Id Trinity | TRINITY_DN50412_c0_g1_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_346377 |
Sequence | GGCTTTGTAATTGTAAACTGCAAGACAAAACGGTGTCGTATTTTATCCTGAGTCATTCCCTTCACTCACTCACTCCTCTTGTACTCTGAATTTCTTCGAC ACAAATTACATTAGAAAGGGGGTTTAGGGTTTTCGCTCCTTCTCTTCCTCTGCGAGTGCAATTTGAATTCTCGATTCATTCAAAAATCTTCTTCACTCAC ATTCACAATGATGTACGGTGATCCTCATAACCACCACCCTCATCAACAACAACAACAGCAGCCGCCGCCGCCACAGCATTTTCAGCATCAGCAGCAGCCA GGTCCAGAATTTCACCGTGGACCACCGCCGCCGCCGCAGATGATGCGCCAACCTTCTGCTTCCTCCACCAACATACCTCCAGAGTTTCACCACCCTGCTC CTGGTGGGCCCCATCCTCCTCATTACGATGTTCATGGTGACATTCATGGTGCAAAAAGAATGAGAAAGCTTGCTCAAAGGAAGGCGGTTGATTATACGAG CACAGTTGTGCGTTATATGCAGATTCGTATGTCGCAACGAGATTCAAGGGACAGGACAGTACTCCAACCTACCCCAGCAGCAGCAATTGATATGTTACCA GCAGTTGGCTATTCAGACAATCCATCTACAAGCTTTGCTGCTAAATTTGTTCATACATCTATAAATAAAAACCGCTGCCCTATTAACCGTGTTCTTTGGA CTCCAACGGGACGGCGTCTTATTACTGGCTCGCAGACTGGGGAATTCACTCTCTGGAATGGACAGTCTTTTAATTTTGAAATGATTCTTCAGGCACATGA CCAAGCCATCAGATCCATGGTCTGGAGTCACAATGACAACTGGATGGTCTCTGGTGATGATGGAGGCGCAATAAAGTAGATATATACTCTAATATGTTTT GTGGTTTCTATAAGTGTCATTATATATTGAAGTAGAATAGTAAATTTTGATGATTAGAAGCACATGTGTTAGTTGATGTAATTGTATGTATGGAACAATT TTCTAGGTATTGGCAGAACAACATGAACAATGTTAAAGCCAACAAATCTGCTCATAAGGAATCAGTCCGTGACTTAAGTTTCTGCAGGACAGATTTGAAG TTCTGCTCATGCTCTGATGATACTACTGTTAAAGTTTGGGATTTTGCACGCTGTCAAGAAGAGTCTTCATTAACTGGTAATGTGCTTTGAGGATGAGTTA TCGTCTCCTATCTGGTTGGAGAAATGAATCTGGATCACTAATAAGATACTATTAATATATTTACTGGGGCCTTGACACTGATACTGTTCTCTTAATTACT ATGTGGTGACTCCATTAGTTAACAGTGTCTGCTTTATTTGAGGCTTCTCATTTACAAACTATACTATTCAGGAACTTGAAATTGGATTCTGTCAATGTTA AAAGTAATCTCATGTTTCTCAATCTCGGAGTGTGGATAATAGAGGAATGGTAATTATAAAATTGTTCAGAGCTTAATTGCCTTTATTGGTTTGTATTGGC AGTTTGCAAAATTATTCTTGTTAATTATATCTCATAACATTTTATTGTGTAAATATTTTGTTTGTTGTGCAACAGGTCTCATCTTTCTATTGACCAAGAA CTTGACCATTCCACTTAAAATTTATACTTTTTACTTTTATTTTAAAGCCAATTTACTCAGTTGCTTGTAAAATCAGTTCCTGGATATAGATTGTTAGTCT TAGAATGCATCTTGTGTTTATATTATTCTTTCCCTGTTATTAATTGAACCTAAGAATTCTCAGTGTGGCATTTGAACTCAGGCAGGCCATGGTTGGGATG TGAAGAGTGTTGACTGGCATCCTACAAAATCCCTATTAGTATCAGGTGGGAAGGACAATCTTGTGAAACTTTGGGATGCTAAATCGGGAAAAGAACTTTG CTCATTTCATGGACATAAAAATACTGTGCTCTGTGTCAAGTGGAATCAAAATGGTAACTGGGTGTTAACAGCTTCAAAGGATCAAATAGTAAAGCTTTAT GACATAAGGGCTATGAAGGAGCTTGAATCATTCCGTGGACATCAGAAGGATGTTACTGGTAAATGACACATCTTTTTTCTTTGAGAAGGCTAGCTTATTG AGTTTAATATATCCTGCAATCAGGTATTAGACAATGACTGGTGAGTAGATATATGATGATGAAAACAGGATGTGGCACTGTAAGCTTTTCAGCTAGAGCA ACCTGACATTGACTATAAAACATTACTTTCATGTCACATTTTCACTTCTGTTTGAGAAAAAAATCACTTAACAGGAATGCAAGTTTCTATTTTTGTAAAG ATTTGTGTATGTGTAGCCAAGACTAGATTAGTATAACTAGAATTCTGCTTCGGTACTTGCTGATGGAATTATACGAGCAGTTTCAAGTGAAACTAAAATG CTGGTGGAATATGTATTAATGTTGCATTAGATTTTAAGCTCCTTGAAGTTTTGATTGAAAAAGTTGATTAGAATGATTTGATTACCGGCAATGCACTCCA CTTCATCCCAGTCATAAGTGGGAAGTGTTATTTTCAAGGCCGGGCAAATCTTTATTACATGGCATGACTTTTTGGTTTTCTTGACCATCTTAATTCTTAA CAAGCTATGACTTTAAGTTATTTAGGGCATGTGTTATATTTATTTTTTGACTCACAATTTGGCATCATTCTCGACCAATAGTAGCTTCATTGGCTACCAC CGCTTGCTTCACCTTAATAGTGCCTAAATTTTTTAACTATTATTTCTATAGTTAAATTAAAACTTGAGCTGCCAATTGGTTAGGTGATGCAACAATTTAA TCTTGATTACTTTGTTATCCATCACTGAAGCACTCAGGCTGCAGTTTATTGCTTTACGTTATCTGCTGAAACCTGGTGAATTCTCTTATTATGATTTATA ACATTCAAGACCATGCTTTGCGTTCATGCATGCATAAAGTTCCCCAAATTGTTGTTGTTTAGGTAATAGTTAATATGTTTTGTTGGCCTACTGGGTTTTG TATCATTATGAGGACTGTTGGGAAAATTACCATATTCTCTAATGTCCTGCAAAGTCATAGAATGGAATGAGTTTCATGATTTACCTTTCACACTTTGTTA GCTTTGGCTTGGCATCCATTCCATGAAGAATATTTTGTCAGTGGGAGTTATGACGGTTCCATCTTCCACTGGCTTGTCGGGCATGAAACTCCGCAAATTG AAGTTACTGGTGCTCATGATAATAATGTGTGGGACCTTGCATGGCATCCTATTGGATACCTTCTCTGCAGTGGTAGCAGTGATCATACAACGAAGTTTTG GTGCAGAAATAGGCCAGGAGACACTGCTCGTGATAGATTTAACAATGGAATGCAAGGATATGCTGAGCAAAACCCTGTTCCTGGTCGTGTGGGTGGTAAC TTCGCAATGCCTGAAGGTCCAACAACTCCAGGACCATTTCCCCCTGGGTTGACTCGAAATGAAGGTACCATTCCAGGTGTTGGAGTTGCGATGCCCATAC TTGATGTGCCTCATGGGGAGCAGATACAGCCCCATCCTGCTTCCATGGGTGCTCCTCCTCTTCCACCAGGTCCACATCCCTCTCTTCTTACTGCCAATCA ACAGAGACCATACCAGCAGAATCCTCAGCAGACCCCACAACATCAACACCAGGGGCTACCACAACAAATGGGTCCTTTGCCTATGCCCCCAAATATGCCA CAGCTACAGCATCCTTCCCAGTCATCCATGGTCCCATATCCACATTTGCCTCGCCCTCCACCCCAAATGCCACATGGAATGCCAGGTCCTACGTCACACC CGGTGCCTTTGCCAGGTCCAATGGGTATGCAAGGTGGAATGAATCAGATGGGTCCTCCACCACCAATGCCACAAGGTCATTATGGGGGCATGAATCAAAT GCATTCAGGATCCTTGCCCCCAAGTGGAGGGCCACCTGTTGGAGGTTTTCCCGGCAACTTGCCTAATATGCAAGGGCCACCAAATACCGGCTATCCTCAA GGATCATTCAACCGACCTCAAAGTGGACAAATGCCTTTGATGCAAGGGTATAATCCTTACCAGTCTGGAAATCAATCTGGGATGCCTCCAAACCCACAAT CAGGGGCACCACACTCTTAAATGCCTCAATAGAAAAGAAATTTGCTTTCTTCATTGTAGCTGGTTATTGTTTGCTTTCTTGTAGTTCGGTTCGATTCTCG TGCTGTTAATTAGCGAACTTTCCAAGTTACACTTCATACTTTTCTCCTTTTGGATTTGAGTAGTTTCAGATATCAGTTCAATCTTTACAATGAGCAAGTT ACACTTCATACTTTTCTCCTTTTGGATâBLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_177014; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_346377
Blastp | Flowering time control protein FY from Arabidopsis with 41.81% of identity |
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Blastx | Flowering time control protein FY from Arabidopsis with 73.58% of identity |
Eggnog | wd repeat(COG2319) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G13480) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019413793.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |