Ll_transcript_498685

• Id Trinity: TRINITY_DN50200_c1_g1_i11
• Name Transcript: Ll_transcript_498685
• Sequence: GAGAATAATCACCCTTCCAATTTCATAATGGCTAAAACCTCCTTCAAGCTTCAACATCCTTTGGGTACAGTACGCTTTATTATTATTATTATTATTTTAT TTTCTAATAATCTCATATTTGTTGGAAATGGAAACCCTTTGATTGGTTGAATTGAATTCTTAGTGTTATTCCTTTGGGATTGTAAAAAGTTTACTTCTTT GTAGTTTTTACATTGTTTAATTTTTTTAGAGTGATTGTTCTTATGAAATTCTAAAACCCTTTTTTAAATCCCGTTTGATTGGTTGAATTCAACGTTCATG TCTTTTGTATTGTAAACAAATTACTTGTTTTGCTGTTAATTTATTTCTCAGTTTTGATTCTCTACTATGATAATTATGTTCACGATTATTTTTCATATGT GATTCTAAAACCCCTTTTATAGGAGGTAAGTTGTTATTTGAAACAAATAAAAAACATTCCAATTGAGTGAATTTGCTAACTGCTTATCTTTTTCTACATG TCAGAAAGAAGACAGGCTGAGGCTTCCCGCATTAGAGAGAAGTATCCTGATAGAATACCCGTAAGATTTTACGGCGTAGAATATCGATTCTTGTGGTGTT TGTTTTTTGTTGAAGCACTCTTGTTGAGATATATGGTGATTATATGCAGGTGATTGTGGAGAAGGCTGAAAGAAGTGACATTCCAGACATTGATAAGAAG AAGTAAGATATTTTCTGATTCTATTTCGTTCCGTTTGATCAATTTTCAGGCCTGAGATTGAGAATACAGTTTTTTTTGCTTTAATGGTTTTTACTTTTTT TGCTTGATTTTTTCTGTTAATATTTTTTAAGGTTTCTATTTTTGTTGTGGTAGTATTATTGGCAATTAACCTCAATGTATACTGCATTCTGCATATGTTG AGATACTCTTTTGATTTACCCATCTCGAAAGTGAAGTTACCTTCAACAATATACATTGAGGTATATGAGATTATGGGTGGTATTGAAGCTTGAAGGACCA AACCTTATTTTCTTTCCACATTTCAGCAATCAAGGATTACAATAGATACTAATCTTGGCTGATGCATATGGTTGATCTGATTCTGTGCATTCTCAATTAA TTTTGTTGCTCTTATCGTGACGTTGTAGATACCTTGTCCCAGCTGATTTGACTGTCGGCCAGTTTGTTTATGTTGTCCGCAAAAGAATTAAGCTCAGTGC AGAGAAGGCTATTTTTGTTTTCATCAACAACACTCTACCTCCAACCGCTGCTTTGATGTCTGCTATTTATGAGGAAAATAAGGATCATGATGGCTTTCTA TACATGACTTACAGTGGAGAGAACACCTTTGGATCCCAATAGAGATAATTTGTGTCAACCTCTGTAAATATCTTCTGCAAGATGTAAATTCTCTGCAGTT AATTGCCAATAAATGGCCTATTGAGCATAGTCATTCTACTACACTTTGATTATGCTCATTCTCTTTCTTCCCCTCCAAATAAACTATATATGTACAACTT TTGATTTATTAATGAAATATATGCTCTCTCCTCCCATTTCTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_175395;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_498685

FPKM

• PAB: 12.7
• PNAB: 0.5
• PS1: 0.6
• PS2: 0.6
• PS3: 0.6
• PW1: 0.9
• PW2: 0.5
• PW3: 1.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_498685

• Blastp: -
• Blastx: Autophagy-related protein 8A from Oryza sativa with 88.89% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019418123.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: -