Ll_transcript_346644

• Id Trinity: TRINITY_DN50436_c0_g1_i11
• Name Transcript: Ll_transcript_346644
• Sequence: GTTTAGAAATATTGAATATAATTTGTTCTTCTTCTTAGAGATTATCCCTCGCACTCTCACCACCGCATATCATTTGAGAGTAGAAATTTGTAAGCCTGAG TTATAAACATTTATTTGGTTCGAAGATATTAAGAAATAGGATTGGATCCGCGTCATTGTCGATAAGGAGGGAGAAATAATAGCCTATGATAAACTTCCTC TTCTAACTTACATTCACTCTTCTTATTCTAATCTCATACATACATAAATACATAACAGATATTATTGTAGTTATAGATAGATAGATAAAGAGAAAACACA AAATGGGTACTAATGATGATGTTTCTAGTGTTGAAAAACAACTACATGATGCACTTCTCTATGTTTCTCTTAAGATGGAAAACCTTAACGATGCAAACAA ACCCATTCATACCCAACTCTTCCCTCATGTTTATGGTTCATTTCCACTTGTTTCTTCTTGGGATCCTCATAAAGCTCTTTCCATGGAAAGGGAATCTGCT TCGACGTGGGAGTTGAGTTTTGTTCTTCCACCTAATCATGAAACATTAGATTTCAAATTCCTCCTAAAGCCCAAGGACATCGATGCACCTTGTTTTGTTG AGGAGGGTCCTAGTCACCTACTTATTGACGGAGCATTGCAGGAGGATGGCAGGCTTGCTTTGTTTAGGCTTGATAATAATGCAGTTCTTGAGTATCGAGT AGTTGTTGAAGCACGCAGGGTTTCCCCCTTTGATCTCGCAGCTAGTTGGAGGGCATATGAGGAGCATTTCCATCTCCCTGCTGTGCGTGGGATACCCGAT GTGAGCATAAATTCAGGAGTTCAGACAGGTGCTGAGGTAAGCCTTCAACTTACAGTTTCCTTTATGTTTTTTTTCCGTTGGTAGATTTGGTTGCAGTGTG ATGTATGACATTAAGAATCAGGCACTCTTTAAGAAAGGTACTTCTCTTTTTCTTTGTCTCAAAATTCAGATTATCTAGTTGTCGGTTTTGAAAAACAAAA TTCTTCCTCTTGTCACTACCTTCATTTTGCTTCGATCGGTGAGATAAATTTGTCTCTTGGATGGTAACTGTAATTCCTCGTACTCCACTGCACTGTTTGT TGTTAAATTTGTTTCCTTGTTTGTAGCTGTAGAACAGAATGTTACACTGGCTGCAAGTCTTAATATAATGGATGTGGAGTTAAAACCTTTTGTGAATATG CAAGATGTGTTACACTTAATAATCTGTACTGTCCAATGTGTACGAGTTAAGTATTAAATATGACAATTTGTGTGGATAATCATATAAAGAGCTTTTGTTT ACTTTGATTTCAAATTGGCATTCAACTTTGAAAATGGCTCTAGTAAATTTTTTTATTTTTGAAAATAGTAAATAGTTCCTTTTTTGTAATTAGTGTACAG CTGGGTAAACTTGTAAAAAATGTTCAATCTTTAGACAAGTAGAAACATAGGTAACTTGCATTTGCACCATGCTGGTTTTCTCCTCCTTTATGTGTTAATT CTCTCTTTCTCTTTTAATATGCTTTGCCCTATTCCTAATCATAAGCCAAACATTATTTGTTATAGTCAATATTCTTATATGGGTAGTGCAAAATTAAAAT AGTCTTTAACTATTGTCAATGTGATAGTCTGATTAATTTCTCCTTTAGTTGTGTGGAGCACTGGTAAGGGTTTAAGAGTTTTCTTTAATGCCTAGCAACT TTAGCTGTCATACTCCATGGAGCTGTAGTTTGTTCTGTGGTATTTTTCTAACCTGATAGCCCAAAATGGTTGTTATTGTCAAGAGTAAACTGATCAATCT GGTACAACAACACAAGCCTTTTCCTATTAGGGGGGTTGGTTGCTTGCATGAATCAAACGATGTCATTGTGTTCTGTCATAAGCCAAGTCCTCGGAAAGGC CTTGTAGATCTAACTTATGTCCTTCAATAACAAAGTGATTATTATGGTAAAATACAATAAGTTTTTTGTGTGAAAGTGCTTGTACATTTCCATGTATGCA TGTGCACTCATCTATCTTTACTAGTGGCTTGCATATGATAATGCTCCCCAATCTTCTCTTATTCCAACCTATGGTTAACATGTCTCGGAAACAGTTTGTT TGCATACATTACTATGGACCTCATGCTTAACTTTTCCTTTGTTCAGTTTGTCTCTTCTGCGAGTTTGGATCTTGATCTTGAACATTATGTTGTCCCATCA CCTTCTACTTGTGTAAGTCCGGAACTTGTATATGCTGCTAACTTGACAGAGGATCCCAGGTCACTAAGTAGTGGATCTGGCAGTGGTTCGTATTCCCTCA GGGATGACACTTTTCCTATCGATCAACCTGCAGTGGTGGAGATTATAGTCTCAGATCCATCTGAGGTGTATCAAAGTCCTGGAATGGTTAAATCTAAGTC AGTGGACACAATTTCACCTTTGCGAAAGGAAGATGGTCAGAGGGGGAATTTTGTTGATCGTGGTGTTGGATCTCCTAGACTTGTAAAATGCTCTAGTTCA AATACTTTCACTACTAGCAAGAATTCAATTCCAGAAGCTGCTGGAGCTGTTGCAGCTGCTGCCATTGCTGATCAGATGCTAGGTCCCAAGGAGGACAGAC ATTTGGCGATTGTCATGGTGAGCCTGCCAGCTCGAGGTAAAACTTATACTGCAGCTAAACTGGCAAGATATCTCCGTTGGTTAGGTCATGATACCAAACA CTTCAATGTTGGTAAGTATCGTCGCCTTCGGCATGGAACTAATCAGTCTTCTGATTTCTTTCGAGCTGACAATCCTCAAGGCATGGATGCACGCAATGAG GTAGCAGTTTTGGCGTTTGAAGATATGATATCTTGGATGCAAGAAGGGGGCCAGGTTGGGATATTTGATGCCACAAACAGCAGCAAGCAGCGAAGAAAAA CACTGATGAAATTGGCTGAAGGAAGATGCAAGATTATCTTTCTGGAAACAATATGCAATGATGTCGACATAATTGAAAGGAACATACGCCTTAAAATTCA GCAAAGTCCTGACTATGCAGAAGTGCAAGATTTTGAGTCTGGATTGCGAGACTTCAAAGACCGTGTAGCCAATTATGAGAAGGTTTATGAGACGGTAGAA GAAGGATCTTACATAAAAATGATTGACATGGCCAGTGGACATGGTGGGCAAATACAAGGAGGCTGTTCTGACCGTTCACTATTTATTGCTGCACATATTT TGTGCACTCCTTGAGTTTTTTTCTAGCAATTTCAAAATATGGTCTACAGTATGACTTTAATTTCTGATTATTCACAGCTTCTATCTTTTCATTTAGGCGA ACAATATCAGTGGCTATAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_177209;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_346644

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0
• PS1: 0.1
• PS2: 0.1
• PS3: 0.2
• PW1: 0.2
• PW2: 0
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_346644

• Blastp: 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase from Arabidopsis with 64.53% of identity
• Blastx: 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase from Arabidopsis with 63.2% of identity
• Eggnog: Phosphoglycerate mutase(COG0406)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G07110)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019456567.1)
• Pfam: 6-phosphofructo-2-kinase (PF01591.17)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;