Id Trinity | TRINITY_DN50250_c2_g4_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_498536 |
Sequence | ATCTTCAGTATGTAGATGACACTCTCCTTATTGGCACGAACTCGACTGATAATATTGTGGTTCTTAAGAGCATTCTGAAGTGCTTCGAGTTGGCTTCGGG ACTGAGAATTAATTTCCATAAGAGTAAATTCATTGGTATCAAGTCGAGTTTGGCCTTTGTTCAGATGGCTGTTAGGAAGCTGTTTTGTGGAGTTGGTTCT ATTCCTTTCAGTTTCTTAGGGATCCCGGTTGGTGCTAATTCTCGTAGGGTTTCTACTTGGAGACATGTGGTGGACTCTTTCAAAAAGATGATGTCCTTTT GGCAGCACAAGTTTCTTACTTTTGGGGGCAGAGTTACTCTTATTAAATCAGTGTTGATCTCTTCACCCATTTACTTCTTTTGTTTCTTTAAAGTTCATCT GTCGGTCATCAATTCTTTAAAGAAGATTTAGTGGCGTTTTATGTGGGGTAAGGGTGAGTCTAGCAAGGGTACTCATTGGGTTAGCTGGGATGTGGTGTGT AAATCTAAAGAGGACGGGGGACTTGGGATTAAAAAGTTGAGTCTGTTTAATCTCGCTTTACTAGGTAAATGGAGGTGGAGGTTTTTGGTCGAGTGGGAGT CGCTTTGGGTGAGAGTTTTGAGGTCTAAATGCGGTGTCGGGTTGGGGTTCTCGGATGGTTTTAGTGATGTCGGGTGTTTTAATAAAGGGTCGGTGTGGTG GCGAGATCGTGGGTGTCTTAGGATTAGGGAGCTTGGGATTCTTACTGACTGGGTTGTTGAGAGGACTAAGAAGGAGAGTAGGGTCAGGTAAGTCCATTAG GTCCTAGATTGACATTTGGGTAGGGAACGCGAGTCTTAAGGTTAGCTTTAGGAGATTGTTTCAGGTCGTTGTGGATAAAGATGCTTCTATTTGCTCTTTA GGATTTGCTCTTTAGGAGGATGAAAAAATGGTATTTGGTGTTAGAATTTGCAGTGGCCTAGGAGTTTGTTCTCGCGTGAACAAGGTGTTGTTGAGGATTT ACTGAAATCTCTTGAGAATGTGAAGTTTTATGAGGATAAGGAAGATGACTTATTTTGGGTGCACGACAAAGGTGGATTGTATTATTCTCGAAATGCTTAT AATGTTCTTGCTAAAGTGGGTACTAACTCTCAGTCTGGATTGTATAAAAGGTTATGGGATTCTAATGTGTCATTCAAGATGAAGTGCTTTGTCTGGAGAT TGGTCTTAAATGGTGTCCCGACTCGTTCGAATCTTGTTCGTCGTGGAGTTGTAGATGTTGTGAGTGACTCTTATTGTGTGTTGTGTGGTCTGGAAGACGA GTCTGTTGATCATTTGTTCTTTATGTGCCATGTGACTTATGGTGTTTGGCAACAACTGTACATGTGGTTTGGTGTCTTATCTGTTATTCCAATTGGAGTG GAGCGTAACTTCAATTTGCACTGGTGTATGTTTAGTTTAGAGAAAAGGAGACATCAAGTTTGGATGTCCATTTGGTTTGTTTGTATATGGTCAATTTGGA TTGCTAGGAATAAAGTCATTTTCGAGAATTACTCTTTTAACGGTCATGAGGTGATGTTTTCTATCTTTATTCACTCTTGGAACCTCATGTCTTCAAGGTT TGCTTCCTTTTCTTTTTCTTTTACTCAATGGGTGTGGAACCCCTCTATTTGTTTCGATAGTATTTCCTAGTTGGTTTGTTGATAGCTGTGGAACCCCTCT ATTTGCTTCTTTTTCTTTGTCTTTTGCTCGTCCCTACAAGAAAATTGTCATATACCTAGAGACGCTTATAGTGACAGTTAATAAAATAGTTGGTATAAAC ATGATATACTTACGGGTGTACATAAAGCGTAGATATAAGTATGATATAACTACAGATGTGTAGGTTTGTAACTATATGTATTAGTGACGTAATAAATTCT GTAGTTATAGATATCTTATACCTACAAAAAAAGATTGTCTGTCACTACATATTTTAACCATAACTTCAAAACCGTAGGTAGATTACATGTACCTACATAT AAATAATTTCGCCACTATAGAATAATTACATTTATTATTAAAGGGAATACTAAACATTTTACCCTTTTAGCTTCATACCATCTTCCTTCACACCTTCCTT CCGGCCTCCATCCATGCCTTCTTCCTTCACACCTTCCTTCACGTCGTTTCTTCTTCTTCCTTCTTGAAGTTTTGACAACTTTTTTCTAGTCTTTCTCCTT CTTCATTTCTAGCACCCATCCAGCCTCTCTTCTTCTTCATTTCCAGCCTCCGTCCAGTTCCAGCCTTTCTTCTTCATTTCCATCCTTCCTCTGTTGACAA CTTTTTGCTTCCAACATCATTTTCCATACTCCCCAAGGTAACATTGCACATTACACTCTTACTCATTTAGGGTTAAAAACCTAATTTACTCATATCTTCT CTTCGGTGATGGCGATTCCACCATGGGAGAAGCTGTAGTTATTTTTCTAACCGAAGCTTCTTCGATTCGTGGCGGTGGAGGAAGACCCGATGAAAAGGTT ACACTACTTTCTCCCTTCTATTTTCTTCCATCTTCTCATTTTTTTAAGCAATTCAAGTTGGACAGTTTTGTTTGCAATTTAAAGTGTTGAATCGTTTGGT ATTCTACTTCCTTTCCCTCTTCACTTCAAACAAAGGTAACCAGCTAACTTCTAAACCCTAAATCAAAACATGAAAACCGTGTAATGCTCTGATCAAACTC AATGATCCTAGTTTTACTTAAATTCCTTCTGTTCATTTGGTATTCAATCTCATGTGTGTTATCAGTATCTTTTCAATATGTGATTTTCTATCATCTCAAT GATTAGTTGTTGACCTAACCTATTTGATTAAATGTTAGTGTTTTAGTTTACTATCTTAGCATACTTTGTTGCTCATAGACTGTTTTAATTCATTGTAAAC TCTATTCTTATTCTAACATAAGATTATCTCTAATCATAAAATAAGCTAACTGTGAACTTAATGGTGGCGCAAAAGCATCCTGTGCTGGAATGCCATGGAT TTGTGACTGCATCATTTGTGGTTTTTCATACCAAAGTGAAGAGAAAGACTGGGTAAGAATCAGGGTAGAAGGTGAATATGGAAATATAGCTGAGAAAATT GGAAAATTTTGAAACAAGTTTGGAATGATACATTTTCACATACTCATGGTGAGTGATTCTTAGAGCATTTTTTAGTGAGGATTCTCAACTTTATAGTTAA TTTTTCTTAAGAATATAAAAATTACGTCCATTTCTCCATTTTGTTTGCCTTCTGTTTACATATCTAGTTTCAATTGAACTCAAGTAAACAAATCAGATTG ATGTCTAGTAATACATTCCAGTGAAAGCTTTTCATTGCATTCCTAAGATACTTGCTACTTACTAGCCACAATAGCACAATATTAGATAGATTTATAGTTG CTATGTAATTTTGTGTGTCTTCCATATTTTCCAACATTAGTGTAATGTAGGTACAAAATTAAGGCGATTGAGTTGCTTTGAATCCTTTTTAAAAGGTGAC AAATCTAACTATTTTAACTCTGTATTGGTGCTAAATTTGTTGTGGTTATGAAAGTTTAACTTTTGCCAAAGTAAAAAAACAAAATAGATGGAGAGCATAG ATTGAAAGTTTCAAATCCATATTGACAGGAGCTCGTCAAAGTAAGTTTGGAATGATAGATTTGGCTCCCTAACATTCTTTCTGAGTAATTTTCATGTAGT GCAATGACACTTCTTATTATTTTGAAGTTGTTATTTTCACTTGGCTCTTGTGGGCTGGAAACCTAAGAAGTGGACAATAAATCAATGATTCTTGTTTCTT GGAATCTATGTAAATGCATTAACGTTTTTTTTTCTTCCACATTTTGTTTATTATGTGTGAATACTTGTGCTTAATACCAAATGATTTGTATTGAAAACAA GTGTTTCCTATTAAAGATGTTGTTGCTTTAAGGGAATAACAAATCATGCATAGCAACAATTTTTTCTTTGTGCTTTTGTTGTTAATTTGTTGAACACTTG ACCTATAAGACTTGTCATAGCAGCAATAAACCCAACTATTCCATAAATTCAAAACTTGTCATACACCTATTAGATAAGGTGTAACATAATTTTATCAAAT AGTTCTATTTCATGAGCTATCTTATAAAACCCATACTTTTATACTCTCGCTTTATAAATTTTCAATTACTTTATAAGCTTCAAACTAGTCATAAATTTTG TATGAAAGAGGGCGTCATATTTTAGTATCTTCTGTATTTGTAGATAGTAATAAATCTTAATCAATAATCTTATATTTTCCTTCTTCATTAAATAGGGCAA TCTTTTAGTTTGTATAATTTTATCACACCAAAATAGTTCACTAACTTGTATTCTTTTTATTTTTTGCAAGTGAAGGTTAGCAAATAATTTCTTCTTGATG CAACAAACCAGGAAATGAACCACTTTGATTTTTTTGTAAACACAAATTGTGTAATTTTTAGGATTATAAGACTTTTATGTCTATGTTATATGTAGTTATA TTATTTTTATATGGCGATA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_175790; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_498536
Blastp | - |
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Blastx | Putative ribonuclease H protein At1g65750 from Arabidopsis with 36.43% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019418409.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |