Id Trinity | TRINITY_DN50258_c0_g2_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_499349 |
Sequence | TTATATAAAAAACTACTCTTCAAAACCATCCACTTTTCATTTCTCTCAGATCACTTCTTCTTCCACTATTCTCTCTTTCTATCTCACCGGATTTTCTTCG CCACCACCGTTAGTCTCTCATCTCTTCTTCATTTATTTATTATTTATTATTTATAGCGCCGTTAATTACTAATTTCTTTTCCCCCGATCCTTCATCACTC TCCAAGTTTTTCAATGTTGTCTCCACTTTCTATTTTCATTTTACTTCTCTCTCTCTATTTTGTTTTTTTATTCAAAATGTTTCTTCATCTTCATCTGTTT AAACTTCAAACCATTTTATCCTTTTCAACTTATTTATTGTTTTTGTCTCTGAAACTGTAATATACAAATCAAGTTAAGGAATTTTATGATAATTTCAAGG AATAATATAATATGATAATTTCCTAAATTTCATATTAATATAGTTAATGAATTTTAGTTTTTGGGGTTTGTTAATCTCTTCAGAAAGGGATCAAGTTGGA GTGAGTTTTTTTGTTGCGTTGATGAGATTTTTATTTGTTAGAATTTTAAGATTTAAGATATTATTTATTGTTTTTGTTTGACCCCTGCAACATTGAGATT CAACTTAAGGTCCTTTTATATTTCACGCAACTATTAAACAATTCGTAGTTGTATAGTATGATTCAACTTGTAGTGGAGTCTATGCCACTAACTAAGACGA GTGCGTATGCAACAGTGTCACCATAACATGTTTCTGTATTAACTATTAAGGCATGCTTATAGATAAAATAATTTAACATCATTTTATCATTTTCTAACTC AATTAACCCACTCTTAGAACTGTTTTGATCTGTGATTTGTGATTTTTGATTTTTGATGTACAATTAGAAAGCATAAATATTATGTCATCAACCGGATCTG 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CGCTCGCTCTGGCAGGCTTATGTTTCTGCAAACAAAATATTTGCAGACATGGTTATGGAAATAATCAATCCCGATGATGATTTTGTTTGGGTTCATGACT ATCACTTGATGGTGTTGCCTACATTCTTGAGGAAGCGATTTAATCGAGTTAAACTTGGATTCTTTCTTCACAGTCCTTTCCCTTCATCTGAAATTTACCG AACTTTGCCAGTAAGGGATGAAATTCTGAAGGGTTTATTGAATTCTGACTTAATAGGGTTTCATACATTTGATTATGCTCGCCACTTCCTCTCTTGCTGC AGCAGAATGCTAGGTCTGGACTATGAATCTAAACGAGGACATATAGGACTCGATTACTTCGGCCGTACTGTATTTATCAAAATTTTGCCTGTAGGCATTC ACATGGGTAGGCTTGAATCTGTGTTAAATCTTCCTTCTACATCTGCTAAAGTTAAAGAGATTCAGGAAGAGTTTAAGGGTAGGAAGGTGATTCTCGGTGT TGATGACATGGATATTTTTAAAGGCATCAGTCTAAAGCTTCTAGCTGTGGAGCATTTGCTGCAGCAGAATCCAAATTTGCAGGGCAAAGTTGTCCTAATT CAAATTGTGAACCCTGCAAGGGGTTCAGGGAAGGATGTTCAGGAAGCAAAGAGGGAGACATATTTAATTGCCCAGAGGATCAACGATATTTATGGTACAA ACCATTACAGGCCAGTTATTCTCATTGATCGTCCCGTTCCTCGTTTTGAGAAGAGTGCCTATTATGCTGTAGCAGAATGTTGCATTGTTAATGCAGTAAG GGATGGTATGAACTTAGTCCCATACAAATATATTGTTTGTAGGCAAGGAACTGCACAAATGGATAAAGCACTAGGAAGAACAAGTGATTCTCCTCGTACG 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AATCTACCAGATTTTGTAATGTGCATTGGAGATGATATTTCTGATGAAGACATGTTTGAGAGCATATTAAGGACTGTCTCATGTCCATCATTACCAGTAG CCCCTGAAATCTTTGCCTGCACTGTTGGCCAGAAGCCTAGCAAAGCCAAATATTATCTTGATGATCCTTCTGATGTCTTAAAGTTGCTTCAATGTCTTGG TGCTTCTTCTAATCCAAAGCCCAGACATCTAGCGCAATTCCAGGTTTCTTTTGAGAGCAGAGTTTGAGTTAAGACATGGCAACACATCATTATTGGTCTT GTTTGAATCAGGGAATGTTTGGTTATTATCACTTAACATTACACATGGTGGGACCTTGCTGTTGCAGATCTGGTTCTTTGCATGTGAACCGTTTTGCATT GCCTCTGGAAACTTTCCTTTTTGGGTTAGACAGTGTAGTTCATGGATGACATGTCAAATCTTCTCATGTACATGGTAACATTAATTGTTTGTATTTGCTG GTGTCTCATGTAGTTTTAGGTTAGGTGTGTTTAGTATTTTAGACCTTATAGCTGTTTACCTTGAATGTAGGACACCAATAACTTGTACAGTTACACTATC CTTGTTAACAATACAAAAATGTCAATCTGTTTTGACATCTCTTGCTTTAGCCTAATGAGTAATCCGTGACCAAATAAAAACAAAATTCTTAGAAGGGTAA CTTTAAGTCCCAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_175849; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_499349
Blastp | Probable alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 10 from Arabidopsis with 72.65% of identity |
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Blastx | Probable alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 9 from Arabidopsis with 73.47% of identity |
Eggnog | synthase(COG0380) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G60140) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019421262.1) |
Pfam | Glycosyltransferase family 20 (PF00982.20) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |