Id Trinity | TRINITY_DN50213_c0_g1_i24 |
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Name Transcript | Ll_transcript_498003 |
Sequence | GCTTAATGATATAATTAATAATAATAATGGATAATTGATATGATGAGAGTTACGAAGTGTTGCGATTGAAATAAGAAGAAAAAATAGAAAGGAAAAGGAG TTGCGTAACAACACGACACAAATTTGGCAATCACATCAAAAAGACGTAATTCCATTGCTCTTTCCTTCCTTTAACTCCTTCCTCTGCCCCTCACTCTCAC CTTTATCTATTCCTATTTTTTTCTATACACTATTTTGATTCACTGCTGAAACTTGTTTCTATTTCTTAATCTGAGAGAGATTCTATAAAAATATTAGAAG GTGTGTGAGTCCTGAAGAGTGGTGTAATGGCGTCGGGGAAAGTGGTTGGGTTCGTTGGGTTGGATCAATTAAGCGTGAAGATGGCGTCATCGCTCATTTC CCATGGCTATGCTCTCCAAGCTTTTGAGATAAGTGATCCGACGATCGAAGAGCTTTTGAAGCTTGGAGGAACTAGATGTTCAAGCCCTTGTGAAGCAGGG AGAGATGTTGCTGCTTTAGTTGTCCTAATTTCTCATGTGGATCAAATTAAAGATCTAATTTTTGGTGATGAGGGTGTTTTGAAAGCCCTAAAATCGGATA CAGTTCTTATTCTCCGTTCAACCATATTACCATCAGCTCTCCATAAACTGGAAAAGGATCTGGCAGAAATTCATGAGATAGCTTATATTGTTGACGCATA TGTCTCTCATGGGAGGTCTGATGCTATGAATGGAAAAGTTATTATTGCATCATCTGGAAGACCAGATGCCATCGCAAGAGCACGGCCTTTGCTTTCTGCA ATGTGTGAAAAGCTTTTCACTTTTGATGGTGAAATTAGTGGTGCCAGTAAGGTTAAAATGGTCACTGAGCTGCTAGAGGCCATTCACTTCATTGCTTCTG 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TGAATTACCTACATAATTTTCAGATCCATCCTGGTGCCTTGAAGCAAGGAGGAATTCCCTTGGTTGCTTGTTGCATTTCTGCTGCAGAGCAAGCCAGTGT TCCCATTACTGTTCACTTTGATCATGGGACTTCAAAGCAAGATCTTGTGGAAGCTCTTGAGCTGGGATTCAGTTCTGTGATGGTTGATGGTTCACATCTT TCTTTCAATGAAAATGCTGCATACACAAAATTTATATCGTCACTGGCTCACTCGAAAGATATTTTGGTCGAAGCTGAACTAGGGAGACTGTCAGGGACAG AAGATGATTTAACGGTTGAAGAATATGAAGCCAAGCTAACTGATGCTAATTTGGCACACAAGTTCATTGATGAGACTGGCATAGATGCTTTGGCAGTCTG TATTGGAAATGTGCATGGAAAATACCCAGCAAGTGGTCCAAAACTCAGACTTGATTTGCTTAAGGTGACAATATTTTTCTGTTTGTATTCTTTATGCATT TGGTAGATACTTTCTTACTTAACTCAATCCTTTCCTGTGCAACCAAAATATTAATAAAAGATCTAGTCTATTTAAGCCTTTCCCCTTGTTAACTTTTGGA AATTAGTTATTGTGTAAATTTCCAAAATTGTTGTCTTCCAAGATGACTAGCCATTTTCCAGTCACAGTTAAGTGTATGAGCCAAGACACTTGTCTTACAG ATGTCAGTGCTGTGTTCAACACTTCGGCACGTCAATCAACATAGGTGTCGGTGCTTCCTAGCTCGTGTTTACCTAAATTCTCAGATAAATTAATGTTCTA ATCAATATAGTGTTAGTTCAATTTAACATGAATATGAATTTGTGAAATAACAACATACTTATAAGTTTGGTGATACTGAGTTACGTTTACCAATCTCAAT 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Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_175491; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_498003
Blastp | L-threonate dehydrogenase from Cupriavidus with 54.33% of identity |
---|---|
Blastx | L-threonate dehydrogenase from Cupriavidus with 51.35% of identity |
Eggnog | Dehydrogenase(COG2084) |
Kegg | Link to kegg annotations (H16_A1562) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019457928.1) |
Pfam | NAD-binding of NADP-dependent 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase (PF14833.5) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |