Ll_transcript_498781

• Id Trinity: TRINITY_DN50249_c1_g3_i8
• Name Transcript: Ll_transcript_498781
• Sequence: GAAAGAGAAAACAGAGTTCAAAAACAGAGTTTTCAAAAGAAACATAGTTTTCATCATTTTTCATTCATTCATTCATTGGGGTTGTGAGAAACATGGCAGA GGTTATGTTACTAATTGATGATTTGGAATTGCTTTCTGGGATTTCTCGATGTAGAATATGTCATGAAGAAGATTTTGAGAACTCATCATCAAACATGGAA TCACCTTGTGCTTGTTCTGGAACCATTAAGTTTGCTCATAGAGATTGTATACAGAGATGGTGCAATGAGAAAGGGAATACAATATGTGAAATTTGTCTCC AGCAATATGAACCTGGATATATAGCACCTCCAAAGATATTAGAGAAAACTGATGAAGCAATGTCTATTAGGTAAGTTTCCATTTTCCAATATATCTATTA AGTATTAATTATCATGCCACATGGCGCACTATTAATTATTCCATTAGGAACGAATTGACAGGTGTAATGTCATAAACTCTTTTTATTTATTTTATATTAT AGAAGGTTATGTACATATAGTAATCTCAAATGAGGTAAGAATTTTATATAATTTGACTAAACAGTTATCCTGTTTAAATCTCTATTAAAAATGACATCAA AAATAGAAAAAATGAATAATAAATAAGGAATAACAGCTTTTATCATTTAATAAATAAGGATATAATAGAAAATAAATTATATACAATGATAGAATATTAA TATACAAATGACATATTTATATATTTCCGCATTCAATTAAGTAAAAGTAACTTACACCTAATTATTTAATGAATTATGTATAACGTGAACTCTTAACCTA CATGCAAAGTTGGCACGATTTTGGTGAGAGTTGAATTTTGGAGGCAAATAAATGAAAATTGAAGGTCGGATAGTCATGAAATATATTCGTGAAATAACTC TAAAACTTTTATTTTTCTTTTATTTCCCTTTAAAATTCAACTCACAAACTAATCATTAGTAGTTTTGTGTTGTATTATTGTCTTAGTTTTTCTTGGTCTT CAAAATAGTGTGACTATATATTAAATTTGGTAATGGTTTTGAAGGAGAGAGGAAGAAGAGTCAAACATGAGAATAGAGGAAAGAGTGGAAGGAGTTGTAA TAGAATCTGAATGCAGCTATGCTGCTGATAGAACCGCGTCTCGTTGCCGATCACTCGCATTAAGTGTAAGCATTGACTATATATCTATCACTTCTCTTTC CCTTTATCTAAGTATACAGATATCTGTATACATGAATTAAATTATTCTAAGAGTAAGTTTTTTAGATTTACTACTAATTTTGACCATCAATTTTAGAGAA ATCCAATTATTTGAATTAATGAATAGATCTAAACTATTAGATTTTCAAAAAATTGATGGTTAAGACAAGAGTAACTTTATTCTCACCCATCTATATATTA TTAGTGTAAATATTTATAAATATCTAATATATTATCAATCTTTCATTTATATTAATTTTTAATAAGTCAATAATAATTAAACAATAATGATGCAGTAACC ATTTATATATTATAGTATATACATTATTTTCTCTTTATTTATTCATGTAATTTTTGGTGGATTTATTAAATTGGAACTATTCATTGACTCAATCAACATA CTTAGATATGTAGAGGATAAAAATGATTAGATTAGTAAGTCAGACCATTTTTCATATTAAAAACTTCATTTAATTCTTAATTTTAATATTATTTAATAAT TTTTAATCAAGAAATAAAATTTATCATTATACAAGTATTACATTAAACAATAAACAAGATTTTACTAGAAAAATAATCGAGCAACATAAATTTTAAACTT AATTAAAGAATAAAAGTTTTGCAGTTATTATCAAATAACAAATACGTTGAAATTCAATTACGGGGGTTGGCGATGTTTGATTTTCTTTAAGCAAGGTTTC AAGTTCGAGTTTTATACATCAAAAAGATATTGGATGAGAGAGTTAGTTTCACATATTTATGGATACTCTCGACTCAAACAAAATTAGTTTTAGTATGAGG GAAAATATTGAAAACGAGTTTTCCTCTAGCAAAGGAAGGTAGCGTCCTTGTGTGGTACACATGTGATTTGTTGTGCAATTATTATTTAAGAATAAAATGA AAATAACGCAGTCAAAGACTCGGGTTGATTGACAACTGGACTGGCGAGTTGGGTATTCTAACTCAGGACTCGGATTTAAGAATATATACGTTTCCCTTCA ATGAAACATTGACAATCTTCGATAAAAAGAACCGAGTTTGTCTATGAGTAATTATAATTGATTGTAAAAATATTTTACTAATTAAAGAAAATAAGATATA AAATGATATATTTTTTGAGACAATTATAATTCAATTTTTCGTTTCGATAATTGATTGAAGAAAAAAAATTGGAGCAAACTTCAAACAAGTTAAATTCAAT TTTAAAAGTACTAATGTATAGTCAACATGTCTGAAAATAACAAATTTATCTACTTTTGCAGTTTACAATACTCTTGCTTGTGAGACATCTTTTCTCAACT TGTACAAATGGAACGGAACATTACCCATTTTCAATGCTTACAGTTATTATGCTAAAGGCTAGTGGAATTATTATACCCATGTACATAATTATTAGGATAA TTGGAGCCATTCAGAACAGTATTCAACACCACTATCAGGATTATTACTATAATAGATCAATTTCTGTTGGAGATGAAGAAAACCGGTAACCATTTATTTG AACGACACTCCACTTAGTAGGATCTGGAGAAAGTAAATATATACAAAAGCTTAACCGGAAGTTGAGAGATTATTTATGGAATTTGAATTCGAACCTTTTG ATCAAGAAATAGTAACTTTATTGTTGCATTGATGTTCGTTTACAGTCGGAGATGAAGTAAACCATAACCATATGATTCAAAGATATTGATAGTCTTCTTC TATATTTCTTTTTAATGTTATATCATAATGATAAGATAATGATGCACATCAAAATTTCTAGTAGAGTTTTAAATTTATGACATGGAATTCAAATCAAGAT G
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_175779;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_498781

FPKM

• PAB: 19.5
• PNAB: 0.6
• PS1: 2
• PS2: 3.3
• PS3: 2.4
• PW1: 2.2
• PW2: 7
• PW3: 7.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_498781

• Blastp: -
• Blastx: Probable E3 ubiquitin ligase SUD1 from Arabidopsis with 37.31% of identity
• Eggnog: (Membrane-Associated Ring finger (C3HC4))(COG5183)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G34100)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0000623)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019430686.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;