| Id Trinity | TRINITY_DN50519_c0_g6_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_404892 |
| Sequence | CAAAGATCAAGTTACTCCAAGAGTAAGTTTAAAAGACTTACTCCTCATCTTATACCATCAATTTTAGAGAAATCTAATTGTTTAAATTAGTGATAAATCT ATGCAATTAGATTTTCAATAAATTGATATACAAGATGAGAAGTAAATTTTTTAAAATTACTCTTGCAGTAACTTGATCCTCTCCCTGTTAACTATATAAA TCTTTACGATGTTATTTGTAGTCGTACATGGACGGCACTTAAACGCGGTATTGTCCTGATTAAGACCATAAATATTCACTGTTGTTTAAAGGATTTTGTT TAAAAATCATAAAATAATATGATGTATTGAGTACTCTTAAAAATTTTATTCCTTAAACTCAATAATAATAGATGAGAATAAAAAGTAAATCCATTTTCAA GACTTCTCTTTTATTGTTTATAATATGTTCATTCCATTTCAGACATATATTAGCACCTATTTGAATTGTATACTCACACCAGCATATGAAATATGACACA GTTATTTATTTTAGTATCTATACCCAATCTTCTATAAAGTATTCAAATATTATTTTCCATTTTAATTTTGTTTGTAAGTAATTATACCAAAACATTTTTT TATTCAAATACAGATGATATTCTTTTGTCACTTGCATGATTCAAAATTGAAATCTAAGTTCATAATTCTACACATGCATGTAATGGGTGCAGCTGAAATG GGAGAAAGATGCAGGATCAATAATCATCAATGGCATTAATTTCTTTCTACGTCAATGCCACTGGCATTCACCTTCCGAGCACACCATTAATGGCAGAAGG TATATCTTGTTCCATAATTATTTTTTCTTGTCTTATTTATGGATAGAGTGAGTCAAATTTGTTTATAAATTAATACCAGCAAAATAAAAGTTATATAGAT ATAAATTAAGTTTTTAAAATATAATATACAAATTTTATTATTAATAATATGGTAGGTACAATTTCAGAGGGACAATATGTGATGAAGAATAAATTCTTAG TATGAGAAAAACAAGGCAAGACAAAAATATACTTAGTAACTAGTAATTTCTTCTAAAATATGAAGTATATATTTTTTGTATTACACGTAAGTCTTTCGGG GTTCTGGCTTGCTCTCCCAACTGCTCTGAGGAATCGAACTCTCGATCTTGGGTATCTAATTAGGCTTTACACTATTAGACCAACACCTTGTTTGGTAAAG AGGAAGTACATTTGAGAACTTTTATACTATAGATTAATGAAAAGGATGAAACTTCAGGTATGACCTTGAGCTACACATGGTTCATGAAAGCAAGGGAAAC CTGAAGAACAGGATCGCTGTTATTGGACTTTTGTTTAAGATTGGTCGGCCCGATCCTATACTCTCCAAGGTAATCTTTTACTCCTTTTGTAGTTCTAACT TCTAACCAATATTATTAAGCCCCTCCAAATCAAACTCAATTTCATATAAATTTTGATCACTCAGTCGTACCAGAATGTATATTATCTACTTCTATGAATA TGTGTAATTATTTATAGTTAATAATCATCTATATTTATATTGGAGTAATGTTCTATTTACTGAAATGGACTAGAACATTTGATTAGTGTTTCTACATTTT TTAAATTTAAAATGAATCATCCGATTAGTTTTTCAAATATTATTTCAGGTTAATATAGTTTAATCCAATTGAACTAAAACTTTTATTGTCCAAAATGGTT TAATCAATCATTTGGTTAAGAGTATGAACCATAATCATCTATAAATCTGGTCAACGATCAAACTATCTGGTCTTATTGGATCGTGATAAATTACTGAATG ATAAAATAATTAGGCATATAATTAATTACTGAAGGATGAGTTTAACGAGAATATTTATTGATGTTAATATTTATGTACATTGCAACCATATCAGTTTTCA AAATACATAAAATCCATGGTGGATGAAAAAGCAGAAAAGAACACAGGTATAATTGATCCCTCAGAAATAAAGCTGGGTGGCAAGAAGTACTACAGATACA TGGGCTCCCTCACTGTCCCTCCGTGCACTGAAGGTGTAATTTGGTCCATAAACAAAAAGGTACAAGTCAATAATATGCAATTCACATTTATAACAAAGAA AAATATATTTGGAAAAAGAAAGTAGGATATTTCTAAAAGTATCTTCCAATTTTTTTCTTTGCCATGTGATTATCTTGATGAATAGTTTACCCGAAACTTT AAACTTCCTTCATAATGGTCAGATAAGGAGTGTATCAAGGAAGCAAGTCAAATTATTAAGAGAGGCAGTCCACGATGTAAGTATTTAGTTTGATAAAAAA ATATAAAGATTTATATACAGTCAATATATTATTCATTATTTATTTATATTTTTTATTAAAAAATGATTGATGATTAAATATAAATGATAGAATATGTAAT ATAAAATTTATATACTATTAACCCGTATAATTTTTTCTCTTATATAAAACTGAAATTTTAGTTGTTAGCATTAGTGGGATACTTTCCCACTTAGTGATCA TCAAAATTGCATTTATCAACTATGGGAGAATTATTTGTGCATGTTTGTGTGTCTTCATGTGTAAGATAAGACTGTAATAATGATGATGAAATTAAGGTCA AAAAGTGGGAGACACATCCTCTTTCATATAGTCTATCCCTAATTTTTGTCTCTGACAAATCAACTTTGAAC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_177790; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_404892
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Alpha carbonic anhydrase 7 from Arabidopsis with 63.83% of identity |
| Eggnog | Carbonic anhydrase(COG3338) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G08080) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019443083.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |