Ll_transcript_489059

• Id Trinity: TRINITY_DN50367_c0_g2_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_489059
• Sequence: CATTAGCTGGGTGTGCAGCTACTTTGGGGTCATATCCCTTTGACCTTATCCGGACTATATTAGCTTCTCAGGGTGAGCCAAAGGTATAAGCATTATTAAA TTTATGGTTACATGGTATTTTTGAAGTAAATTTGTGTGATGCTTGTTAGAGTTCTGAAGGCAAATAAAGCAAATTACCAGTCTGCTTTTCAAATACCCTC ATCCAGTCCAATGACTTTTGCTTGTTCCTTTCCGTCGTCATGACATACCTACTTCTCACTCTTATATGATTTAAAGATTTATGTCGAGATCATCCTTTTT GTTCAGTACCTTCACATGTTGCAAGTGGTGGAGGTGCCCCATTTCAGTTTCTTCTTGAGTTCTTTTCAAGTTAGTGGTACCACCTATAGAATTTGTCAGA TCAGATGATATCATGCACCGAGTAGCACTGGCTTAGAAGCGATCTTAAAAGTGAAATTGACTTTGTAGTGCGCCGTACACTTTTAGACTTTAGAGAAGTC ATACTGAGATTTCTTAAGGGATTGGACTTAAAATGAATAATATAGTTATTTGTCCTCCTTGTCAACATCTGAAGTCTAATCATTTGCTAATATCTAAATA AGTGTAGTGGGAGAAACTCTACAGATGATAAGGGCAATATAATAAGTTACATTTATTTCTATTGGAAAAATCCTGGGACGAGTCAGGGACATGCACCCCA ACTCGTTAAAATATTTAGTGATGGCAGCATACTGCAATTTGTCGTTGAGATCTAGTTCTCATGATTTACTCTGGGGTCATTGTGATTTGTCAATTCAACT ATTATGATTGACTTAAGCTTAGATGGCTAATGGATTGAAGGAGTACATGCCAGTATAATTATGCCTCCTGGGCCTGTATCAGGCTTGTTCATCATCGGTT GTATGGCAAATATAGGTTGTCTCTTCAAAGATTTTTACATCTGTGTATATTGGGTTCTTTTGGCAGATATGGCTCAGGCCTTTATTAGTGAAGTCATGAA ATCTCTTATTGTTCATTTTTCTTTTGAGTACTTGAATATGCCATTTATACTATTTTGTTTGCTTTCTGTTGAAATGCTGCTGATCTCTGATGTTGTGGTC CCTTTAATGTTATTTTTTGTAACAATGCTATGCAAATATTTTGCCATCATTTAGGTATATCCAAACATGAGGTCAGCATTAATTGATATCATCCAGACTC GTGGATTCCAAGGATTGTATGCTGGATTGTCACCAACCCTAGTTGAGATTGTACCTTATGCTGGCTTACAATTTGGTACCTACGATACATTTAAGCGTTG GGCCATGGTAAAATCTCAGTTCTACTTAATGTTTCTTTCTTATTAGTTGACGAAATTATGTCCTGCATGCAATATTTCCGTTTGTTTATGTTGCGACTAT AGTAAGGTGAGATTGTACATTATCTTAGATTCTGCATGACTGATTATTCTAGCTTTCTTTGCTCTGTCTTATGCAAGTCCCACATCGTCTACCTCATTGT TTGAGGAGTGATTTAAATACATGTTGGGACACTCCTCTTATTGTCAATTGATTTTGAAATGAATCCTCAATATGGTATCATAGCACGGCTTCTCTCCCTA GTTCTTGGGCCAAAAGATGCACTTTTATCTTAGGTCAAAGGTAACCCGTAGTCTGGTATGACAAACTTATGTAGAGGGGACCTAGGGATGTTAGAAAGTA AGTCCCACATCATCTACCTCATTGTCTCAGGAGTGGTTTAAATATTTGTTGGGTTACTCCTCTCATTCTTAATTGTTTTTGGAGATGGGACCTTAACAAA ACCTTTTCTCATTCCTTTTGGTTAGATGAATGTTTGTTTAGTTTTGAGGATTGCTCTTTATTAGCTTTAGATTCTTATCATACCTCTTGCTTAGGTTAAC CCTGCCCGGATCTGCCTGGACTCTGGACATGGATTTCTGTTGGCTTTGCAGTGTGGTTACTCTGCTTGCACTAGCCATATGTACTAAAATGTCAGTACGC AGCAGTCTGTGTTAAACTAAAATTGTCCACTTTGCATTTTGCTTATAGTTTAAACTAAAATTGTATTAAATTAGTAGCAGAGTAGAAGAGGAACCTTGGA TTTATGTGACTGCAAATTTGTTTTGATTTGTATGTTGTAACCTTGTATCAAAGATGGAATTGGAATCTTCATACAGCTGATGAATGTTTTGTTCCAGTTT CACTTTACAGTATGCTATTCAGTGAGACCTCTTTATTTATTATGTGCATTGTTTGCCTGGAATTGTAGGCTTGGAACCATTTCAGATATTCCAACACCAT TGCAGATGATAGCCTTTCTAGCTTTCAGCTTTTTATCTGTGGGTTGGCGGCTGGGACATGTGCCAAACTTGTTTGTCATCCACTTGATGTGGTCAAGAAA AGATTCCAGATTGAAGGGCTTCAAAGGCATCCAAGATATGGAGCTCGGGTTGAGCATCGCGCATACAGGAATATGTTTGATGCCATGCAACGCATATTGC AGTTTGAGGGTTTGGCTGGTCTATACAAGGGGATACTCCCATCAACTGTTAAAGCTGCACCAGCTGGTGCTGTAACATTTGTTGCATATGAATTGACATC AGATTGGTTAGAGACCCTATTTTGAATTGATGGTTCACACCTTTTATGATTAGCTATCTCATTCTTTTTTGACAAAATATAAAATTGATTCCCTCATAGG AAAGCCCCAGGGATGTGTTAAATTTTTTAGTAGTAAACTATACTGCAGTTCCATTAGATGGAAAGTAAGATCAAGTAAACATCAACTTTTGTTGCATTTG TCTTTTTTGACAAAATATCATTCTTGATGCTAACATGTTCTGATTTCAAATGTAAATTTCTAAAATGGTCCAAGTGCCTGTCTTTCTGTCTACTTGTGGA ACCAAGTAACATGTGTTTGGAAAGTATGAGGTAAAACAATAATGTTCAATTCCCTTCCTATGAGGTAATAATTTCCATGAATTGGCAATGGAAAGTGTGA TGTTCCATTTTTAGCTTTTTATCTGCCTTTTCTTAAACAATAACTCAATAAAATTGTCC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_176719;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_489059

FPKM

• PAB: 0.6
• PNAB: 0.2
• PS1: 1.2
• PS2: 0.5
• PS3: 0.7
• PW1: 0.6
• PW2: 0.6
• PW3: 0.5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_489059

• Blastp: -
• Blastx: Mitochondrial thiamine diphosphate carrier 2 from Arabidopsis with 75.63% of identity
• Eggnog: Solute carrier family 25(ENOG410ZRF1)
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019450973.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;