Ll_transcript_498043

• Id Trinity: TRINITY_DN50227_c1_g1_i9
• Name Transcript: Ll_transcript_498043
• Sequence: AGGTTCCAGGTGTAGAAGCAGATGATGTGATTGGAACATTAGCCATAAGGAGTGTTGATGCTGGGTACAAGGTGATCTTCCTAATGGTTTGGAAATATAG AAAATAGCTCGTACTCTCTTACTTCAAAGACCTTTTCTGTTTTTGAGAAAATACTTTTTTCTTAACCAAATGAAAAGTGTACTCTTACAGTTTTAAGTAC GCATTCATATAAAGCTAATAAAAGTATAAAACCAATACTTAAGACATAAAACTTGTTATTATGAACGTGAAATCATTTAATGGCACAGACCATAAACTTG CACACATTGTCAAAATGCTAAAATTGATGCTATTCCTCATCAGGATGAAAAAAAATAATCATAATTGAAGCTTAAATATTTTCCTTTATCATAATTTATA TTAAATGGAGCTTCAATCTTTTTATCTTCTTAAGTTACATTAAATTCGTTTATGCCCAATGATAATTTCAATTCCATTAAGAGTTTTAAGTGTAAAACTA CTCTCAGTCCCATTAGCCTTTTTTTATGCTAGTTAGTGTTTTATGTTATCCAGTTTAGTAACAACGTTATAATTTGGTTGTATTTCTTATTCCCTGTTTT TAGTTGAATTATGAAATGTTACATTTTCTGGGTTTTAAAGGAGATTGACTACATTGATTTAGAAGTATCAGTTTCATTCTAGTTAAATACTTAAATTGAA CGAGTGTAGAAAGAAGAGTATTGATATGGTAGCATTAATAAGAAAGGTAAAAAAATTCACTTAGGTGTGTATTAAAATTAATTTTCGCTTTACCGTCCTT ATGTCTGATATTTGAAGATTTGCATTGTTGTAGCATCCTCTGTTTTATATGTATGTATCAATTTATTTCTGTCAGTCAAGTGGTGATACTTAAGTTGGTG TCAGTGTTTAGCTTCACATTAGCATGCTAATTTCATAAAACTTGATTGAAACTTTTTTGTTTTTCTACCCTTCTTGGATGAGCATTAGCAAAAAAAAAAG GTTATTTTTCAGAGAAGGGAAAGTTATAATGGGACTATTCTGCTTGAAACAATAAAATTCTATGTAGCATATGCTTTTTCATCCTGGAATTGTTTTCAAT GATATTACTAAGTTACTGATGATTGTTTTTATCTTGATGATAGGTCCGAGTTGTCTCCCCAGACAAAGATTTTTTTCAGATTCTATCTCCTTCATTACGT CTCCTTCGAATTGCTCCACGTGGTGATCAGTTAGTATCAAACATATTTTTGCTGTTATGTAGTGTGCTAGATTATAAACTGGTGCAATAGTTAATAGCAA CTTATTTCTGACTCTAAAATAATGATAAATCATGTACTGAAGGTTTTAATATTTTTTATGTGCACTTACCCCTTTATCCTTAAAACCTCACATTAGCAAA GGGATAAAATTGAAAAGGAAAGAGGGCAATTTTACACTCCTCGGCTGTGCTTTCTTTTAGAGTGTGGATAATTATGATGTACTGGCATGTAAGTATTATG TAAACCATGCTGCTCCACCTCTTACTGATTTTATTGTGTTTATCATTTCTTGAGTGCTGTATGAACTTTTTACACAAATTAATAATACAAAACCTGTATT ACATGGAGGATATGGTGGTGCTGGTGTGATAAGACTAGACCTCTTATTAAAAACGTATACACTAGGGGAGCAAGGAAAGTTTGGTTTAATAATAACAAAC TTCCTTCTTTACCCTTAGTTAGTTAATAGGCAGTTAGTAGTAGGAAGCCTATAAATAGAAAAGGGGTAGTTATGAAGAGTTAGTTAGGAGTTTTGCTACC TGATTTGGAATCAGAAGCTTGGGAGTTGGGTCAGGGATCCAATTGGTTACTCATTCTTTCATTCTTCTTGTAAACACTCTTCTTCTTCAATAAAATTCCA TATAGAACCCTAGCAGAATCACTCTGATTCTGGTTTAGGGGCAATTCCTTTATATTCTTTCTCAATTCTAATTCTTTATTTGGTGCCAGTGTTATCATGG TGCATGCTAGATAACAGAGAGATTTTCAAATTAAATAAGTAAAAATAAAAACAAGGTCACTGCTGAAAGATTTTCAAAATTTAATAGATATCCGCATAAT TTGTTTCATTGTTATTTGAAATTGCAAATTACAGTGGAGTTCTCTAATGTTTTTTTAACACTTATTTTCTATTTTCTTTCAAAAGGATGGTTTCATTTGG AGTTGAAGATTTTGAAAAGCGATTTGGAGGTCTGAAACCATCTCAGTTTGTTGATATGATTGCACTTACTGGTGATAGAGCTGATAATATTCCAGGAGTT CATGGAATTGGAGATGTACATGCGGTGCAGTTGATCAGTAAATTTGGAACATTAGAGAGGTTATTGGATTCTGTTGATCAAGTTGCAGAGGATCGTATTA AAAAGGTATGCATGGTCAATGTTATGCTTTGTGTGCAACTTTTGTTTGATGTCATGGTTACGTTGTTCTCGTTGGATCTTGATATTGCTTGGTTCAATAT GATTTGTAAGGTTTCTCCATGCAATTAGCATCTGAATAATCCCTAGTGTGAATCCTTGTATGATAGTTTTTTACCTGTTAAAAACTAATATATTCATGTT CATAGTCTACATCAACACCAATATTGTGATTTCATTTGCCGTTTTCTTTGTAGGCGTTGATTGCAAATGCCGAGCAGGCTCTCCTTAGCAAAGAACTGGC GTTGTTGCGCTGTGATCTTCCATTCTACATGGTACCATTCACTACAAAAGACATCACATTTAATAAACCAGAGGATGATGGGAGCAAATTCAAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_175620;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_498043

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0
• PS1: 0
• PS2: 0.1
• PS3: 0.3
• PW1: 0
• PW2: 0.2
• PW3: 0.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_498043

• Blastp: DNA polymerase I from Geobacillus with 49.15% of identity
• Blastx: DNA polymerase I, thermostable from Thermus with 38.64% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019424417.1)
• Pfam: 5'-3' exonuclease, C-terminal SAM fold (PF01367.19)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;