Id Trinity | TRINITY_DN50326_c3_g1_i12 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_490128 |
Sequence | TATTTTGCTTTGCACAATGAACTTTAAGAACACACCATGTTATAGTGAAATTCAAAATTCAAAACCCATTAATGTCTCTCTCTTGGGTTTCCATTCTGTG TGAAGAAAAGTGAAAATGTTACGCTTTCTCTTCTTCATCTCCATCCAAAGCTTTTCTCTCCGCAACATTCCCATCAAATTCCACTTCACTTCATCGCATC AATGGAGGGGAATATTCAGCCCAGCAAGACTTTATGGATAGGTTTCCCCCCTTCTTTTCGGATGGATGAACAGATGCTCCATAATGCATTGATACTGTTC GGCGAGATCAATAGAATCAGGAGTTTTCCATCAAAAAATTGTTCGTTTGTTGAATTCAGAAGCATTGATGAAGCTCGGTGTGCCAAAGAGGGTCTTCAAG GACGGCTATTTAATGATCCTCAAATATTGATCAAGTATTCTAGCAGTGAGTTGCCACCTGGAAAAGATTACTCGGGCTTTTATCCTGGAATTAAAGGGCC AAGACCTGATGTGCTACTTAATGAGCATCCATTTCGGCCACCACAGATGGATATGTTTGGCCATAATCGTCCTACGGTTCCAAATAATTTTCCTGAACAG CTGCCACCTAGTGGTAATTTTCCACCAATTGCATCAATTCGATCTTTCGGTCCTCAAGGCTTTGAACCTCCTATCTCTGGACCTGCGTTTAATGAGATGG GCACAATCCACAATTTTCAGGATGGTAGCTCCAAAAGTCAGATAGTTCCAAACTGGAAAAGACCATTCCCTCATGCACCAGAAATGCTTTCTTCTCCGGT GCCAGGTACTAGGCCTCCTACCAGGTCCGCCTCTGGTGCAAGTGATGTACATGGCATAAACCAGTTTCCGAGAGATTCTAAACGCTCAAGGATAGATGGT GGTTTGCTCGTTCATGATGCTCCATTTCCTTTAAGGAATATAAATGGAGGTGTTATTGATCCAAAGAGTCAGCATGGTCCAGTGGGCATATATGGCGTAC CTGGTTCAACCCTATCTGATACAGATCATATATGGCGTGGAATGATTGCAAAAGCAGGAACACTTGTTTGTCGTGCTAGATGTGTGCCTATCGGGACAGG GATAGGGACTGAGCTTCCTCATGTTGTTGACTGCACAGCTAGGACGACGTTGGATATGCTCACAAAATACTATGCTGATGCAATTGGTTTTGGTACCATC TTCTTTCTCCCCGATAGTGAGGAGGATTTTGCTTCGTACACTGAATTTCTTTGCTACCTCAAATCCCAAAACCGGGCTGGTGTTGCAAAGTGTATTGATA ATACCACTTTATTCTTGGTACCTCCTTCTGATTTCCTAACCAAAGTTTTGAAAGTCACAGGGCCTGAACGTCTGTACGGCGTGATTCTTAAATTTCCAAG TGATGTGTCAATGCAACAAGCAACACATTTGCCTGCACCCTCAACTCAGTACATGCAGCAGATACCTCCTTCGCAAACTGAGTATGGTTTGATCTCTGCA AAGGGACAGCAGGTTTTGACAATGGATTATAACAGAATGTCGCATGTGGATTCCAAACTTCCTCCAAAACCATTTCATCCAGTCACAACTGGCCCTCCTT CAGTCCATTCTGTTCCTCCTGATTATCCGCCTCATGCTGTTTCTGCGTTGCAAGCTGGAGTTACATTGACACCGGAGCTTATTGCAACATTAACTTCCTT GCTCCCTGCAGGTACACAATCATCTACAATTGATTGGGCAAAGACAGCAGCAGGCTCCTCGACTGTGCAACCACCATTTCCTTCAGTTGCACCTAATGAT GGAAACCTATCTTATTTGAGGAAACAGGATCATCAAATTGGAAATCCATCTAGTCATCCTTCTCAACAGTTTGGGAGTATGTATAACGTTCCCAGTGCTC AATATCAGCATTATCCATCAGCACCTACTCCTGGCCACCCTGCTCAAGTGGTCCCTGGCAATTATTATTTCCAAGATACTGCTGCCAGCCTGCAGCAGCA AGGTACTGTTTCATCTGGACCAGTGAATAATTTCATTGTTCCTTCTCAAAGTGGACAGGTAGTTGTACCTCCTCAACTCAATCAGCAGTATCCCATTGAA GTCTCCTCCAGCACCCAGAATGGCTATGGAATGGTTCAGGGAACAGATGCCTCTGCATTATATAGTTCTCAGGCTTTTCAGCAACCTTATAATCCAGTTG CCTCATTTAATCAAGTTCCGGATGCTAATCCTTCACAACAACAAACTGTGTTGCCCTACACAGCAGACAACGTGAACTCAGAGCCTCCCAGTCAGCAACT GCATTCTGCTAATTTTGGAGTTGGTCAGGGTGCATCAGAAGTGGAGGCTGATAGGAACCAGAGGTATCAGGCAGCGCTACAGCTTGCTTCCAGCCTCCTC CAGCAGATACAGCAAAAGCAAACTGATGGAGGGCATGGCCCAGGAAATCAACAATGAGAATTGTTCTCTGTAAGTAATCATCCAATGACTAATTCTTTTA AATAGATAAAATCTTTTATATGTAAACTAACCTAGGTTGAATATTTCTTTACATTTAGGGATTGCGATCATATTTTTATTATTTTTCCCAAATCATCTTA TGCCATAGGGATTTTATGCCATATTCTTATTATTTCCCCCAAATCATTCGTGGGTTCTGAACCCAAAATCCTGGAAAACTATCTTGTCCCTGAGAAATAT GGAAGTCGAGTCTCTGAACTTGAAATGATAAGTTAAGCACTCAAAGGCCAATGTTTGTGTGAGGAACTCTTGTGATACAGTTTTGTGCAGAGGATGTTTT GGAACATGAAACTTATTTTCTTTCCTGGGTGGGGGCATTCGAAGAGAGGATTCAACGTGTTAATTGGTTGATTGTGTAGGCAATTTGTTGTGAGGCTGGG TTTTTCCTTTGGTAGGTTTGGCAGCCAACTTGTTATTAGGATTGTTTTCTTGGTAATTTTAGGATCACTTATTACACTAGTTTTATGCATAGTTATTAAT AGTAGCACACTATTCATTGCAGTTAAGTCAATATTGATGAGGAGGGTTGGCTTTAGAGCTTTAAGTAGCAGTTACTGTTAGTGTTTAGGAACCCAATTGA TAGGGAGGATTAAGTATTTGGTCCTTCTGGGAAAATAAGTTGCTTTTGTCTTTCTAATATCTATACACTATCAGTGTAAAGATTTATACACAGACAACAT ATCATCCACCATTCATTAGTATTATTACTTTTTTTGAAGAGTCAATGATGATTGGAAATCAATGGTGGATGATGGTCTAACAATGTGTAAAACTCTTACA CGGTTACTGCATACATCTTTTTCTCTATTTATAAAGTACTTTCCTTAGTAAAATTGTTTCATCAAGTGGCTTAAACATGAACCATGTAGCACAATCCCTA TGGTACCTGTATAAGAATGCTTGTGCCATGTTTCAGATTGAGTCTAACAAATAGCAAATACCCCATTTGAGTAGACCTTACTTTTACTTACTGTGTGCAA TATCATTAACTTTATTTATGATTGTTTTTAATTTATTTGACTTTTAATTCCATCATATCCTGTTCCATTCTGTCTCTGCAACATGTCATAATTTTATTTC TGATTATTACTATAGCGTACTTTTTGATTGGTTGAACTTGTTCTTAGATACCCATAAAATATGGCATATTGAATCTTAAATTTGCTCTACTGCAGTGTAA GTGTAATACTTTTAGGGCTGGGAATCCAATCCTTCTAACTTACTACACAGTGACCTATAATTTTCACTATGTAAGGATCTTTAATGTGCTTTCAAAGATT ATGTGAGGACACTTGCTGACAAATTTGCAAATTTAGAGTTACCACTATTAACTAAATTTTCAGTTAACCATCCTCAAGAAATTTGGGACCAAATGTCAAT TCTTTCTTCCCCCTTGTTTCTCTCATGTTCCCTTGTTAATTACCAAAGTGAGAATATAAAAAGTACACATTTTTCTTTGGGATATGAAATGGATAATCAT ATAAAGATCACTACCTCAATTTTTTTTGTACTAGTAAGATCTATGCACTGCGAGTGTACAAATTTAATAACTATGTAAAAAACTCTTACACCAGCGGTGC CCGAAAAAGTGATCTTACTGGAAACGTATGCAAACCCAAATGTTAAATCCTGGGAACTACACTTTTGAATGTTGTGTTCTCATGGCAACATGATCATGTT GCCCACGTGGTTGGTCTCTATGCCGTGTCCTGTAGTGAACATTTTGATTTTTGAGTGTGTTTGATTCTCTAAATGAAGGGATATAACAGAATTTTTCTTA TTTTCCTGCTAATCCATGATACAAAATTTGTCAATAGTACTAAAATGTAACCACCTTCACAAATTCACAATCATCATCTTGGCCTTCACCATCATCTTTT CATCAATATTACCACCACCATCAATAAAGGGCGTTTTTGTACTTTCCACATCATTTTACGTGTGTTGTCTACTAAGGGTCTGTTGGTGAGTTGACTTCAG TGTTATCTCGTCAATCTTCACTTACGGACTCAAGGCATTAATTACCGAATGACATGAAATAAAATTTGTGTTGAAACTCAACTAATTTTGTATTAATCTA TTTGTGTTGTAACAATAAGTTGTTGGTCCAGTGATGGAAGATCATCCTTGATCCCAAGGATATCCAAAAGGTCAAAATTTCAATTCTTGTAAGTGACATT AATTAGGAGGGATAATCGTATACCTCAAAAATGATTAATTTATTACCCATAATAAGATGAGAAGATACTTAGATCTTAGTAGTACTAACATAATCTACTT GTTTTGTCTTTTGGTGTGTATTGAAGAAACCCTTTTATTTATATCTTATAGGTGACAATTTGGGCTGGGTAGGTTCATGTTTGGGCCATGATCAGGTTAA GCCGAAAAGTTTTTTATAATAATTAGAAAAAAATCACCTTAAGCCCGAGGTTGGGCCATTTATTAAACTATATTATGGGCTTTTATGTTATATGAGTGGG CCAATCCAGAGCCCATGGGTTTATTTGAGAGGATTTTAAAAACTTTATTCTGGTCAAAATAAGATATGAGCTCTACTTTACTTTAATATAATCTAAGCTA TAAATAACACCTGTTTTTTTAGAACATGTAGATTGTTATAGCTTTGGGGCATTGGTTTAGAAATCAAAGTTAAATTTTTTACCTTGGTATATTCAAAGTA GCAAGCACTTAATGCTTAGATATATTTAGCTATGAATGTTTTTCAAAGATTTCAATATTATTATCTATCTATTTGCAAAATGGTTGATTAATGATATGAT TTCCCATACCCCAACAAATAAAATAAGTGAACAAGGTATAAGGTATTGCTAGAGTATGAAGTTACCAACAATTATTTACTTTGTTTGCAAAGTTACCAAC ATGCATACTAATGTTGTATTATTTTTTTGTTTCCTATTTTTCATGGAAGTGTAGGTGATGGTTGCATGGAGC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_176408; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_490128
Blastp | Flowering time control protein FPA from Arabidopsis with 39.3% of identity |
---|---|
Blastx | Flowering time control protein FPA from Arabidopsis with 38.94% of identity |
Eggnog | Rna-binding protein(COG0724) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G43410) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019448259.1) |
Pfam | RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) (PF00076.21) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |