| Id Trinity | TRINITY_DN50213_c0_g1_i16 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_497994 |
| Sequence | GCTTAATGATATAATTAATAATAATAATGGATAATTGATATGATGAGAGTTACGAAGTGTTGCGATTGAAATAAGAAGAAAAAATAGAAAGGAAAAGGAG TTGCGTAACAACACGACACAAATTTGGCAATCACATCAAAAAGACGTAATTCCATTGCTCTTTCCTTCCTTTAACTCCTTCCTCTGCCCCTCACTCTCAC CTTTATCTATTCCTATTTTTTTCTATACACTATTTTGATTCACTGCTGAAACTTGTTTCTATTTCTTAATCTGAGAGAGATTCTATAAAAATATTAGAAG GTGTGTGAGTCCTGAAGAGTGGTGTAATGGCGTCGGGGAAAGTGGTTGGGTTCGTTGGGTTGGATCAATTAAGCGTGAAGATGGCGTCATCGCTCATTTC CCATGGCTATGCTCTCCAAGCTTTTGAGATAAGTGATCCGACGATCGAAGAGCTTTTGAAGCTTGGAGGAACTAGATGTTCAAGCCCTTGTGAAGCAGGG AGAGATGTTGCTGCTTTAGTTGTCCTAATTTCTCATGTGGATCAAATTAAAGATCTAATTTTTGGTGATGAGGGTGTTTTGAAAGCCCTAAAATCGGATA CAGTTCTTATTCTCCGTTCAACCATATTACCATCAGCTCTCCATAAACTGGAAAAGGATCTGGCAGAAATTCATGAGATAGCTTATATTGTTGACGCATA TGTCTCTCATGGGAGGTCTGATGCTATGAATGGAAAAGTTATTATTGCATCATCTGGAAGACCAGATGCCATCGCAAGAGCACGGCCTTTGCTTTCTGCA ATGTGTGAAAAGCTTTTCACTTTTGATGGTGAAATTAGTGGTGCCAGTAAGGTTAAAATGGTCACTGAGCTGCTAGAGGCCATTCACTTCATTGCTTCTG TGGAGGCTCTTTCTCTTGGTACTAAAGCTGGTATTCATCCGTGGATAATCTATGATATAATTTCCAATGCCGCTGGAAATTCATGGGTATTCAAGAATAA TGTTCCTCTATTGTTGAAGGGAGAGGTTAAGCATCACATTCTAAAATCTCTTGTTAAGGAGCTGGAAATCATTTTGGATATGGCCAAGTCACTTACTTTT CCACTTCCACTTTTGGCTGCTTCTCATCAACAACTTATTCAAGGTGTTTCAGTTTCAACTGTTTGTTGTGAAGATGATGATGATGGTACAGCATTGATTA AGGTTTGGGAAAGCATTTATGGGGTGAAGTTTTCAGATGCTGCAAATGCAGATGCATACAGCCCTGAAAAACTGGCATCTGAAATTACAGCTGATTCTAA GAGTGTAAAACGGGTTGGTTTTATTGGCCTTGGAGCGATGGGATTTGGCATGGCAACTCACTTGCTGAGTTCAAATTTCAGCGTAGTTGGTTATGATGTG TATAAACCAACTCTAATTCGATTTGCCAATGCTGGTGGCTTGATTGGAAATTCTCCAGCAGAAGTGGGTAAAGGTAAATTGATACATACATGTAGACATA AAAATAAGCTGATAAAGCAGTGAACAAGACGAAAAAAGTATGGCTTTCAACCCATTTCTTCGATGAAGTCTTACCTGGTGTAAAAATGAAATTGCCTGAG ATTTTGGTCATGGCAATAGAGCTAGATTTCCTAAAGTTGTAAATAGTGTAAAATAAGTCATAGTTTAACATGATTTTTGTTATGAGGGCACTCTCTACTC TTTAAACATAGACAATTATTGATTCCCATGCCATGATGAATTACAAAATTTATGATTTGGTGAAAAGTTCTCAACTCCTTTAGTATGTAAGTTCAATAAT CATATTATTGAATACAAGAATAATGATACCATTTTGATTTATTTGGATTTGAATTTTTAAGGATTAAGGATGGCATTAGGAGTTGTTGTACAGTTTTTAT GTTCTTGATCTTGTATATGTCCTTCTTGTGTGTACTAGTTATAATGCTAAGTTTTGATTGTATAAGAGAATGTGCTAGATTCCTACAAATAAAAATTTCT CATGCTCATTTGGGATCCGGTGCATGAAGAAATTATCTACATATTATTCTTCCAGATGTTGATGTTCTCATAATCATGGTCACAAACGAAGCTCAAGCAG AGAGTGCCTTATATGGAGAATATGGTGCAGTTTCAGTACTTCCACCGGGAGCATCTGTCATTCTTTCTTCTACTGTTTCTCCAGCATATGTGAGTCAGCT AGAGCGCAGATTACATAATGAAGGTAAGAATTTGAAGCTGGTGGATGCCCCTGTTTCTGGCGGTGTTAAGAGGGCCTCAATGGGAACACTTACGATAATG