Ll_transcript_496720

• Id Trinity: TRINITY_DN50240_c2_g1_i11
• Name Transcript: Ll_transcript_496720
• Sequence: TTTTAATAATATTGGATTGGATTATAATTTGAAGTTGATTATTTATCATGACATTGTTACCCTGGCCATGTGAATTTAATACTTAGTTAAGTTTGTTGCC TTGTCGGAAATAATTTGAAGTTTTCCAAGTTGTCAAATTTCCGATAGAACAAAGCCTATTGAGCGAAACTCTTTCTCTATATCTCTGAAACCCTATCGCG TACTTTGCAATCGACCCCAATTATGGCCAACACTAACCTCCCTCGAAGAATCATCAAGGAAACACAGCGTTTGCTTAGTGAGCCAGCACCTGGGATTAGT GCTTCGCCTTCAGAAGACAATATGCGATATTTCAATGTGATGATCCTTGGGCCTACCCAGTCACCTTATGAAGGTGGAGTCTTCAAGTTGGAACTATTTT TGCCAGAGGAGTATCCTATGGCTGCTCCAAAGGTAATTAATTTAATTTGTTGTTTTTCGTGGGCATCATGGTATTTTTCTGGTGTCAATATTGTGCTGAA ATAGTGAAATTTTATGCTCTAAAAAGAGATGAAATTATAGGTTATAAAACATCCGGACTCTACAATTGGCTATAGTTTAAGATGCTTAACAAGTTTTTGG TTATTTGTGATCTAATACACCTTTGAGGTATAATGGGATAAGATCCCAATACATTTAATGGAACAACCTCTTGCTCCATTTTGTCTTTTCCTTCACTCCT TCCCTCATGAAACTTATATCATGTGATATATTGTTTGTGGAATGTGGTGGGATAAAAGTTATATCCAATTGGATTTAAGGCCAGACATGAAGATTGGCTT TAGTTCATGAGTTGAATTAGAATACCTGACATCCACCCCAACTATCCAAGAGTTCCATATGATGCATTTGGGAAGTGTTGCCTATGTAAATAAACCAAGT TTTGGGCTACCAGTCAAGGCTGACTCAGAGATGGATGAAATATGGAATTTGTCCCACTAGAAAAGTTGACAATGAGATTTTGAGTCAATGATGAACATCG TTCATTTCAATGATATTGGAGGTATATTTAATTTAAGGACTTGTTAAATATTTCAATAGCATGATAATTTGCATAATTGTATTGATAGATTACCATGGCA TCAAACACATCATGTAGCTTAAGAACATCCAGAAGTACTTGAGAAGGATCAAGGATATACTTTTAGTATATGGAGGGGAAGAGGAGTTGGTTTTAAATGG TTACGCTGATACTAATTTCGAGTCCAACGAGGATGACTCTAGATCACAATCAAGTTTTTTGTTTTGCTAGAATGGTTGGTTTATAAGGTTGAAGATTTTA AAGAAATACAATGTAGTCGGTTCTGCTAGAGGTTGAGTATACTACTGCCTGTAGTTGTGGAAAGGAGGTTCTTTGGATCAGAAAGTTCATTGAACTTGAT TTTCTGGACCTAATGGACCTCAATTGTGATGACATGGGCAGTTGCACAAGTGACCCAAGCATATATTTAGGTGCTTCCATCTCATTCATGAGATCATTAG TTGAGGTATGTGATGATATGCATAGTAATACTAGATAACATTGCTAATCCACTAACAGAACCTCTTGCAAAGAAGAGTTGTGATGGTCATGCTCGGTCTC TTGCAAATGGGAGATTGTTAGCATGTGCCCTATAGACCAACAAAACTTACTCAGTAAGAGCTTGGAACTGATTTCAATCATTAAATATAATGTCCCTTTT ATTTCCTATGAAAACTACACCTTACCTCCATAAATCTGGGTCTCTTCAGGTCATAGAACTAGGATCCTATGGGTCTTCTGTGTATGATTGGGATTTGGAT TTGTTTGATGTAATTCTCTTGGGTCTCTTTTCCCTTTTGTAGAATCATTTATTTATTGTGTTCCTTCTCTCAAAATTGTGTGATTTATCAGTTTCTTATT TTATTATATAATATAATTATGGTTTAATTCAAACAATGATGATACCTTCTTAATGTTGAATGCTACATTTTCACTTTTTCCAACAATTCCTGTTTTGAAA GTACATTCCTTTTTACAGGTCAGGTTTCTGACAAAAATATATCATCCAAACATCGATAAGCTTGGTAGGATATGTCTTGATATTCTAAAAGATAAGTGGA GCCCTGCCCTTCAGATTCGCACTGTTCTTTTGAGGTATCTTTACTTGTCATATTTTAGTCTACTGGATTTACATGTTCTCTTGGACCTATTTAGCTCCTG AAGAAAATGGGACAAAGCAAATAGTCATTCATGTTAATGTCTTGATGTTTATGTTGAATTGGCCTAAAACATTTTATGAAACATATATAGGCAAATACAG ATAGCGTGTATGAAAATTCACAAGTCTGGAAGAAAGAAAACATTTCTTTAGTTATCTTTACTGATATGGAAGAATTTCTCGTTAGTTTGCTAAATCTTTC CTTGGGAAAATGGAAGATTTGTTTGTGGATTTTAGACTCTTGATTCATTTTAGTGTCAGTCTTTTTGGTCCGTGAAAACAGAATGCCACACAATGAGGAA AATGGTGCAGGGCTAGTGAATGCAAACTATATAATTACACTTTCTTAATTGTGATTGCATTATCATGTACTGATGATATGAATATGTTGGCACTCTTGTA GCATTCAAGCTCTTTTGAGTGCACCAAACCCAGATGACCCACTTTCGGAGAATGTTGCCAAGCATTGGAAATCTAAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_175709;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_496720

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.2
• PS2: 0.1
• PS3: 0.3
• PW1: 0.2
• PW2: 0.4
• PW3: 0.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_496720

• Blastp: -
• Blastx: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 35 from Arabidopsis with 98.59% of identity
• Eggnog: ubiquitin-conjugating enzyme(COG5078)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G78870)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_014493748.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;