Id Trinity | TRINITY_DN50484_c0_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_346913 |
Sequence | CAAGTAGTGAAGAAATAAAAGGACCTTATTCACCTTACACACATCATCGTGAATGAAAGGCCAACCGTCGAGTCTTACATTAATTATTAACGAAATTAGT TATCGCCGCCACCATTCAGCATCCGGTAGTTTCAATCCCCCAAATCGACACGTGTCAGTTGCATCCTCATTTCCTTGCACCTACACACTTCTTTTTTCTT CATTTTCTCCAAACTTATGGCACATCATAATATAACCATGATGATTAAAACATAGTATATACTTAATTATTCCAAACTCTCTCATTTCATATTCTATCCA CTATTTAATATTTACTGTTCATAATTATTAATTATGTAATATTTAGGTACACGTGGTATTTACTATTATATGTTATTCCTAAGTTTCAATGGTTCCTGCA AAACCCTAGCCACCTTCCTTTTGTTCATACATGAACCCCATCTGAATTTTGCTCGCAAAGCAATGCTTTTATGCCAGAGATTCCTCCAAAGTTTCAAGTT TACATGGTTCATGAGTTGTTCTGAGCACAATTGATTTTGTGGTTGTTGGTCGAAGGGGATTTGAAATTGGAAAATCGTTCAGCTGGGTGCAGGTTGGTTG AAGGGGTAGTGCCTTTTGCGTCGCAGATGGGTGAAGACAGCTTTCGTGTTGGCGGGTTTTCAGCTGGTCTGGCTGTGATCTTGAAAGATGAGGAGAGAAA GGAAAATTCACGACTTCTTTCTTGTTGTGATGATTCAAGTCACCAATCTGTGGAGCGAACCCTCGAATACGTGTTTGCCCTTCCCAATAGATCACTCAAT CCAGTGACTGGTTCAATTGACAGCAAATTTATTCGCTCTGTCATTAGGAATGATTTCTCTAAGTTTAATTCGAAATCCAGTGATTCATATGATCAAAGAG 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CAAGCATGGACTGTCCAAATACTGTTCATTATGGATTCCAGTATCTTCTGGATTATAACTGGGACGGGTCTTTTAAGGGGGAGGCTTATTTGGCAAAGTA TGAGCAGCTAGAGAAATTTCTGACCCTCCTTACTTGCCGCACAATGGCGCAATATGATAAAGTGGAAGGTGTGGGAGACAAGGATATTGATGATAGCTTG TGCTGCATAT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_177533; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_346913
Blastp | E3 ubiquitin-protein ligase RKP from Arabidopsis with 58.88% of identity |
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Blastx | E3 ubiquitin-protein ligase RKP from Arabidopsis with 58.17% of identity |
Eggnog | RING finger protein 123(ENOG410XQ4V) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G22010) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019462466.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |