Ll_transcript_498403

Id TrinityTRINITY_DN50259_c0_g2_i4
Name TranscriptLl_transcript_498403
SequenceACGAAACAATATAGCTACGAAAGTGACATTGATAATTTGTGATGGAAAAGTGAAACAAGGAAAGGAGAATAAGGCGTAGGCAATTCCCTCCACACGTTGG TTATTACCTTATCTTCATGACGAGAACAAAAACACAGTTCCCAAATGCAACACCACCATCACTAGTGTAGTAGTAATAACCATTACATTAATCATACCAT GATGGCTACCAAATTAGCCTTCACTTTCACACACCCTCGTCCATTCATTTCTCATACTTCATTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTAGAGGGCCCCAC CTGCTTCATTTAAATCGCCGCCACTTATGCCTGCGCCGCCGTCAATTTATGCCGTCCCTCAAGGCCACCTCCGATCAACAAGGCAAGGTTGAAGAAGATG CTGTTGTTGATAGTAATGTGTTGCAATATTGTAGCATAGACAAAAAGGAGAAGAAAACAGTTGGTGAACTTGAGCAAGAGTTTCTTCAAGCACTCCAAGC ATTCTATTATGAGGGGAAGGCTATTATGTCAAATGAGGAATTTGATAATCTCAAGGAAGAACTCATGTGGGAAGGGAGCAGCGTAGTAATGCTAAGTTCT GATGAACAAAAATTTCTGGAAGCGTCTATGGCTTATGTTTCTGGAACTCCAATCATGAATGACAAAGAGTTCGATGATCTGAAACTGAGGTTAAAGGTTT GCTATTTTCATCTCATCAAATCAAAGTAAAACCCTACTGTAGTAGGCAAAGAGTCTATGGCTCTGTATTGCTCAAATATGAACTAGTTGTAAGCATTACC TGAATCACATACATGTTTAGACCACCGTTAATGTTGCGTACTTGAATTTATGAAGAAAAGAGTGTGCACTCATGTGTCATGAATAGAATGAAGATTCTTT CCTTGTAATAAATATATCATTAATACTAGATTTCATTTAGGTTGCCATGGTCCTACCTGTACCGTAATATAGAACACTTATGAAAGGCACTACCTCACTA GCCTAATTAGTAAATTGACATGGTGACTCCTATACTATCAATGAGAAAAAAGTATTTGACGAGGACAAGAACAATGGTTTGAATATTATAAAACTATTTT TAATTAAAGGATAATAGTCATAGTGTTGCAGTCCACGAAACATTTTACTTTTTAGGTTTTCATTTTGGAAAGCCCACCTTGTGTGAATATGTAATTCCAG TTGTTATTTAATATTTATTGTTCATATAAAACTGAAATGCAATTAGAGTGGATTTAAAAACTATATGTTCTTCTTCCTTCTCGTGTCATTCAGCGATTTC ATGGTTCTTTTCTAGGCCGAAGGGAGTGAAATTGTGGCTGAGGGTCCACGGTGCAGTCTTCGTAGCAGAAAGGTGGGTATTCATATGGAATTTGTCCTCT AGTTTGAGTTTTGGATGTCATTTGTAGCTATGTATAACTGTTTGATGATTAAATCGATATAAAGATATTATTAGATAGAATTATAAAAGGAAGTACTTCC TGCTATCAGGAGATTTGTTTATGAATTTGATTATAAGCTGTTAAGTAGTTATATCATAAGTACTGGCTAGAGATATAACATGTTTATTTACTATAATTCA TCTTTAGGCTTCTGAGAAACAATTGATGATTGTTTTGGATCTGTTGCGCCCATTCCTTACTATTTGACGCCCTGTTACAGGTTTACAGCGATCTATCTGT TGACTATTTAAAGATGTTTCTGTTGAACGTCCCTGCAACTGTGGTTGCATTAGGATTGTAAGTAACTTCATTTATGTGTATTAAGTGCATGGGTTATGAT GTATTTAGTGGAAATTTTGATTCCAGCTACTGCCATGATACACAGGACATGTGGTGAAACCAAAAGTTAGAAAAAAAAATAATTGCATGCATGCAGATTT CGGAAGATTCAAGATGAAAATTATGTTTATCATTATTAAATGTTTTTCTATTTCCAAGACTAGATATTTAATGTCTTAATCATCACAATAAGGGAGTTGA AAGGGATCTTAGATATTCCAAATTTATGCTGAGTTTTGACATATCAATTTACCTAGTGTTATATTTTACCCTTTGCTAATAATTGTATAATCCCTTATAC ACATACACTTGGACTAGCATTCCTGGAGCCAACTAACATGGAAGTCACTGATTGCACGTTAAGACATAACTTTGTTGCTTTTTCATTCTTTCCCCTTGTA ACCTGTTAGGTTCTTCTTCCTTGATGATGTGACTGGATTTGAGATCACATATATTCTAGAGGTATGGTCTCCTCATTTTTCCTTGTTCAAGCATTGCAAA CTGGACTTAAATGCTGTTTGATCTTGAATATATGTCACAGTATCTGATAATAGTTGCATTTATATGGACATTACTTGCCTTCTCAATATTAGTAAGCAGT TTAGCTGTATATTGTTTATATCCAAGAGTTAGAAAAAAGTCTTATACAATGCATGATTCCCTTTAAAGAGTAAAATGCAAAATATATCACCATTCAGTAA CAAAATCAACCGGTTAACAAGAAGGTTATGATGTGCATGTACTGTCTGGTTATTGTTGTAGTACATGATGACCAATTTACCATATTCATCTTTTTGAGTA CCTTGTCCTGTCCCCAAACCCCGAAGATGTAAGCACTGATATTGTGGAATTTTAGTTATTTATGAAACAACTTTTGTCTATGAGAAAACACGTCTAAGGA TCAGTGAAACAAAAGCTAGGGTAATCAGATTATTTCACTTCATACACAAGAAATCGTTTCTTAGAAATTTGAATATTTTAATACAATTGATGATTATAAC ATGTTATGAATTTGTTGAGTGCAGCTTCCAGAGCCTTTTAGTTTCATTTTCACTTGGTTTGCCGCCGTTCCCCTCATTGTGTGGCTGGCTCAGTCACTTA CAAGTGCCATTCTAAAAGATTTTTTGATTTTGAAGGTATAATTTTAGTAACACTCTTTTTCGGTAATATTGAACTAGCACATATACTAACAATAATTTTT GAAGGGTCCCTGTCCTAACTGTGGTACTGAAAATACCTCCTTCTTTGGGACTATACTGTCAATTTCAAGTGGAAGTTCCACCAACAATGTCAAATGTGAA AAGTAAGTATAAAACTACTACTCCAATATCCTAGCCCTACCACTCCGTCTCATTTTATATTCGTATTACTATACTGATATGATTTATGGTAGATCTTTAG TTTAACAATCCAAAATAATGTTACCTCAGCTGTGGTACTGCATTGGTGTATGATTCATCCACAAGATTGATTACATTACCAGAAGGAAGTAATGCCTAAG TGGAGGTACGTGTCTTTTATACTCTAGAATATCTCAGCTAAATCTGTTGTAGCATATATTTTTGGCCAATGAAAAGCTCCAATCTTTTTTTCCTCTCCTG TTAAAGAATCTGGAAGTGCAAGTTTTTTACTTGTAGACTGTAATACTGAAAAAATTAGCATTGTGGTGGTATCACGCCCTTTCTTTTCATGTAATTAATT AACTTTACCTTGGAATTCATCATTGCCTGTATCTCAATTTGAGACTAGTGGTGAATTGTGTGCTTGTTAGGGTTGACAATGAAAGGGGGGGCATGTGTTA ATTTTCAATCCTAGCAAGCATACCTCAAATGTTTTGGTTTCAGAACACTGGTCATATGATTACTTTGTTGTGATCTGACATTTATAAACACTGGTCACTG GTGCTTTTATAACTAGATGGCTCCCATATAGATTTCCCACATCTCACTCAACATTTGCTTGATAAGTAACACTAGTCCAAATGATGGTGTCTTCATCCAT TAAAAACGAAAACTAAGTCTTAGTCACATCGTATGAGTTCGGCTACATAGATCGAACAATGTCACAATGCTCTAGGATAATGTCTTCATATTTGGAGTAA TTCTTAAGTTGTTGGGATTGATTTTTGCAACCTACAATATTAAGTCTGTGTGACATGCCTAGTGCCAAATCCTCATTGTAACTGCATCCCGATCATTATA ATATTTACTTATGTCAAACATGCAGGCATGCTTGTACCGTACTCATTGTCCCAACAATTATATGAGATCATCATGGGTGGAAGTGACTAATTTATGAAGT CAGGAAAATGTCATGGTCTAACCTAGCTAAAGGCCATGATATCATTATTCTAGCTGTTACATACCATTGGTGTGATTTCTACTGTATTATGTGTCACTGT CATACTTGTAAGTTGTAATTAGTATGAGCTTTGTATAGCATACACAGGATTGTCCAGTGGAATAGATGAGTGGACTCTTAACACTTTCCATTTTATATCC AACCTAAAATTAAACAGTTTTATTGGGATGCTTATGCTAAATTGTTCCAATTTATTTCAGCTGTGCTACTTTCAAGATGAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_175853; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_498403

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_498403

BlastpPGR5-like protein 1A, chloroplastic from Arabidopsis with 61.14% of identity
BlastxPGR5-like protein 1A, chloroplastic from Arabidopsis with 77.12% of identity
EggnogPGR5-like protein 1A(ENOG4110C1Q)
KeggLink to kegg annotations (AT4G22890)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019445088.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;