Id Trinity | TRINITY_DN50275_c2_g2_i4 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_497925 |
Sequence | CATCACACCAAACACAACACAGCTACTCCGATACAAGGTGATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAAGAAAGAAGAAGAAAAAGGAACTCAGATATTCC ATTCCCGAATACAACAATCACTCCACTGATCCACTCCCGATCTGCGCTGCTGCTCATTAATTCCTTTATTATCTCATTCCAAACCCTAATTACTCGATAG CCATACCATAGCCCCTTGCCTTTTCAATCATGCGCTTCCAACTACTATGAGGAACACTCTTTCCCGTAATTCTACTATTCCTACTACCACTACTCTTAAT ACTAATACTAATACTAATACTGACAATCACAATAATAATAATAATAGAACATTAAGGCTGTCCTCACCTCAACCATCTCTTAAACGATTCGGATTGTGTT CCCCTATCGTCTTCCCGGAAAGGCGAGGTGCCAAACTCAAGGCTTCTTCCACTGATGATCACGCCATAGATACATCCAAGGATTTTGAGCATAGGATTCA CATAGGAGGAAGAGGAATTCCAGCACCTGGAGATGAGAAGTCTGATTTATTAGGATATGTCGTGTTCTCTGGAAAACTTGCTTTGGATAAGAGAAAGCTT ACTACCGTCAACAACAACAAAAACAACAGTGCTGCTTCTCAACAAACCTCTTCTGATACTACCATCAACCAACAAGCTGTTGATGCCAAACTAACAAGCA AGGCTCTAGTTTGGGGATCCCATCTGCTCAACCTTGATGATGTCATCTCGGTTTCTTATAATGTGGGTCTCAGACATTTTACAGTGCACTCGTATCCATT CAAAAAGCCTTCTTGTGGTTTTTCTTGTTTTATAAAATCACAAAGAACTCGTAAGGACTTTCGCTTTGTGGCCTCTAATTTCCAAGAGGCCGTTCAATGG GTTGCTGGATTTGCAGATCAACAGTGTTTCGTCAACTGTCTTCCTCACCCTTTAGTGTCTTCCAAGAAGCAAGCATCCTCCGAATTGCTTCCTACCGATA CCCCTCCTGAGTTGCTCTTCAGATGTAAAACTCCTCCCAAGATGCTTGTCATTTTAAATCCACGATCAGGTCGAGGTCGTTCAAGTAAAGTTTTCCATGG CATTGTTGAACCAATATTTAAGCTTGCTGGGTTCAGATTAGAGGTAGTCAAAACAACATCTGCTGGTCATGCTAAAACTATTGCATCAACGGTTGACATC AGCACTTGCCCTGATGGAATTATATGTGTTGGTGGTGATGGGATAATCAATGAGGTCAGCGCACTACTGTAATGATTCAGTGACTTGTTATCTATGCTGT TTTGTTTTATGAAAATACTGCCCTCTTTGATGTATTGTTTGTTTTCCTCATCAAAAGCCTTTCTAATGTTTTTTGACTGAATCATAACCTATCTGGGACT GATTGAAGGATCTTGGTTGATCTTTGTTGTTCATTCCAGCGGCTCACAGTTAATTTTTTTTATCACATTTAATGTAGGTAGTCAATAGCGTGCATAGCAG AATGTAGCAGGTTTTTGGCCATTCCCCGCAACGCCACGGTGGATAGTGGTGCAAATGGCCGTAGTGCCTGTGGCTGGTCAAATAGTGGCAGAATTGTGGT TCAAATGAAAATTGCGGGTCATGACCCGCTACATGTTTTGCTGCGAGTGGAACCCTAATTTTAGAGGGAAAAATATTTTTTGCCCCTTTTTAATATGTGA CAAGTTTTTTCCCTTGGGTTTTAGGTAATTTAACCTCCCCCTTTTTTCCCTTCCACATAACACGTTGATTTTTCTAGGCCACATGATTTTTAATCGGCTC TACCTTTCTTCTTTCTTCTTCCTAACTCTAGTATACATGTTTGGTTGCTTACTCATTCTTCACCAACATAGAACAAAACTACAAAGCTTTCTAATTTGCA AACATGCCTTGTCTTAACTCTGCAGGATTTGTCCTTGGCCCCTAATTGTTTGCTCCATCATCTCTATTGATTCTCTTATCAAACTAATTGAATCCGTTTT TGACATCATCTTCGCATGGTTCAATTTCATGAGATACAACACTGTTATGACCTCTAACTTCGATCACATCTAGAATTTGTAATACTCATAATATTTTATC TTGATTATTAATTAGGAATCTGTCTTTAATATGATATATTTTAGTATTTTTGTATATTTGTATGTTAGACTATAAATTACTTATATATATTTTTCTTAGC TGTAGCGATTGTCCTGCTACCCACTATCCTGCTTTAGTGTTTTTGGGGTCGGCTATGCTTCGCTATCCGTAATTGACTACCTTGTATAGTTATTGTAGGA GCTGGTTCATAATCACACACCAAGTATTGAAACTGATATATTTATCCCCTCTCTTGAACCAATAGCAGGCCAATATTGGATCAGTGGGGTTTACTATGAG GCAATGGAAACAAAAAAATGAAGATAATCCTTCTTCCCTAATTCCCTCAATGATCTCATTTTTGCCTTTATTTTCTCTCTTCTCTCCTATCTACAAAGAC CATAACAAAATTTCTCCCCTGTCCACAACTCTGCAAAGGTGGAAGCTGTGGTCACAATGCGTCCTTTGCCCAATTGGGCCTTTGATTCATCATGGATCAT ATTCCCTTTTCACACATATGCATTAGTGCTAGGAGACTTGCTAACATTTTTTAGGGGGACAAAAGTGGAGTTAATAATCTAAGTGGGTTAACAGAATAAG TTACTCAAACTGTTGAAGAGTTGTCTCAAGGTTTCATATTTATTTTTTATTGGATTGTTGTTTGTTCTTTTATTATTTTCCTCCAGCATTTCCTTTTATA GAAAAAAAATAATTAATAATGGCCTAGTTATATGGTATGGTTGATTTGCAGGTCCTTAATGGTCTTCTTAGTAGAGAAAACCAAAAGGAAGGAATATCTA TACCTATTGGAATTATACCAGCTGGTTCTGATAACTCATTGGTATGGACTGTTCTTGGAGTTAGAGATCCAGTTTCTGCAGCAATGGCAATTGTAAAGGG GGGCCTTACTGCTACAGATGTTTTTGCTGTTGAATGGATTCAGACTAATAAAATTCACTTTGGATTAACAGTCTCATATTATGGTTTTGTTAGCGATGTG TTGGAGCTTTCTGAAAAATATCAGAAGAGGTATGGCCCACTGCGCTATTTTGTTGCTGGATTCCTGAAGTTCTTATGCTTACCGCGGTACAGCTATGAAG TTGAATATCTTCCAGCATCAAAAACTGAGAGAGAAGGAAATGTCTTAGTTGAAAGTGAAGTACTTGACATGTCAGATCTGTATACCAACATCATGAGTAG ATCGAATAAGGATGGGTTGCCCAGAGCATCTAGTCTTTCCAGTATTGACTCGATAATGACTCCAAGTCATATGTCTGGTGGAGACCTGGATACCTGCAGT AGTACTCATGCTAGCACCGAGCCTTCCGAATTGGTGCGCGGCTTAGATCCAAAGTCAAAACGCCTGTCATCTGGAAGGGGCAATGTAACATCAGAACCCG AAGTCATCCATCCACAGCTCCCTCTGTCAACAACTCCAAACTGGCCAAGAACCAGATCCAAGTCAAGGAATGATAAAGGATGGAGTGGATTGACCACCAC ACATGATACCTCTAGATGGGGCAATTCTGCGACAAATGACAGAGAGGATATCTCATCAACACTTTCTGATCCAGGTCCTATCTGGGATGCTGAACCAAAG TGGGATGGTGAGCCTAATTGGGACGTGGAAAACCCAATTGAGTTGCAAGGTCCTCTGGATGATGCAGACATAGGATCCACCAAGGAGATCGTGCCTCGTT TTGGAGACAAATGGGTTGTTTCAAAGGGACAGTTTGTCGGCATTCTGGTTTGCAACCATGCATGCCGAACAGTTCAGAGCTCTCAGGTGGTCGCACCCAA AGCTGAGTACGACGATAATACTCTAGATTTGCTCTTGGTTCGTGGAAGTGGTAGGCTGAGGCTATTGAGATTTTTCTTACTTCTACAGATGGGTCGACAT CTTTCTCTTCCATATGTCGAATATGTCAAGGTATATTGCATTAACAGTTGTTTTCACTCCATAATTATACATTTAACCACACACTACTTTGATCATTACA CATACTACATTATTTTTTACGATCACAGGCATATTCTTTTATCCTGGTAATTTGTGCATCCGCATGCAGGTAAAGTCTGTGAGGATAAAGCCTGGGAAGC ATACTCACAACGGATGTGGTATCGATGGTGAGCTTTTCCCACTCACGGGACAAGTAATTTCGTCTCTGCTTCCAGAACAGTGCAGGCTTATCGGTCGTTC TCGTGTATGATGATAATTGGGAGTGAAGTGTTTTGATTCTTTGTGATGGGTTCCGGGAAGATCATGTACCTTCTCATTCTCATATATATGAATTCAGATA CCAAATTTGTGTTGTCAACTATTTTGTTGCTTGTAACAGCTGAGCTTTGTAAATCTTTTGTTCCGGTTATATGTATCCGTTGTTGCTTGCTTATCTGTTT TCGTTAAAAGGGAGAAAAACTGCACGTTTTGTGCATTTCAAGCTGCAAGCTGCTGAATGTACTGCACCATCTAATTATTCTAGATATCATCCAAAAAAAT CTAATTATTCTGAAGCTTAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_175959; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_497925
Blastp | Sphingoid long-chain bases kinase 1 from Arabidopsis with 74.5% of identity |
---|---|
Blastx | Sphingoid long-chain bases kinase 1 from Arabidopsis with 74.5% of identity |
Eggnog | diacylglycerol kinase(COG1597) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G23450) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019452864.1) |
Pfam | Diacylglycerol kinase catalytic domain (PF00781.23) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |