Ll_transcript_346919

Id TrinityTRINITY_DN50484_c0_g1_i10
Name TranscriptLl_transcript_346919
SequenceCAAGTAGTGAAGAAATAAAAGGACCTTATTCACCTTACACACATCATCGTGAATGAAAGGCCAACCGTCGAGTCTTACATTAATTATTAACGAAATTAGT TATCGCCGCCACCATTCAGCATCCGGTAGTTTCAATCCCCCAAATCGACACGTGTCAGTTGCATCCTCATTTCCTTGCACCTACACACTTCTTTTTTCTT CATTTTCTCCAAACTTATGGCACATCATAATATAACCATGATGATTAAAACATAGTATATACTTAATTATTCCAAACTCTCTCATTTCATATTCTATCCA CTATTTAATATTTACTGTTCATAATTATTAATTATGTAATATTTAGGTACACGTGGTATTTACTATTATATGTTATTCCTAAGTTTCAATGGTTCCTGCA AAACCCTAGCCACCTTCCTTTTGTTCATACATGAACCCCATCTGAATTTTGCTCGCAAAGCAATGCTTTTATGCCAGAGATTCCTCCAAAGTTTCAAGTT TACATGGTTCATGAGTTGTTCTGAGCACAATTGATTTTGTGGTTGTTGGTCGAAGGGGATTTGAAATTGGAAAATCGTTCAGCTGGGTGCAGGTTGGTTG AAGGGGTAGTGCCTTTTGCGTCGCAGATGGGTGAAGACAGCTTTCGTGTTGGCGGGTTTTCAGCTGGTCTGGCTGTGATCTTGAAAGATGAGGAGAGAAA GGAAAATTCACGACTTCTTTCTTGTTGTGATGATTCAAGTCACCAATCTGTGGAGCGAACCCTCGAATACGTGTTTGCCCTTCCCAATAGATCACTCAAT CCAGTGACTGGTTCAATTGACAGCAAATTTATTCGCTCTGTCATTAGGAATGATTTCTCTAAGTTTAATTCGAAATCCAGTGATTCATATGATCAAAGAG ATGGAACTTTTGTTAGAGGTGGTTGTGGAAATAATGTTGTAGGCCTGGAAAGTTCCAGTATCCGCGGTGATATTGGAATTGTGAAGCAGCGCCCATTGCT TGTAGAGAGCATGTCAAATTTCAGTAGTGTGAGGGCCAACACTTGTGTTTGGAAAGGAAAATGGATGTATGAAGTTGTGTTAGAGACATCAGGTATACAG CAGCTCGGTTGGGCTACTCTTTATTGCCCTTTCACCGATGATAGAGGTGTTGGTGATGCTGATGATTCATATGCATACGATGGGAGGAGAGTTAGCAAGT GGAACAAGGATTCCGAGAAGTATGGCCAGTCATGGTTTGTTGGTGATGTCATTGGATGTTGCATAGATTTAGATCGCGATGAAATTCTATTCTTCAGGAA TGGTAATTCACTTGGGGTGGCATTTCGGGGGATTCGAAAAATGGCTCCTCCTTTGGGATATTATCCAGCAATTTCTCTCTGCCACGGTGAAAGATGTCAA TTGAACTTTGGGGCTCGTCCCTTTAAGTATCCAATTGACGGTTATTTTCCTCTCCAGGCTCCTCCATCTAAGAGCTATTATGTCACCCAGTTGCTGCAAT GCTGGTCAAGGCTGTTGGACATGCATTCAGTGGAACGGGCTGAGTATTCTTTAGTCCAAAAGTTGAGAAGAGTGAAGAGATGCCAGGAGCCAAGAGTATA TGGTTTGGGGTCCTTTGTTGTCTTTCATGTTTGAAGTTTTTGGATTGCATGAACCCCATGATTATTCAAGCTTGGATCAAGTTGTTGATATGCTGCTACG ATTTAAGGGATCACATTTGCTGTTTGAGCACATCATAAATGCCCTTTCCTGTGGTTGTAAAGTAGCCCCATTTGTTCTAACTGAATGTCCATACTCTGGG TCATATTCCCACCTTGCATTGACATGTCACCTACTTAGACGAGAAGAACTTATGGTGCTTTGGTGGAAGTCACCATATTTTGAATTCATGTTTGAAGGTT TTCTGTCACAAAAGAATCCAAACAAAGAGGATCTGGAGTCCATGATACCAACTGTTTGGTGGCCTGGTTCATGTGAAGATGCAACTTATGAAGCTAACAT GATGTTGACAACTACAGCTCTATCTGAAACAATCAGCAAGATCGAGGAGAAGCACAGGGATCTTTGCCGCTTAGTGATACAATTTATACCACCTTCAACA TCTCCCCAGTTGCCTGGGGCAGTGTTTAGGGCATTTTTACGAAACTTTCTACTGAAGAACGGAGGAGCAGACCGAGATATCCCACCCCCTGGAGTTTCTA GTAACTCAGTTTTTGTTTCAATTTACACAGTTGTACTTCATTTTTTATCTGAAGGATTTGACTTGGGTGACATCTGTGGCTGTTCAGAGAGCTGCAAAGC AGGCTTACTTCATAGAGGTGGTCTACGAAGTTTTCCTGTAAGGTTGTTTCTGAAAAACGATTCTCTTGGAACTGATATTCCCAGGCTTGGAGGCTCCTAT GCTCGTTTATCAAAGCTACACCCTATACTTCATCATGAAATGGAAGTGATTCAATGGTATGAAGGCTGCATGGATGATGTAGAAACCAGAGTTACGCATT CAACCAGGCAGAAGCCATGCTGTTGCTCTAGTTATGACTCTGATTTTGCAGGAAACTTGAAGAATCCAGTCAAATACAGGGCCAAGGGTTCTCGCAGCCA TTGTAGCTCTATTCCAGAAAGATCTGCTCATGTAACTCCTGAATGCATTGATAGGAGTTTGGAAGATGAGATAACAAATAAACCTAGCTCCAGTGATCAA TCTGAACCTAGTTGTGGTCATCACCAGGTGCATCATATGAAGACTTTACCTAAGGATAGTGCTTTGTCTAAAGCTACACTACTAGAAGAAGAGCTACTTG ACGTCTTACTGTGGTTGTATAAATATGGTCTTGCATCAAATTTCAAGAATGCATCATACTACATGACTCATCAGGCACAGACAATCTTGTGTTTGGAGGA AACTGATAAGCAAATAAGAGAAAGATCTTGTAGCGAGAAATTGAAGCATTTGAAAGAATCTCGGAATGAATATAGAGAGCAGGTTATTGATTGTGTCAGG CGTTGTGCTTGGTATCGTGTATCTTTATTTGCACGATGGAAGCAGAGAGGAATGTTTGCCATGTGCATGTGGGTGGTCCAGATGCTTCTAATTCTGAGCA ATATGGATTCGGTGTTTATCTATGTCCCTGAATACTATTTGGAAGCTCTGGTTGATTGCTTTCATGTGTTGAGGAAAAGTGATCCACCATTTGTTCCATC CACATTTTTCATCAAGCAAGGACTTACTTCATTTGTATGTGTCATATTTCAACCTTTATTTCTCCACTTCTCTTTCATTTTGCTAAAGGTAATTCTATTG ATGCATAAACGTCTACTTGGATATCTGGTAATACATTTTGGGTAAATGGATTTTCGAGGCCATATTCATATGATATCAGCCTCTAAGAAACAATTTGATA CTTAAAGTTTTGGGTGTTAGAGTTTAGATAAGTATTTGGTGTCTTGTACTGTCTCCTAACGTAGTCATCTCCAAATATTGTTTGGTCTCGATCAATACAG GATGGGAAATACTAATTTTTATTCACTCCAGGTAATAATAGACTCATCATTTCATTGGTTTCCAATTCCGTTACTTGATAGATTTGGGAAAGTTTTAATA CAATGTTGGATGTCATTCACATCTGGTCAATGACTTACTGGGGTGATCTTATGGCTCCCTTTGGAAGGGTTAATAATGCCATGCAAAATAATATGGTAGG CGTTGGCACTAAAAATAGATACAATTAATAGAAGGTTAGAAGTGACTTTTAATTTCAATACTCGATATTGAACACACTAATGATTTATTGATTGTGCAAT ATCTTTCTCTACTGTTTATAAAGACAGCAAAGTGGCAGTTTCCGTCATTTCTCTCTGCACAAAAAGTTAAAAAATATCCTTATGCAGTTTGTTAATTGAA GTATTGAACTCATATAAGAGTATAGTGTTATAAATGCAAACATGCTTAAAACATTTTCTTATGCTTAAAACTAATAACCTGGAACTCAATTTCCTATGCA CATCCCTTGTTTTTCTCAGTTTCTTTAATCCAATCTGCATTGCATTTTAACTTGATTGCAAACATGCATGTGCAATTTTCTAGCGTTTATAGGATACAAA TTGTAGATGAACATTTTACTCCTCATGGATTAATTGGATTCTATCCTCTCTAATAACAAAGAACTAGGATTATTGTAGAGCTGACTAGTTATGCAGACTG GCGATCATGACATACTGATATCTATTGTCATGCATACAGCCAGATTGCGAATCAAACTTTCATCTATGGTATTTCTACCATGGCTTCTGAAGTATGCTTG GTTGTCCTTTTAATTAGGTCACCTTTATAGCTACTCATTTCGATGATCCAAGAATATCAAGTACGGATCTCAGGGATCTTCTTCTTCAGTCTATATCTAC CCTGGTTCAGTACAGGGAGTATTTGGTTGCTTTTGAAAGCAATGTTGCAGCCACTCGAAGGATGCCAAAAGCATTATTATCAGCATTTGATACCAGATCT TGGATCTCAGTGACAAACATACTTGTGCAATTCTGCAAGGGTTCTGGTTTTTCGAAGAATGGAGAATCATCTTCCTCATCAGTTATTTTCCAAAGGTTGC TAAAAGAAGTATGTATGAACAACGAGGGATTGTTTTCAGATTTTCTAAACCGTTTATTTAATACACTTAGCTGGACAATGACTGAGTTTTCGGTTTCCAT TCGAGAAATGCAAGAAAAATACCAGGCAGTAGAGCTTCAGCAAAGGAAGCGATGTGTTGCATTTGATCTTTCATGTAATCTTACAAGGATTCTAGAGTTC TGTACCCGTGAGATTCCTCAAGCATTCATGTCAGGACCAGACACAAACCTGCGAAGGTTAACTGAATTGATCGTCTTTATCTTAAATCAAATTACTTCAG CAGCCGATGCTCAATTTTTTGACTTATCACTTGGACGGCACGATCAATCTTCAGAGAAAGTAAACAGAGGCATGATATTGTCACCGCTTGTAGGGATGAT CTTAAATTTATTGGATGCTACTAATTTGGCTGAATGCCGAGAGAACAATTATGTTGTGGATGTTTTTGCAAGCATGGACTGTCCAAATACTGTTCATTAT GGATTCCAGTATCTTCTGGATTATAACTGGGACGGGTCTTTTAAGGGGGAGGCTTATTTGGCAAAGTATGAGCAGCTAGAGAAATTTCTGACCCTCCTTA CTTGCCGCACAATGGCGCAATATGATAAAGTGGAAGGTGTGGGAGACAAGGATATTGATGATAGCTTGTGCTGCATAT BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_177533; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_346919

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_346919

BlastpE3 ubiquitin-protein ligase RKP from Arabidopsis with 60.22% of identity
BlastxE3 ubiquitin-protein ligase RKP from Arabidopsis with 59.57% of identity
EggnogRING finger protein 123(ENOG410XQ4V)
KeggLink to kegg annotations (AT2G22010)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019462458.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;