GCTTCGGGGTCCAATGCTGCCCTTAAGGATGCTGGTTTAGTCCTAGCAGCCTTGAGTGAGAAGCTTTATGTTATCAAAGATGGTTGTGGTTCTGGAAGTG GAATAAAGATGGTCAACCAGTTGCTCGCTGGAGTTCATATAGCATCAGCAGCTGAGGCAATGGCTTTTGCAGCACGGTTGGGTCTGAATACAAGAATTCT GTTCGATTATATAACAATTAGTGGGGGAACATCCTGGATGTTTGAAAATCGTGTCCCACACATGCTAGACAATGATTACACACCATATTCAGCACTTGAT ATCTTTGTTAAGGACATGGGAATTGTTACTCGTGAATCATCTTCTTGGAAAGTACCACTTCACCTATCAGCTACTGCTCACCAACTATATCTATCAGGTG CTGTATATTTACTTGGAATCCTTATGATACATATGGTCATATGTTTTGTTCACTTCAACTTGGTCTTCCCTATTACATACTTTTTATCGGCCAAAAAATC CAATAAGCCCTGTTACATTTTGGGACCAGGGGAGGAGATTGGGACCCTTATTTTAGATCATATTAAACTATAGGAATAAAGAAAAGAAAGACAGATTTAA GCTTGTTCATCTGACATAATGGCTTATGGGTGAAGGGTAAAGCATGTAGAATCTATTTATTCATACTCTTCTATTTACAAAAAGAGTATGAATAAATAGA TTCCACATGCATTACCTTCGTATTACTTAAACTCTCATTGTCAAAGACCGTCTTATTACTTAAATTGAGGTCATGGTCTCTGAAATAATTGAACAATTCT AGGAGGTTAAATTTCTGTATATGAAAATCTCAGTATGCCAGAGGATATATATTCCGATATGTAAATAGTAAGCCGTAGGAGTGTACTACTTGTAATGGAT TTGAGTAGTTCAGTGGAGGTCTTAAATTAAATGTCAATGTTGTTATTTTATCCAGACAAGGCAAACATGTAAACGGTAGAAGTTATCTATATAGTTTTCA GTGGGGGGTTTGGGTAGTTTATACTTTGTACGGGGTCATAGATCCAAGCCTCATTGCTACCATTGTACCCAAAAAAAAACTATGTAGTTTTCAGCAAATG ATACAAAATGAAAGCAGGGAATAAAAATATGAATTTTATAAAACTATACAGAGAAATGCTCTGTCAAACTTGTTATGTCACTGCAGGTTCTGCTGCTGGT TGGGGACGGCAAGATGATGCTGGTGTGGTGAAGGTTTATGAAGCATTAACTGGTGTTAGAGTTGAAGGAAAACCACAAGCTCTTAAGAAAGACGTTGTGT TGCATTCTCTTCCACCCGAGTGGCCACAAGATCCTCTTCCTGATATAAAGAGACTAAACGGAATCAGCTCAAAGGTTTTGATTGTTCTAGACGATGATCC AACAGGAACACAAACTGTTCATGATATTGAGGTATTAACAGAATGGAGTATTCAGTCACTGATTGAGCAGTTTAGAAAAAGTCCAAAATGCTTTTTCATT TTGACAAACTCCAGGTCTCTGAGTTCTGAGAAGGCAAGTGCATTGATAAGAGAAATTTGCAGAAATCTAGCTAGTGCAGCAAAATCAGTTGACAACATTG ATTATACAGTAGTTTTGAGGGGAGATTCAACTTTGCGTGGTCATTTTCCAGAGGAAGCGGATGCTGCTATTTCAGTATTGGGTGAAATGGATGCATGGAT AATTTGTCCCTTTTTCCTTCAAGGTGGCCGTTACACTATCGAAGACATACACTATGTTGCTGATTCTGATATCCTTCTTCCTGCAGGGGACACAGAGTTT GCCAAAGATGCTTCCTTTGGCTATAAATCTTCAAATTTGCGCAATTGGGTAGAGGAGAAGACAGGTGGGCGAATACCTGCAAGTGCTGTTGAATCCATTT CTATCCAACTTTTGAGGAAAGGGGGACCAGATGCAGTTTGTCAACATCTATGCAATTTGAAGAAGGGATCAGTATGTATAGTTAATTCAGCTAGTGAAAG AGATATGGCTGTATTTGCACTTGGAATGATCAAGGCAGAATTGATGAAGAAGCGTTTCTTAAGTCGCACTGCTGCTAGTTTTGTTTCTTCCCGCATTGGA ATCATCTCTAAGCCTCCAATATTGCCAAAGGATCTCGGAATAGCTAGAGAAAGGAATGGTGGTTTGATAGTTGTGGGATCATATGTTCCAAAAACAACCA AGCAGGTTGAAGAGCTTAAATTACAGTGTGGTCATTTTTTAAGAAGCATTGAGGTATCGGTTGAAAAACTTGTGATGCAGCCTATTGAGGAGAGGGAGGA AGAAATCAGTAAAGCAGCTCAATTGGCAGATGTTTATCTTAAATCTCATAAAGACACTCTTATATTGACTAGCCGGAATCTCATAACTGGAAAAAATGCC