAAATAAAAAATAATTAAGAATTACCTCTAGTGGTTAACCCCAAATTAATTTACAATT TTTCTCAAAGTGTTGTTGATAGTTTGCAACAGATCCTATTTGGCGGAGCTTAAAGAGTTATGTCTGATGATTTTCATAGCATGATGGTCCAAAACGTGTC TCTAGTGAGCGAGTGAAACTCTCCCAATCAGTAAAGTTGTAGTTGTGAAAAGCCCACTTAAACCAACTAAGTGCCCCTCCCTTCATATAGAATGAAATAA GATGTAGGCGTTGGTCTGGAGGAATTTGACATGGCTGAAAAGTTGTTCAGCTTGAAAAAGTCAGTCTAGAGGTTTGGAGCCATCAAATGGAATTAGTTGA AGCTTCAGAGGTCTTGGTTGAGGTGGAGGGTTGGTCGTAGGAGTGTAGATTGGACGGACATAGGGGTTATGTGTGAAAAAAAGGGGAAACATGGAGTTGG TATAGTTGGGAAAGAAGTTAGGTGTTGTTTGTGGTTGTGGAAAGGGTGGAACAACATTTGTGGGGTTGGGAGGAGATGTAGTGGATGAACTAGTTGTGCA GAAGGTGGAGGAGTTGGATCTGGGGTTGAGGAGGGGGGAATGGTTATTGTGGCTAATTTATCAGTGGTTCTATGGAGGGCCTCCGCAATTGCTTCATGCC TAAAATCCTATTGATCTTGATGCTCCTTAAGTTCTCTGTAAAAAGTTGTAACAATGTATCATCCATCTCCTTGCTAACAGCTTTGGGAGGCATGATACAA GAATGAAAGCACCAGAATGTTACAGAATTTCTAGTGAGAAGAGATTAAGAACCTAGAATTATTGAAATAACTATCTAACCAAGGATAGAAAATACTGAAT AATACTTCATTGATTGTTTTTCTGCAGCAACAACCACATACATATATACTTTCAAGCAGTTTTTAGGGTTTACATCCTAATTGGGCTTACGTATTGGCCC AATATTTTAATTGAAATAACAACTGAAAATATATTAAAATTCATTTAATATAATCTACAAGTCATTTACCTCTTTGTCTATTTCTTTTGGGTCTAGTTGG GTCATCTGCTCTTGGACTATTATCAGTCTTTTGTCTTAAACTTATTAACAAGGTGGCCTTTAACCTGTTCAATCTTCATAGTGTTGTTTCCGGCTAGCAC TAGATCATCTACATATACTAAAAGAGCTGTAAAATCCTTCCTGTAAGCTTTAGTGAATGAGGAATGATCATGATGAGATTGATTGTACTCAAAGGAAAGC AAGAAGTTGGATAACTTGTTGTACCATTGTTTGCCTGAGTCCATAAAGGGACTTATGCAGTTTGCAGACCCTTCTGCAGTCTACTAAAGTGGGCGCTTTG TTAACATTGACATAGAATAAGTGAACCCTAAGTTTTCATTGAACAAAACAGTCAGCACTACGGTGGACACAAGACCGACACTAATTAAGTCCTCAACATC AGTTTATTTCTTTCTAATTTTGTGTTGCCTAGCAAAAGCCAACGCTAATAGCCAATTTTCTTGTAAATTTCTTGTAGGTTGAAATTGTCATAGTAGAGAG CACCGAGTCTCATTAAAGTTATGAGTGTAATATTTATGCACTAATAATATAAAGATTTATATATAGTCAATATATTATCCACTTTTATTTTAATTAAATG TATGGTGAATGATATATTGACAGTGTTAACATATCTTACAGGGTTATCATATGCATATTTTCCTCTAAAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_175276; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_279467
Blastp | - |
---|---|
Blastx | Transposon Tf2-9 polyprotein from Schizosaccharomyces with 29.32% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450597.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |