Ll_transcript_346170

Id TrinityTRINITY_DN50431_c0_g2_i2
Name TranscriptLl_transcript_346170
SequenceTTTATATAAATGGACGAGATAGTTAGTCCATGTGAATATTTCCGGCTTGAAAAGAATTATATCATGCGAGGATATAAAATAAAAAAAAATGTAGACACAA TGTGACATGGAGTAAGTGAAAGGGAAAAGTGACATTTGGGTTGTCTATTTGACATCCACGATCAGCAATACCTCTTTCCACATTTTCTATTGTCACTGCT TCCTTATCCCACTCCTCTCCCTTCTTTCACTTCCTTCACTCTCATTCATTTCCTTCTCTCTGCTCAACATAACACGTCTTTCCCTGAAACCCATCTGGAT ATCAGTTATTTTGAGTGCATAACATCTTCCTGAAGCTCAAAGTGATTCTGAATATCTAAATCCACACAGGAAGAGATCAGCATGTGTTGGTTGGGTCTTT CTGTTGATGTGTTCCGCCAAGTTATACGGTTGAACTTGTATTGTAAAGTCATTCTGTAGATCACCATTCTCATAAATTTCCAGTTTTGTTAGTTTTGGTC CCTCGTTCTAAGCTGCTACCATGGAAACTAGTCTTTGTTTGGTTATTTCTTCTGATAATTAGAAAATTGGATAAAATAGAAGTGAAGGGCGATTCTCTTG TTTTTTGTATTTCCAGTGTGAACCTATCTCATATTGCTCAGTGCTCACCAGTTTTAGCTGATCCTGATTTTATATTTAGCTCGGTGTTTTCATTGTCAAG TTCTATTAGGCATTTCTTTGGTTTGTACAATACATCAGATTGGTTGAATATTGTGGTGAAGATCAAAAGAAGTTATGGTGTACCAAGCAGCAAGTCAAAC AAGATTTCGGGCATTGAAACATTGGAGTGGCGTTAAAGGTGAACCAACAATTATTGTTAGAGTGATAGCATGCTTTCAACCCCTGCACTTTTGTCAGGTT AGTAACATGTTACTGATTGTTTGTGTTTTCCAGTTTAGGATCTTTCCCATAACTAATATCGATAATTGTGAAGCTAGTTGTTTGGTAAAAAAATTATCTC TATGTTTTTATTGTGCATAAAAATCACAATCTGACCAATGAACATTAAAGCTGCTTGTATCCGTTATGAACTAGCTTTATGAACTTTAAGTGCTGAGTGC TATCTTCTTACTTGTTGCAGGCTGAGTACTTTCGTCAGTTGCTTAAGCCTATCACGTAGATCAATTCACATTTCTTTGTCATTAAGCTGGAGTTTGTAGT TTCCTTTTTCTTTCCTTTGTTCCTAAGAGAAGCAATAAGTTACTGAATTTCTCATAGAGCACCATCACATTTACTGGTACATATTTTCAGATATGCTTTT TTCATCTTTACAGCTTAAAGGGTCTCGTATTTAGCATTGATGATCGGTTTCACTACTCTATAGGTTGTTTATTCTGTTGGATGGTTAAGAGTGATAGCTC TTGGCCTCGCCCACAGCATGTGGCTTGGCAATCATCTTATTTGAATTACTCCAGTATGCTGGCAGAACCCAGCTTACTTGGTCTTCCTGCATATGCAAAG TCTAGCGCTGGCATCTTTCCTGCGGTCGGTGCATTTCCAAGATTTGCAGTTCCTGGTATCCCGAGCCTGAAGACTGAGCTAACAAGTGAGGTGCAGCAAG GGTTCCTTCAGAGTCCCAATCCAGAACCAAGTTTGAAAGAAACCCACACCCGGGGAGCTTTGCAAAATGCAAATCATGCATCTTTGCAAAAGAAGTTACT GATTTTTGACCACTCTAGTAATATGACAAGATTAGTTTATGGTCCTGGTGTCCCTCTTGTCCAGAGTGCAATTGTTACTCCTATCAAATTTGCTCAAGGT TATGATGTAAATGAGGAGGGACAGGCTAGAAATAAGGATCAAAAGTTTCTAACCAATTATGGTTTACCAGAAGTGTCTGATAAGGATCACATAGCTCATG AAGAAAGTGAAATGCATGAAGACACAGAAGAAATAAATGCATTGCTTTATTCTGATGATGATGAATATGATGATGATAATGATAATGATGTAGACAACAA TGAGGTAATAAGTACAGGGCATTCTCCTTTGGAAACGAAAAGGACACATGTGATGGAAGAACAATTTGAAGACACTAATGAGGATATTGCTAGCTCTGAC TGGCCTAACAAAAGGCTCAAGTCAATTGATGGTGGATACAGTATATCATTACCACCCGTCCAGTGTGCTAGTTCGTTAAGACCGAACGAAACGCCTGAGT GTGTCAGTGATGCTGAATCAAAGCTTTCTAGTGGCTGTGCACATTGTGTTGAGAAAACTGATAATTCAATGGTGGACGATATACAATTGAAAAGGGATAA GATCCGTGAATCATTGAAAGTTCTTGAGAGCTTAATTCCTGGCGCAAAAGGAAAGGAACCACTATTAGTGATTGATGGAACCATTCAGTACTTAAAATCT TTGATGTCCCAAACTGGTGCTAATGGAGTGAAATATGACTTTCAGGTTGGTTGAAGAGTGCATGAATGACGAAAACATGTAGTTTTTGAAATTCTTAGCT TTGTTGGTTGATATGTTTAATTTAGCATGCTTGCTTCTTTTTCTTTATCCTCTTTCTTGAGGTGTACATATGGTTTGGAAATAAAGGCACAAATGTTGAA ATGGATAGTACTTCACTTTGCCACTTCAAAAAAATGGCACTCCGGTGGACGAGACTCCCACTTAGCAGGATCTGGGGAGGGTAGCTATACATAGCCTTAT CCCCGCAAGCAGAGATGTTGTTTTCAGGATTTGAATCTGTGACCTTATGATCATTAAGTAACAACCTTGTCGTTGTGTCAACCTCAACCTCTTGGAACTT TAGTTGGAGAAAAAATGGGCATTATGGGATTTCAATTTGTTGACCAAAATGATTATATTATAGCTTTAATTGGAGGACTAAAAGTCACAGATTGAACAGA TGAAGATGGTAGTGGTGGGATGTGCTGTAAATGGAGATACTTTTTGTTGAAGTGTTGCACTCTGTTGGTGACTGAATGCATGCGCATTAGGTAACTGGGG GTCCCACACTCCACCCTCTTTTTCATTCTTGATATTAAGCTTTTGTCCTCTCTTTCAAGGTTGCACCCATATCATACTGCCATAAAGTCTAAAGTGCCAA GAAAGTTGCTTTATGTTATGGGAGAGTGCTTGATGAGGGAGCCTAATGTTTTATCATGAGTGCATTTGAGGTAAAGGTTACTTTGTTTTACATGTTGAAG AAGGAATAATGATATGCAATTCTAGTTTCAATATTTTGCAACTTGTATTCTAGGTCTCTTTATAGTGATTGCTATTATTTTCTGGTTGAGTGATTGTATT AATAATCAAATGTGGATGTTAATGGTATAGTGAAGATTCTGTCCTGATGACATTTTGTATTGAAAATATCTGGGCACCTAATTTAACTAATTGAAACTTG TAGGAGTTTAAACAAAATTGGGGCTCAAAACAAATTGCAACAAAATAAAGAGTAATCATTGTATATCAAAATAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_177184; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_346170

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_346170

BlastpTranscription factor bHLH143 from Arabidopsis with 35.64% of identity
BlastxTranscription factor bHLH143 from Arabidopsis with 34.91% of identity
EggnogTranscription factor(ENOG4111E5S)
KeggLink to kegg annotations (AT5G09460)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019445555.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;