TCTGAAAGTTTGGACATAAACTTCAAAGTCAGTTCTGCTTTGGTGGAAATAGTGAAAAGAATAACTACAAAACCTCGCTATATACTAGCAAAGGGTGGTA TTACCTCTTCAGATCTTGCTACGAAAGCCCTTGGTGCAAAATGTGCCAAGATAGTTGGACAAGCACTTGCTGGCATTCCCTTGTGGCAATTAGGCACTGA AAGTAGACATCCTGGAGTTCCGTACATTGTTTTCCCTGGTAATGTTGGTGACAGCAGAGCATTGGCAGAAGTTGTGAGGTCTTGGACTCGTCCAACCAGA CTTTCTTCAATAAAAGATATTCTTAACAATGCAGAAAAGGGTGGGTATGCTGTTGGAGCATTTAACGTCTATAATCTGGAAGGCGTTGAGGCTGTTGTTT CTGCTGCAGAGGAAGAACAAAGCCCGGCTATATTACAGGTCTGAAACAGACAGTTCAAAATGTTTATACAAAATGTTTTAAAAAATGAGGGAACATAAGA GACAGGAAGAAAAAGCAAAAAGTAAATTAAGAGTTTTAAGCTTGATTTCATGACCTTCCAGATTGACAGACCTAGTTTCTATAGAAAGTTAGTTCAAGGG GGTCTGGATGTCCATAGCTGTGAAACCCAAGAGCTGAGGCTAGATACTGAAGAGTATGTTAGTTGAGATCCAGGTCTGGTGGGACAGTTTCTTTTCCATT TTATTAATGATTGAATCTAACTCTTTCTGAGCTATAGTGATTGCAAGACTCTTCAAACCAAGATAGATAGAGAGGTTTACATTTAACTTTAAGGATACAG GGGGTAACCATATGATTTTATGTGTTCAGGATTAGAATCTTTTCACAAATTCCTTTGGAATTCCTTGATGATCCATCCTGTCCATTTGTTCCCGCAGACT CAGATGCCTTCTGTTTTTTAAGCTACCTCTTTGTTTCAGTTGGCTGTTTTTATTTTTCATTTTATGTTCAATATATTTTTGTTCTAGAGATTAGAACTAC TATTAGAAATCTGAAAATCTCCTAAAACATTGAAAGATAATCTATATATGGAAATAGGTGATTTACACTAGTCGTTCTCTAGTTGATATATTGATCATGA TAAAACTATTTTTCTTGGCCTTTCTCGCTTTAACGTCTCTGTGATCAAACTAGTTTGACGAAATAATAAATATTTGACTAATATTATAAATTATAGCCAA ACATTTAATGAAGAATTTTGATTATATATGAAGCAACTAAGCTTCATTTGTTCTTGATTGATTGTTTCATATTAATATCTCCATTCTCTGTGCATGTGTG TCATGTCAAATGTAGTTTCTTAAGATGAGTCAATTTTCTTTTTTATTTTCTCATATAAAGGTTTGGTTCCTCTAAACTAGTTGTGAATTACCTACATAAT TTTCAGATCCATCCTGGTGCCTTGAAGCAAGGAGGAATTCCCTTGGTTGCTTGTTGCATTTCTGCTGCAGAGCAAGCCAGTGTTCCCATTACTGTTCACT TTGATCATGGGACTTCAAAGCAAGATCTTGTGGAAGCTCTTGAGCTGGGATTCAGTTCTGTGATGGTTGATGGTTCACATCTTTCTTTCAATGAAAATGC TGCATACACAAAATTTATATCGTCACTGGCTCACTCGAAAGATATTTTGGTCGAAGCTGAACTAGGGAGACTGTCAGGGACAGAAGATGATTTAACGGTT GAAGAATATGAAGCCAAGCTAACTGATGCTAATTTGGCACACAAGTTCATTGATGAGACTGGCATAGATGCTTTGGCAGTCTGTATTGGAAATGTGCATG GAAAATACCCAGCAAGTGGTCCAAAACTCAGACTTGATTTGCTTAAGGAACTGCGTGCTTTGAGCTTGAAGAAAGGAGTTTTTCTTGTGCTTCACGGAGC ATCAGGCTTGTCCAAAGAGCTTGTTAAGGAATGCATAAGCCTTGGTGTT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_175491; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_497994
| Blastp | Fructose-bisphosphate aldolase from Geobacillus with 57.45% of identity |
|---|---|
| Blastx | L-threonate dehydrogenase from Cupriavidus with 51.18% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019457928.1) |
| Pfam | Putative sugar-binding N-terminal domain (PF07005.10) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |