Ll_transcript_488588

• Id Trinity: TRINITY_DN50335_c1_g1_i18
• Name Transcript: Ll_transcript_488588
• Sequence: GAAACACATTAACAGAACCACTTCCATTTTGTTCTCAAAACCGCTAGTAGGTCCCACCAATGGACGCAACCGCCACCGCACCCGCCGCCACCCCAGATTC CGCCACCACAGACGACCAAAATCCGTCGGCAGCAATAACGCGGTGGAAATTCGAGGTCTCAAGGCAGTACCAACACCTTCTGGATAAAACGACGCCGTTC GTTCTGTACCGTTGGATCGGGTTCTTTGTAATAGCGTTGATCTACGTTGTCCGCGTTTACTTCGTTGAAGGATTCTATGTCGTTTCGTACGGACTCGGAA TCTATATCCTGAACCTTCTGATCGGGTTTTTGTCCCCTCAGGTGGATCCAGAAGTTCTAGAACTTTCTGAGGGTCCCACACTTCCCACGCGAGGTTCCGA TGAGTTTCGCCCCTTCGTTCGTCGCCTCCCTGAGTTTAAATTCTGGTATATCTCCGTTTTTTCATTTATTGATTTTCTTAATTGATTGTTTTATAGTTCT AGGGTTTTTTAATTGAATGGTTGAAATTGAGAATTGAGGATGGTGTTGTTGGTAATTCGTGGGTGTGATTGAATTGTGTGGAGGTGTTGGTTGAATGTAT GTGTTTTGTGTAATTTAAGGGTTTGCTTGTTTGAGGTGGAAAATTGAAACTTTAGCATGGGTTAATGAATGCACACATTTGGATAATTTGATTCGATGGA GAGATAAATCGTGGCTCTTTCCGTTGTGCAAGAGGTAGGAAATAATGGTGATTCAAGATGAAGCTGAATCTATGAAACGCCAATGCTTCACAATAATCGT GTATTAATAATTTTTGTACCTTTACTTTTGAATTTTGTAGATCATTATTAATGGAAATGCCACAACTATTAGATAAATTTTACTCATGCTAACTTTTGAA ACATTATTTGTCTCTTTTAGTTAAAGATTTGTTTTGAGAATGGGAGTGATAATTGTGTGTTATGCCCATGATGAAGAAGTTTCTCATAGTTTCAACCATA TAGTCGTCCAAAGAGAGAATTTGAGACCGGAGGAAATTTGATAGAAGTAATTCAATTTCCTTATACTTAGCATTTTAGCTTCAGAGGAGATCGGTCTGCA TAATGTGGAAAAGAGTCAAAGACTAGTTGCAAGATTTTGTACCGTACTCTGTTTGAGTTGTTATATATCGTGTTATTAATGTGAAGGAAATTGTAATCAT GCGTGAAACCAAAAGGATAAGCATTTCACATGAGCAAATAGATTTAACCTGTCGGTTCTATACTGACAAAAATCTAGATTTTCATTCATGCAATTTATGA GCTGTTCAATGTTCCTACACTACAAAACACTGAAAATAGTATGACATAATATTATTAACAATGATGAGCTCTGCATAGAGATCTTAATGGAGAGAATATT TTCATAGTTCTTATGGTCGTTATTGACATATACTTCTGCTTGCTTTATTACTTTGAAATTACTAATCAGAGGGTTTTTCGATATTATATTCGCTTCGGTA CATGAAGGAGATGTCAAATATTTGGGTATTGACATGCAAATGCTGCTTCTATTGATGCTGCTTTATTTTCTGTTGACAGGTACTCAATCACAAAGGCATT TTGCATTGCATTTGTGATGACTTTCTTTACTGCATTTGATGTTCCAGTGTTCTGGCCAATACTCCTCTTCTACTGGGTGGTCCTATTCACACTTACTATG AGGAGACAGATATCTCACATGATCAAATACAAATATGTACCATTCTCATTTGGAAAACAGCGTTATAACGGAAAGAGAGCAGCAGAAAGCACAAGCCTTT CCGAGGACTAAAATTTTCAGGTTAATTGAACTTTATTTGCTTCATTTAAGTCACAAATCTATATGTGGTTTGATATCATTTAGATTATATTATAATAGAC AGAGGAATCTGAGGATATGGTTTGGACTCTTCATCTAATGTTGAATGATGATCTGCTATACTATTTATTTTTAGAAACCTCCCATAATTCCAAAGAGCCT TCTGGTTCTAAGTCACTAGATTGCATCATATGAAATCTTTCGTTTCTTGCATATCATAATAATGACTCATGAAATTACCTACATACTGGTGCATTAAAGC ACTTGAGGCTTACATAAACTATTGAATCAGGCACCAATTGATTGGAGAAGACAGATTAACCAACTTTGGTTTCATGTCAGGGATGTCCAATGAATATTGA AGGGACTACTAAGGTGAATATTGAAGGGACTACTAAGGAACCCCTGCTCTCACATCTAGAGGCTTTGCCGAGGAAGATTTTAAAAAAGTAGCCGAGTTCT TTATGAGGCAGTCAAGTTAGCCTTACAGATTAAGGCAAATTCCCAAGGTGCAAACTTCAAAGATTTGGTAGCAGCTATGCATTCTGATGCACACATTCAA CCCAAAATTGCTAAAGTATGCCATGAAGTAGACATATTCTTGCGGTGTTCTTAGTGAATAAGAATATTTGTTATGTATTTTGTTTTTAAAGTGTCATATG AGACTATTTTTAGTTTTTTGAGATTTCATGGTGTGGTTGGATTTATAATGAAGGATGTAGTATAACTCTTTCAATTTTGTTACACTACCTTGGTTATTTG CAATAAAATTTTATTATTGTAAGAACATTGTATTTAAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_176470;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_488588

FPKM

• PAB: 1
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.5
• PS2: 0.3
• PS3: 0
• PW1: 0.7
• PW2: 0
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_488588

• Blastp: -
• Blastx: Protein RER1A from Arabidopsis with 67.92% of identity
• Eggnog: RER1 retention in endoplasmic reticulum 1 homolog (S. cerevisiae)(COG5249)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G39220)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019446804.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;