Ll_transcript_497336

• Id Trinity: TRINITY_DN50219_c0_g1_i10
• Name Transcript: Ll_transcript_497336
• Sequence: CCATGATCCTTGTCAGTGAGGTTAGTTTTACATTTAACAACACTGCCCATTGAATTTGACGAACTTGCGAGTTTGTCTTCTGTTTACAAAACTCGTATCA TGTTGGTCCTTCCTCACATACTAAAGTTTACAGTGAGGACCAACAAGGCAAAAGTTTTATAAATTTAGGTACAGTTTAGTCTATGTGTTAGATCAGAACC GAACATAATATGTTTGGTGCATTTTATAAATAGAGTAGAACATGATACGTGATTAAATGCTGAGACATTTTGGTTCCACTAAAAAGGGTGGAACCAATGA GAATAAAATGATTTTATTGATTCTTACTCCTTTTATTCCATTTTATTTCATTCTGATCTAACTATGTTCTGATTTCTATGTTAGGGAAGGACTAACTTAC ATACTCATTCGCCATATTAATCAATAAATTTGATCTGTCTATAACTAGTGGGCGGTTGTCCAGGATTCTCACTTGATCCAATTTGGTTTAAGTGGAACAA CATTTTTTTTAGTTGCATTGTAATTTTTATTATCAATTTTCAAGGAATTTTAAGTTGCAGAGTGTGAATCCTTAATGGTAGGAGTAATCAAGTATATTAA GAATGCTTTTCTTGCTTATGTGCGCCTCTCTTCTATGCTTGGGTTATGCATTTTAACTGAAGGTTTTGATGCTAGATTGGGGATGAGACATTTATAATCG CAGCTCTTATGGCCATGCGTCACCCTAAGTCAATTGTCTTGTCCGGTGCACTGTCTGCCCTCGTTATAATGACAGTGCTTTCTACCGGATTAGGCAGGAT TGTGCCAAATTTGATTTCGAGGAAGCATACAAATAGTGCTGCTACAGGTAAAATTTCTGGGTTTGATGCTTACCTTTGATCAGATTTCTATATTATAATT TCTGAAAAATCCGTAAAAAGAGGGGGTAATAAATATTGTCTGCATTCTGCCTCTGTTATAGAAGCTTCTATAATTAGTATCATTGACATGATTTTGGGAT GCGACATTTGTGCGTGGTAGATGCTTTTCAATTCCATGTTCTATTCTATGATCCAATATTAGTTGGTTATGTCTGTTTATTCCCGTATGGTGATTATTAT TTTGATTAAAAAATTATTTCTTCATTTTCCTTAGTCAGGGTTCTATTTGTGCCGAGCCTTCAGGCAAAATCTGGCTCTTTATTATATCAAGGATACAGAG TTATTATAGATTTGGCTTCTTTTTCTGTCAACTTTAGTTATGTTCCCATAAATTGTTTGTATTTTTGCTTCTATAAAGTCCATGAGGATTCTTGTCATCA ATATTAAGGCTGCAGGTATGAACTTTATTAATATGTGCATTCATGTGAATATTTCGTATGTACTACTCAACCAATTTTGTGCCATTTATTTGATTTCCGT TTATGCCCTAATCATTTACACTTCTCCAAATTTCCATTCATTTTCTTGTGTTAAGGCTGGGTTTTACTTTTCTGTACAAGTTAATTTTTGTTAAAGATAA TATGACGCTAAGCCTGTCCTTATTTTGAATTATGCAGTTCTTTATGCTTTCTTTGGGTTACGACTGCTATACATTGCTTGGAGATCATCAGATTCAAAAT CTTCACAAAAGAAAGAAATGGAAGAAGTATGTTTCTATTGACTCTTCACAAAGTTAAATTCTTGCACACTTATTTGCCTTTATCATTTATAATACCGGGG TGGAGATGTATTGCTTCAGGCGCCTATGTTCTGAATGACGCATTTTTAAAGGGTGAACTTGGCGCAACATTAAGGTTATTGCATAGTGATAATGAAGTTA CGGGTTCAAATTGTTGAAACAGTCTCTCCACTTGCAAGAACAAGGCTGCGTACATCTACCCTCTCTGGACCATACTTAAGCGGGAGCCGCGTGTATTGTG TGCCCTAATGATTGTTGTATATGGCCAGTTCTGTGTGTGTTTGTCTGGAGTTCAATGTATAGTTGTATATTGATGTTGGCCTTTTGGTTATGAATGTTAC AATATGCTAACAGCTACAATCTTGACATAGATTCAAGTTTCAATTCTACTTTTTTCTTTTTTTAATTATAGAATCCCTGATTCTCGACATGGTCGATTTG CCATGAGAAGAGGTGAGTATTAATTACATGTGAACATATTATCAGAGTTCGGGGGTCCTAAAATCGTTGAATTGTTTGGCTCAATGTTTTTTCTTTGAAA AGGTTAAATACTGTTCTTGCTAAAAATTTGCTCTTTCTGTTAACTAGGTAGAAGAGAAACTTGAAGGTGGGCAAGGGAAAACTGCAGTTCGACGTTTCTT TTCAAGATTTTGCACACCAATATTTTTGGAGTCTTTTATTTTAACGTTCCTTGCTGAGTGGGGTGACCGAAGCCAGATCGCGACAATTGCTCTTGCAACA CATAAAAATGCAGTGGGAGTAGCAGTTGGTGCCACTATAGGACACACCATCTGCACTTCAGTAGCAGTGATAGGAGGAAGCATGCTGGCATCTAAGATCT CCCAACGGACAGTAGCCACTGTTGGTGGCTTGCTCTTCCTCGGCTTTTCGTTGTCTTCGTACTTCTACCCTCCTGTATGATTAATAATCGCAGATTAATC TGATTCTTATTTGTTTGTAGTCTTTCCACCTTGATTTTTTCACTTAAAGTTGTATTAAAGAATTTGTACTTACCTGCATAGAAAGCTCGATCCTAGCTGA AACTGAAACTTCAGATTTTGAATGTCATTCGATTTTTTTTGTAATTGCATTCGCACCTCTATCCATTTACACTTAAACAAATGGTATTTATCATTATTAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_175531;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_497336

FPKM

• PAB: 0.5
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.2
• PS2: 0.3
• PS3: 0.4
• PW1: 0.4
• PW2: 0.3
• PW3: 0.6

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_497336

• Blastp: -
• Blastx: GDT1-like protein 3 from Arabidopsis with 88.35% of identity
• Eggnog: transmembrane protein 165(COG2119)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G36290)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002327)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019431238.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;