Id Trinity | TRINITY_DN50213_c0_g1_i10 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_497988 |
Sequence | GCTTAATGATATAATTAATAATAATAATGGATAATTGATATGATGAGAGTTACGAAGTGTTGCGATTGAAATAAGAAGAAAAAATAGAAAGGAAAAGGAG TTGCGTAACAACACGACACAAATTTGGCAATCACATCAAAAAGACGTAATTCCATTGCTCTTTCCTTCCTTTAACTCCTTCCTCTGCCCCTCACTCTCAC CTTTATCTATTCCTATTTTTTTCTATACACTATTTTGATTCACTGCTGAAACTTGTTTCTATTTCTTAATCTGAGAGAGATTCTATAAAAATATTAGAAG GTGTGTGAGTCCTGAAGAGTGGTGTAATGGCGTCGGGGAAAGTGGTTGGGTTCGTTGGGTTGGATCAATTAAGCGTGAAGATGGCGTCATCGCTCATTTC CCATGGCTATGCTCTCCAAGCTTTTGAGATAAGTGATCCGACGATCGAAGAGCTTTTGAAGCTTGGAGGAACTAGATGTTCAAGCCCTTGTGAAGCAGGG AGAGATGTTGCTGCTTTAGTTGTCCTAATTTCTCATGTGGATCAAATTAAAGATCTAATTTTTGGTGATGAGGGTGTTTTGAAAGCCCTAAAATCGGATA CAGTTCTTATTCTCCGTTCAACCATATTACCATCAGCTCTCCATAAACTGGAAAAGGATCTGGCAGAAATTCATGAGATAGCTTATATTGTTGACGCATA TGTCTCTCATGGGAGGTCTGATGCTATGAATGGAAAAGTTATTATTGCATCATCTGGAAGACCAGATGCCATCGCAAGAGCACGGCCTTTGCTTTCTGCA ATGTGTGAAAAGCTTTTCACTTTTGATGGTGAAATTAGTGGTGCCAGTAAGGTTAAAATGGTCACTGAGCTGCTAGAGGCCATTCACTTCATTGCTTCTG TGGAGGCTCTTTCTCTTGGTACTAAAGCTGGTATTCATCCGTGGATAATCTATGATATAATTTCCAATGCCGCTGGAAATTCATGGGTATTCAAGAATAA TGTTCCTCTATTGTTGAAGGGAGAGGTTAAGCATCACATTCTAAAATCTCTTGTTAAGGAGCTGGAAATCATTTTGGATATGGCCAAGTCACTTACTTTT CCACTTCCACTTTTGGCTGCTTCTCATCAACAACTTATTCAAGGTGTTTCAGTTTCAACTGTTTGTTGTGAAGATGATGATGATGGTACAGCATTGATTA AGGTTTGGGAAAGCATTTATGGGGTGAAGTTTTCAGATGCTGCAAATGCAGATGCATACAGCCCTGAAAAACTGGCATCTGAAATTACAGCTGATTCTAA GAGTGTAAAACGGGTTGGTTTTATTGGCCTTGGAGCGATGGGATTTGGCATGGCAACTCACTTGCTGAGTTCAAATTTCAGCGTAGTTGGTTATGATGTG TATAAACCAACTCTAATTCGATTTGCCAATGCTGGTGGCTTGATTGGAAATTCTCCAGCAGAAGTGGGTAAAGGTAAATTGATACATACATGTAGACATA AAAATAAGCTGATAAAGCAGTGAACAAGACGAAAAAAGTATGGCTTTCAACCCATTTCTTCGATGAAGTCTTACCTGGTGTAAAAATGAAATTGCCTGAG ATTTTGGTCATGGCAATAGAGCTAGATTTCCTAAAGTTGTAAATAGTGTAAAATAAGTCATAGTTTAACATGATTTTTGTTATGAGGGCACTCTCTACTC TTTAAACATAGACAATTATTGATTCCCATGCCATGATGAATTACAAAATTTATGATTTGGTGAAAAGTTCTCAACTCCTTTAGTATGTAAGTTCAATAAT CATATTATTGAATACAAGAATAATGATACCATTTTGATTTATTTGGATTTGAATTTTTAAGGATTAAGGATGGCATTAGGAGTTGTTGTACAGTTTTTAT GTTCTTGATCTTGTATATGTCCTTCTTGTGTGTACTAGTTATAATGCTAAGTTTTGATTGTATAAGAGAATGTGCTAGATTCCTACAAATAAAAATTTCT CATGCTCATTTGGGATCCGGTGCATGAAGAAATTATCTACATATTATTCTTCCAGATGTTGATGTTCTCATAATCATGGTCACAAACGAAGCTCAAGCAG AGAGTGCCTTATATGGAGAATATGGTGCAGTTTCAGTACTTCCACCGGGAGCATCTGTCATTCTTTCTTCTACTGTTTCTCCAGCATATGTGAGTCAGCT AGAGCGCAGATTACATAATGAAGGTAAGAATTTGAAGCTGGTGGATGCCCCTGTTTCTGGCGGTGTTAAGAGGGCCTCAATGGGAACACTTACGATAATG GCTTCGGGGTCCAATGCTGCCCTTAAGGATGCTGGTTTAGTCCTAGCAGCCTTGAGTGAGAAGCTTTATGTTATCAAAGATGGTTGTGGTTCTGGAAGTG GAATAAAGATGGTCAACCAGTTGCTCGCTGGAGTTCATATAGCATCAGCAGCTGAGGCAATGGCTTTTGCAGCACGGTTGGGTCTGAATACAAGAATTCT GTTCGATTATATAACAATTAGTGGGGGAACATCCTGGATGTTTGAAAATCGTGTCCCACACATGCTAGACAATGATTACACACCATATTCAGCACTTGAT ATCTTTGTTAAGGACATGGGAATTGTTACTCGTGAATCATCTTCTTGGAAAGTACCACTTCACCTATCAGCTACTGCTCACCAACTATATCTATCAGGTT CTGCTGCTGGTTGGGGACGGCAAGATGATGCTGGTGTGGTGAAGGTTTATGAAGCATTAACTGGTGTTAGAGTTGAAGGAAAACCACAAGCTCTTAAGAA AGACGTTGTGTTGCATTCTCTTCCACCCGAGTGGCCACAAGATCCTCTTCCTGATATAAAGAGACTAAACGGAATCAGCTCAAAGGTTTTGATTGTTCTA GACGATGATCCAACAGGAACACAAACTGTTCATGATATTGAGGTATTAACAGAATGGAGTATTCAGTCACTGATTGAGCAGTTTAGAAAAAGTCCAAAAT GCTTTTTCATTTTGACAAACTCCAGGTCTCTGAGTTCTGAGAAGGCAAGTGCATTGATAAGAGAAATTTGCAGAAATCTAGCTAGTGCAGCAAAATCAGT TGACAACATTGATTATACAGTAGTTTTGAGGGGAGATTCAACTTTGCGTGGTCATTTTCCAGAGGAAGCGGATGCTGCTATTTCAGTATTGGGTGAAATG GATGCATGGATAATTTGTCCCTTTTTCCTTCAAGGTGGCCGTTACACTATCGAAGACATACACTATGTTGCTGATTCTGATATCCTTCTTCCTGCAGGGG ACACAGAGTTTGCCAAAGATGCTTCCTTTGGCTATAAATCTTCAAATTTGCGCAATGTAAACAATTTGATCAGTTTTTTCAAAATTGGCCGTGGTGATTT ATATTACATATTTTTTAGTAAATATAATAAATTTCTGGAATGCTTTTTATTCACATATAGTGGGTAGAGGAGAAGACAGGTGGGCGAATACCTGCAAGTG CTGTTGAATCCATTTCTATCCAACTTTTGAGGAAAGGGGGACCAGATGCAGTTTGTCAACATCTATGCAATTTGAAGAAGGGATCAGTATGTATAGTTAA TTCAGCTAGTGAAAGAGATATGGCTGTATTTGCACTTGGAATGATCAAGGCAGAATTGATGAAGAAGCGTTTCTTAAGTCGCACTGCTGCTAGTTTTGTT TCTTCCCGCATTGGAATCATCTCTAAGCCTCCAATATTGCCAAAGGATCTCGGAATAGCTAGAGAAAGGAATGGTGGTTTGATAGTTGTGGGATCATATG TTCCAAAAACAACCAAGCAGGTTGAAGAGCTTAAATTACAGTGTGGTCATTTTTTAAGAAGCATTGAGGTATCGGTTGAAAAACTTGTGATGCAGCCTAT TGAGGAGAGGGAGGAAGAAATCAGTAAAGCAGCTCAATTGGCAGATGTTTATCTTAAATCTCATAAAGACACTCTTATATTGACTAGCCGGAATCTCATA ACTGGAAAAAATGCCTCTGAAAGTTTGGACATAAACTTCAAAGTCAGTTCTGCTTTGGTGGAAATAGTGAAAAGAATAACTACAAAACCTCGCTATATAC TAGCAAAGGGTGGTATTACCTCTTCAGATCTTGCTACGAAAGCCCTTGGTGCAAAATGTGCCAAGATAGTTGGACAAGCACTTGCTGGCATTCCCTTGTG GCAATTAGGCACTGAAAGTAGACATCCTGGAGTTCCGTACATTGTTTTCCCTGGTAATGTTGGTGACAGCAGAGCATTGGCAGAAGTTGTGAGGTCTTGG ACTCGTCCAACCAGACTTTCTTCAATAAAAGATATTCTTAACAATGCAGAAAAGGGTGGGTATGCTGTTGGAGCATTTAACGTCTATAATCTGGAAGGCG TTGAGGCTGTTGTTTCTGCTGCAGAGGAAGAACAAAGCCCGGCTATATTACAGGTCTGAAACAGACAGTTCAAAATGTTTATACAAAATGTTTTAAAAAA TGAGGGAACATAAGAGACAGGAAGAAAAAGCAAAAAGTAAATTAAGAGTTTTAAGCTTGATTTCATGACCTTCCAGATTGACAGACCTAGTTTCTATAGA AAGTTAGTTCAAGGGGGTCTGGATGTCCATAGCTGTGAAACCCAAGAGCTGAGGCTAGATACTGAAGAGTATGTTAGTTGAGATCCAGGTCTGGTGGGAC AGTTTCTTTTCCATTTTATTAATGATTGAATCTAACTCTTTCTGAGCTATAGTGATTGCAAGACTCTTCAAACCAAGATAGATAGAGAGGTTTACATTTA ACTTTAAGGATACAGGGGGTAACCATATGATTTTATGTGTTCAGGATTAGAATCTTTTCACAAATTCCTTTGGAATTCCTTGATGATCCATCCTGTCCAT TTGTTCCCGCAGACTCAGATGCCTTCTGTTTTTTAAGCTACCTCTTTGTTTCAGTTGGCTGTTTTTATTTTTCATTTTATGTTCAATATATTTTTGTTCT AGAGATTAGAACTACTATTAGAAATCTGAAAATCTCCTAAAACATTGAAAGATAATCTATATATGGAAATAGGTGATTTACACTAGTCGTTCTCTAGTTG ATATATTGATCATGATAAAACTATTTTTCTTGGCCTTTCTCGCTTTAACGTCTCTGTGATCAAACTAGTTTGACGAAATAATAAATATTTGACTAATATT ATAAATTATAGCCAAACATTTAATGAAGAATTTTGATTATATATGAAGCAACTAAGCTTCATTTGTTCTTGATTGATTGTTTCATATTAATATCTCCATT CTCTGTGCATGTGTGTCATGTCAAATGTAGTTTCTTAAGATGAGTCAATTTTCTTTTTTATTTTCTCATATAAAGGTTTGGTTCCTCTAAACTAGTTGTG AATTACCTACATAATTTTCAGATCCATCCTGGTGCCTTGAAGCAAGGAGGAATTCCCTTGGTTGCTTGTTGCATTTCTGCTGCAGAGCAAGCCAGTGTTC CCATTACTGTTCACTTTGATCATGGGACTTCAAAGCAAGATCTTGTGGAAGCTCTTGAGCTGGGATTCAGTTCTGTGATGGTTGATGGTTCACATCTTTC TTTCAATGAAAATGCTGCATACACAAAATTTATATCGTCACTGGCTCACTCGAAAGATATTTTGGTCGAAGCTGAACTAGGGAGACTGTCAGGGACAGAA GATGATTTAACGGTTGAAGAATATGAAGCCAAGCTAACTGATGCTAATTTGGCACACAAGTTCATTGATGAGACTGGCATAGATGCTTTGGCAGTCTGTA TTGGAAATGTGCATGGAAAATACCCAGCAAGTGGTCCAAAACTCAGACTTGATTTGCTTAAGGAACTGCGTGCTTTGAGCTTGAAGAAAGGAGTTTTTCT TGTGCTTCACGGAGCATCAGGCTTGTCCAAAGAGCTTGTTAAGGAATGCATAAGCCTTGGTGTT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_175491; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_497988
Blastp | L-threonate dehydrogenase from Cupriavidus with 49.16% of identity |
---|---|
Blastx | L-threonate dehydrogenase from Cupriavidus with 48.97% of identity |
Eggnog | Dehydrogenase(COG2084) |
Kegg | Link to kegg annotations (H16_A1562) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019457928.1) |
Pfam | NAD binding domain of 6-phosphogluconate dehydrogenase (PF03446.14) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |