Ll_transcript_345589

• Id Trinity: TRINITY_DN50430_c1_g1_i9
• Name Transcript: Ll_transcript_345589
• Sequence: CATGTTATGATTGCTTCCTTACTTAACAGTATAGCTGTTTATATGTTTCGGTTTGGGATTGGCAATGACATGCCTTGTTATGTGCATTTTGATATTGATT AGCATTGAATGTGCATTTTGATGAATGTATATAGTTGTGTTTCATTTGGTAGAAATTCACCAAACTCAATTTTTGTTATGGCTTGACTAGCTGAGAAATC GGGCTAGGTTGCATTAGATCAAACCTGGAGTCTTGAAAACGGGAAAATTATTATGTGATCTATGAAGGGTTCATAAGGTTGGAAGGTTGTTCTATCATTT GACGAGCTTGTGATTTTTGGTAAGCACAGGCTTACAGGTTTAAATCCTAGATATGTCAGTCTCTTGGGGTTATCCTTGTGAATCTCTTGGGCCTGGCGTA GTTTGTCTACCTTTGACCGGATTGGACTCGTAATCTGACTTGGTCCCTAGCTGACCACAATATAGATAATTACAAAAACATTGATTATTTTATGGAGAGG TGGATCAGTTGTTTGTGAAATTGACTTTTCAATTAAATTCATTATTTTAATGGTTGATTAATCAGTCAAGGTGTTAAATCTCAATGTGGATCTTCCGATC TTATGGTATAAAGACTCAAGTTTGAGAGATCCACCTATTGAAAGACTTGTCATTGCAGAATAAATATATTTGGCTAGTTATTTCTGTGCCATGAAAGTTT TTGGAGGCGATGTGGAAACCGATAGTGGGGATCTGGATAATAACTACATGGCAGTATACAACCATGTGTTTCTGCAACTGGTTGGCATGCCCCATTAATG TCTTGCAGAGGAAATCAGGACAACATTGTGTTTACATGTTTATATTATTTATTTCGGTTTGATATTCATTGCACGTGCCCTTCATTTGAGGTTAGCTTTT CTAACAGTCTTTTCTGTTGTTGCTTTCCTTGGTATGTTGAATGGATCAGATCTATGGCTGCCTAGGAGTGAAAAGATGATCAATGACATGAAGTTATTAT CTTATGTTCCTTGTGTGTTCATGTGGTATGAGAATCTAGATTGGTGAAACTGAATAGATACTTAATTGGAAATAAATGAGCCACTAAATTGCACTGATCT CCCCTTCTAAACTCTCGTTTTAATTGACTTTTATTTTCCCGGGAATGCATATACTGGGAAAATTGAACAGGATGCACTTGTCTGATAAACATGTTCATCC AGGATGATTTGTAATTTTTGAAAGTAGAGGGTCCATTTTTTTATTAGTATTATTGTGCTTTCCTTGATTAGTTTGGATTGGAATGCTTAGCATATGTATT GCCCTAATAAAATTTCTTGCTTGTGGGTTCTGCTCTTTGTAACTTTTTTTGATCAGTTATTCTGTTAAATAAATTCTATAAAGGAAGGGAGGGAAGAACA TAGTAGAATGATGGGAGAAAAGATTGATCCATCTATAATTATATATTTTTTATGTAGATCTACAAATTTAGATTCATGGAGTCCTGAGCAACTAAAAACG ATGAGCTTTGGGGGAAACAATCGTGCACAGGTTTTCTTTAAGCAACACGGTTGGACTGATGGTGGTAAAATAGAGGCCAAATATACATCAAGAGCTGCTG AATTATATAAACAAATACTTTCTAAGGAAGTATCTAAAAGTATGGCTGAGGAAGCAGGTTTAGCATCATCTGTTGTTGCTGTCCAGTCTCCACAAGTGGC TAATGGACTTCCTGAAGTTAGGACCAATGAGTTACCAAAAGAAAATAGTCTAGGGAAGCCTGAAACGCCTGAGAGCACTTCTTCACCTAGAGCTTCACAT ACAACATTTTCCAGTACTGTAAAAAAATCTATTGGTGCCAAAAAAACTGGGAAGACTGGGGGACTTGGTGCTCGGAAGCTTACTAAAAAGCCAAGTGAGT CTCTATATGAACAGAAGCCAGAAGAACCACCTGCTCCAGTTTCCTCCCCACCAAACAACAATTTGCCTACTGGACCATCACCACCATCTCGGTTTGGGTA TGTAGAAAATGTCCACTCATCTGATTCAAATTCTGGAGCGGGGGATACAAAAATGCCTGGTCATGTGTCTGTGCCGAAGTCATCAAGCTTCTTTGCAGAC TTTGGAATGGACAGTGGTTTTCCAAAGAAGACTCTGTCAAATTCCTCGAAAGTGCAAATTCAGGAATCTGATGAAGCAAGAAAGAAGTTCTCAAATGCTA AATCTATTTCTTCATCCCAATTTTTTGGAGATCAGAATAAAGCTGGAGATTTGGCTGCTCAGGCTACTTTGTCCAAGTTTTCCGTATGTATCCTTTCTGT TAATAACTTGCTCGATCATTGTCTGAGTATACACATTTAGGTAGATCTTGGATGTTCAATACTGATTATGGGACTGCATCAGATTGCGTATTTAAGATCT CATAATTTTCTGGCTGTTAGAATTCATTAATTGATATCTCGTTTCAAATGAAATGCTGAGATTGAGAAGGAACAGTCACACTTTCGAACTAGTAGCCACT CACAAAAAATGCAATCAAATTCTAGACAAGCATTTATGTTGCTGGGATCACAAATTTATTTTTCATTTTATGTTTGTGGCCAGCTGTAATCTGTTTTATG TTCTGTGATAGTAGCCATGGAAAACTGTTATCTTGATAAGTACAAAACACCCCAAAAATTATTTCTGAAGGCTGAAGCAGACTCTGGAAAAAACTTTTAT TGTTCCAATTCCCTACACCATTCTAAAGTCATGTCTCTAAGTGAAAACTCATGTGTCGGTGTCTCGTTAATATGTTTTATTGATAAAAGCTTCTTAAATA TGTTTTCAATAATTAGCTTAGCTATTTTTCTTTATCATTATGATAATGTATGTAATTTAACTTATTATAGTTCTAAAAACCCATAATGATGTGGTAAAAC AGGTAATTTCCCATTTTAATGAATTGAGAAGGGTGAACTGTTTTCATGCTTTATGCAATAGCATTCTTATGTTTTATTGAAAACAACTTATGACTTGTCA CAAGCATGAACAACTTTTTTATTAGAAATTTTTATAACCCTGTAACGGGGTTGTTTTAAGGTTGATGTTTTGACAGAATTCTTCCTTTTGTTATTTCAAG GGTAAAACTGCCATCTCCAGTGCTGATCTTTTTGGTGATTCAGACTCTTCCATTGATCTTGCTGCTAGTGACCTCATCAATCGGATATCATTCCAGGCAC AAGAAGATATCTCTTCCCTCAGAAACATTGCTGGAGAGACTGGGAAGAGACTCAGCTCCTTGGCTTCCACTTTGATAACAGATCTTCAAGATCGAATACT CTAACATTGTATGCTTTGTATCAAAGAAAATCCTTGGAGAAACAGCCACTTTTGTTTTTGAATGTAATAGAAGATTGTGCAGCATATGATTCTTTGAGAA ACAGATAGAAGGTGCTATTAATTTTGAGACGTGGCTAGTGTTTATATTTTGTATGGCTTGAATTATTATGACGTTGCTAATGTGTCATAAAATGCTGTTT CGCTTAGTCAGGCTTATGCCAGTTTGTAACGAACATAACATTGTCTTGTATCAATTTGAAAATTAGAGACCTTTACGTTTTTCACTTAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_177180;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_345589

FPKM

• PAB: 6.4
• PNAB: 8.2
• PS1: 6.6
• PS2: 6
• PS3: 10
• PW1: 10.6
• PW2: 11.8
• PW3: 13.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_345589

• Blastp: Probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD8 from Arabidopsis with 63.41% of identity
• Blastx: Probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD8 from Arabidopsis with 60.21% of identity
• Eggnog: domain, ankyrin repeat and PH domain(COG5347)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G17890)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019421354.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;