Ll_transcript_497944

• Id Trinity: TRINITY_DN50275_c2_g2_i12
• Name Transcript: Ll_transcript_497944
• Sequence: CATCACACCAAACACAACACAGCTACTCCGATACAAGGTGATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAAGAAAGAAGAAGAAAAAGGAACTCAGATATTCC ATTCCCGAATACAACAATCACTCCACTGATCCACTCCCGATCTGCGCTGCTGCTCATTAATTCCTTTATTATCTCATTCCAAACCCTAATTACTCGATAG CCATACCATAGCCCCTTGCCTTTTCAATCATGCGCTTCCAACTACTATGAGGAACACTCTTTCCCGTAATTCTACTATTCCTACTACCACTACTCTTAAT ACTAATACTAATACTAATACTGACAATCACAATAATAATAATAATAGAACATTAAGGCTGTCCTCACCTCAACCATCTCTTAAACGATTCGGATTGTGTT CCCCTATCGTCTTCCCGGAAAGGCGAGGTGCCAAACTCAAGGCTTCTTCCACTGATGATCACGCCATAGATACATCCAAGGATTTTGAGCATAGGATTCA CATAGGAGGAAGAGGAATTCCAGCACCTGGAGATGAGAAGTCTGATTTATTAGGATATGTCGTGTTCTCTGGAAAACTTGCTTTGGATAAGAGAAAGCTT ACTACCGTCAACAACAACAAAAACAACAGTGCTGCTTCTCAACAAACCTCTTCTGATACTACCATCAACCAACAAGCTGTTGATGCCAAACTAACAAGCA AGGCTCTAGTTTGGGGATCCCATCTGCTCAACCTTGATGATGTCATCTCGGTTTCTTATAATGTGGGTCTCAGACATTTTACAGTGCACTCGTATCCATT CAAAAAGCCTTCTTGTGGTTTTTCTTGTTTTATAAAATCACAAAGAACTCGTAAGGACTTTCGCTTTGTGGCCTCTAATTTCCAAGAGGCCGTTCAATGG GTTGCTGGATTTGCAGATCAACAGTGTTTCGTCAACTGTCTTCCTCACCCTTTAGTGTCTTCCAAGAAGCAAGCATCCTCCGAATTGCTTCCTACCGATA CCCCTCCTGAGTTGCTCTTCAGATGTAAAACTCCTCCCAAGATGCTTGTCATTTTAAATCCACGATCAGGTCGAGGTCGTTCAAGTAAAGTTTTCCATGG CATTGTTGAACCAATATTTAAGCTTGCTGGGTTCAGATTAGAGGTAGTCAAAACAACATCTGCTGGTCATGCTAAAACTATTGCATCAACGGTTGACATC AGCACTTGCCCTGATGGAATTATATGTGTTGGTGGTGATGGGATAATCAATGAGGTCAGCGCACTACTGTAATGATTCAGTGACTTGTTATCTATGCTGT TTTGTTTTATGAAAATACTGCCCTCTTTGATGTATTGTTTGTTTTCCTCATCAAAAGCCTTTCTAATGTTTTTTGACTGAATCATAACCTATCTGGGACT GATTGAAGGATCTTGGTTGATCTTTGTTGTTCATTCCAGCGGCTCACAGTTAATTTTTTTTATCACATTTAATGTAGGTAGTCAATAGCGTGCATAGCAG AATGTAGCAGGTTTTTGGCCATTCCCCGCAACGCCACGGTGGATAGTGGTGCAAATGGCCGTAGTGCCTGTGGCTGGTCAAATAGTGGCAGAATTGTGGT TCAAATGAAAATTGCGGGTCATGACCCGCTACATGTTTTGCTGCGAGTGGAACCCTAATTTTAGAGGGAAAAATATTTTTTGCCCCTTTTTAATATGTGA CAAGTTTTTTCCCTTGGGTTTTAGGTCCTTAATGGTCTTCTTAGTAGAGAAAACCAAAAGGAAGGAATATCTATACCTATTGGAATTATACCAGCTGGTT CTGATAACTCATTGGTATGGACTGTTCTTGGAGTTAGAGATCCAGTTTCTGCAGCAATGGCAATTGTAAAGGGGGGCCTTACTGCTACAGATGTTTTTGC TGTTGAATGGATTCAGACTAATAAAGTTCACTTTGGATTAACAGTTTCATATTATGGTTTTGTTAGTGATGGTAAGTCAATGCTATGCCTAAAATTCTTA AATTCGGACTTCATATCATTATTGAATGCAGTCCATCTGTTATTACTTAAAAAAGGGAAAGCTCTTGGTCTTTACCTCATGGGATCATTGCTTCTTCTTG AGCAATTGTATTTTAATACCTTTTGCAGAACCTGCTGGTCTTAAGAGTATGTGGCTATGCTTAATTTTTAGTTATATGTTATATGATTAAATTGGAGTGT TTTTCTCTTTAGGAACATATTGGAACTTTTAGAAATTAATAGGGCGAATATTCCATTTTATAAAAAAAGTAGTCATTATACCAAATTATATATGCAATAC AAGTTGCTTTTATGTGTTGGGGATGCGGGGTGAAGAGATTGAGTGCTAGGAAGAAAGGAGGGGTTTAAATGATGCATTTGAGGTGGATGGATCTCTTTGT AGATTTAACAGTGGGTACTTGGTAGCTGAAAAAAGAAGAAAAAAATAAGAAAGGTAAAGAAAAGAAAAAGCTAATGGAACAATATATAACCTTTATTTAA CAGTTGAGGATAGTTGATAAATTCAGTCACACAATTATTAAGGTCCACTTCTGAATGGTTGTTAAGTGCTTATGCATTTTTCGTAATGTAGTGTTGGAAC TTTCTGAAAAATATCAGAAGCGGTATGGTCCACTGCGCTATTTTGTTGCTGGATTTCTGAAGTTCTTATGCTTACCGCAGTACAGCTATGAAGTTGAATA TCTTCCAGCATCAAAAACTGAGAGAGGAGGAAATCTTTCAGTTGAAAGTGAAGTGGTTGACATGTCAGATCTTTATACCAACATCATGAATAGATCAAAT AAGGATGGGCTGCCCAGAGCATCTAGTCTTTCCAGTATCGACTCAATAATGACTCCAAGTCGTATGTCTGGTGGAGACCTGGATACCTGCACTAGTACTC ATGCTAGCACCGAACCTTCTGAATTGGTGCGTGGTTTAGATCCGAAGTCAAAACGCCTATCATCTGGAAGGGTCAATGTAACAGCAGAGCCAGAGGTCAT CCATCCACAGCTGCCTCTGTCAACAACTCCAAACTGGCCAAGGACCAGATCTAAGTCAAGGAATGATAAAGGATGGAGTGGATTGACCACCACACATGAT ACCTCTAGATGGGGCAATACTGCAGCAAATGATAGAGAGGATATCTCATCAACACTTTCTGATCCAGGTCCTATCTGGGATGCTGAACCAAAGTGGGATG GTGAGGCTAATTGGGATGTGGAAAACCCAATTGAGTTGCCAGGTCCCCCAGATGATGCAGCAGTAGGATCCACAAAGGAAGTTGTGCCTCGTTTTGGAGA CAAATGGATTGTTTCAAAGGGACACTTTGTTGGCATTCTGATTTGCAACCATGCATGCCGAACAGTTCAGAGCTCTCAGGTGGTCGCTCCCAAAGCTGAG TATGATGATAACACTCTAGATTTGATATTGGTTCATGGAAGTGGTAGGCTGAAGCTGTTGAGATTTTTCTTACTTCTGCAGATGGGTCGACATCTGTCAC TTCCATATGTTGAATATGTCAAGGTAAAGTCTGTGAGGATCAAGCCTGGGAAGCATACTCACAATGGATGTGGTATTGACGGTGAGCTTTTCCCACTCAC TGGACAAGTAATTTCTTCTTTGCTTCAAGAACAGTGCAGGCTTATTGGCCGTTCTAGTATATGATGATAACTGTGAGCGAGTTCTTTTGATTCTTTATGA TGGATTCTGGGGAATCTCATGTACCTACCTTCTCCTCATATATATGAATTCAGACACCCAACTTGTCTTGTCAACTTGTTGCTTTTAACAGCTGAGCTTT GTAAATCCTTTGTTCCGGTTATATGTATCTCTTGTTGCTTGCTTATCTGTTTTGTTTATTTGTTTTGGAAAGAAGAAAAAAAACATTGCACAACCAACTG ATTTGGTATTGAGGGATGTAATTATGTGCTCTTGTTTATTCTGATATCCATCTATAATTTCAAGTTCACGTTGCTTGGAAGTTGAGAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_175959;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_497944

FPKM

• PAB: 3.8
• PNAB: 3.5
• PS1: 4.3
• PS2: 3.9
• PS3: 5.8
• PW1: 2.8
• PW2: 5
• PW3: 4.9

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_497944

• Blastp: Sphingoid long-chain bases kinase 1 from Arabidopsis with 71.7% of identity
• Blastx: Sphingoid long-chain bases kinase 1 from Arabidopsis with 70.34% of identity
• Eggnog: diacylglycerol kinase(COG1597)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G23450)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019452862.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;