Ll_transcript_403664

Id TrinityTRINITY_DN50554_c0_g1_i10
Name TranscriptLl_transcript_403664
SequenceGCTTATAAAATAAGTAAATGATTCTTTAATTCTTTTATCATATATATGTAAATGATTAATAAATTAATGATTAATAAATTATCTACATATAAAATATTTC ATATGTCAAATTACATGCTCATATTAATAAGTAAAAATAAGAAGAGTTTATAAAAATAGGTATGCATTATCTTTAATCGGGTCTAAGGTTGGGTTCCGGT TCAAAAACTGGCCCAACCGACATGTGGGGTCGTGTTAGCCTTTTAGTTCAAGAAAAAAACAATTTGACTGATATTTATGATCGGGTAAGGGACAAGCCTC ACTCGGTCCAATCTCACTGAGCTCACCCCCACTCAAGGGGGTCTTTATAAATGATAATCAATCCTTGCTTTTCTACATGTCTATTTAGTTCCTTCATAAT CATACTTTGCAAAGTATGACGCATGCTAGTCGGTAGTCTTATCCCTACCAAGGTGAACTCTGAATATATGCAATTAACTTGAGAGTTAAAAACTACAAAC AAAAAAAACACATCAATATATAACTATCTCATAGAGGACTTGTTTAGTGGTAATTTAGTAAAAGAAAAATGATGGACATCAAAGAATATTAAAGATTTTT ATATATTAATGTAGAGTTTATATATTCACTATATATATATATAAATCAATTAAAGTTGAACAAATAATCATAGGTAGATTCTCTCGAGGAGTGTGCAATG TTGTGCTGGTTCAAATCTTAAAACTCTAGGGTTAGTCTAACATACCAGAAAATGTTTGCCTAATAAATATATTCAAAGAGGAGTTTAATGTAAGAGAAAA AATATATATTCTTATGGTAAATAAATTTTATGCATTGTTACTGCATCATCTACCATTTAGGTTTAATTATCATTTACTTTTAAAAAAAATAATATAAATG AATGGTAAATAATATATCGAGTGTAAATAAGTTTTTACACTGACAGTATATATATATTTCATTTCTTAATATAAATGTTGTGTAAAGTATTGAGTACTTT TATTTAAAAATCCATTCTGAAATCTGAATCAATGAATAGTGATTGATAACATACGTTAACATAAAAAACTTTGCCCACTCTATTTTCTAATTGCGAATGA GGGTCTTATACTATATTTAGCGTGGATGTGGTCCTATTTGTATAGAATAATAATGTTTGGACCAAGTAGGATTGAATGTGTTTTATTTGGGTTGCTTAGC CCACTAATGAGGCTTTCTATTAAGTGTCACGGTGAAGACTTGCGTGTTACAGGGGGAGCGAAACCAGATGGTTGTGTGGTCATACCCGCCAACAGCAAGG CAACTGGCGGCCACCGTTACCGTGTTTGTGATTGGAGCTTCGCTCATCAGCGTAGGAGCTTATCTCTCGTACGCTAATATTGCTCCTCAGCAGGCTCGTG CAAAATCTCGCAGTGAAGCAATTAAAAAGCAACTCAGAAAGTTCCTCGATGATTGATGATGGTAATTTATGTAATTTCTGGGCTTACGTGCAATGGAAAC GTTTCAGCTGTGTTATCTTTTTATTTTAGCCACTCATAGTTTTGGATTTGCTGATTTATACTCAACTAGTATTGAAGCTCTTACCACTATTAATTTTCAA TTTGTATCCTATTATTAGTTAAATCATATTATATTCCATTTTAGAGGTTTATATTAAGTTTCAATTATGTGTTGTTTTTTGTTTTTAATTTTGGATTGGG ATATGATAGCAAATAATATTATTAGGGTGACATAGGATAGTGTTGAACTGTTGTTTTTGACTTGACCGCTTAATTAAGTGTTGAAGTTTTATTTTGGAGA AAATTGAGGATGTGAGTTTGTTGATAATGATGAAGGAATAAAAGACTTTCCATTTATCATTGTATTTTATTGATTTAGTTTGGTGTAATGTGGTTCTTTA GTCTTTGGCTGGTTTAAAATTTTACTTGATTGGAAGCCTTGTTGAACAAGTGTGATGGTCAAGGTTTGATTTGTTTGTTTGTACGTAGTGTTGGTGTTAT AACCTGTTTTTAGTTGTGATTTATTTTATAGCTTACTCAATTTATTCTATAATATTGTGCTGCATTGCACATTAGCAGTATCCTAATACAATCACAGTTG GCATATTCAAGTGACAAAGGTCCCTAGCATTATTTGTATATAGAGAGAATTTGCTAACTTTGGTGAAGTAGAATTTTAGAAGTAGGTTATCACAGTACAC CAAAACTTTTACACAAAAATAACCTTCCTACTCTAGTTGCAATAGGTTATAGTAACAAGGGTATTTTCATAATTTGCATTTACAAACAAAAAAATTTACC TCCTCTAACCCTCTTTCCCCTCCCCTCGTCACTGGACAACTGTAAAAAAGGATCTTGAGGTACTTGCAAGGGTCTATCACTCTTGGACTGCTTCTCAAAC CAGCTAATCCTAACTCATCTCTGCTTATCACAGCTTTTTGTGATGTTGACTGGGCCTCTAACCCAGATGACAGGAAATCTATCTCAGGGGCTTGTCTCAT TGTAGGCCCAAATATTGTTACTTGGTGGTCTAAAAAGCAGCAAACTGTTTCAAGATCAAGTACTGAGGAAGAGTACAGAAGCTTAGCACTAGCTGCTCAG GAACTTATTTGGATTGAATCTCTTTTATCTGAATTAAAGTTTCCTCATCAGTCACCTCTTATTCTGTGTGACAATCTCAGTACTGTGGCCATGCCACACA ATCCTGTCCTTCATCACAGAACAAAACACATTGAATTGGACCTATTCTTTGTAAGAGATAGAGTCCAATCCAAATTTTTGCAAGTCAAACATGTACCATC TGAAATGCAGACAGGAGATGCACTGACTAAACCTCTCTCTAACACAAGGTTTATGGCTATAAGGAAGCTACTTCAAGTGGTTGAAAGGTTTTCAACTCAC CCACAGCTTCAGGGGGAATATAAAGATATATTGTTATGTTATTCTTTTGTTTAGCTTCTTGTAATAAAACTAATCCTAGTTGATCAGTTTGTTCTTTTTA GTTGCTTAATTAGCTAGTACAGTTAATGGCAGTTAGTGACAGTTACATTTAGTTTAATTCAGTTTGCTATAAATAGAAGCTAGGTATTCCCCTGTAATTG TAATCTGAAAAACTGAATCAATTCAATAACAGAGATCAGTTTTCTCTTTCCTTCTCCATCATTTTCTTTTCTTTACAAACCCTAGTCCATGAACTTTGGA TAGATCTTTCTTTTTATCTCCGACATCTATCTTGAACTTCTAAGAGCGACTGTTTTTTGTTTGAATTGGTGAAACAAACAGTGTTGTCTTTCAGTTGAGT TTTGGTTTTCTGTTCTCAGAAAGCACGCCCAAGAATGTCCATGGTCCTTTTAGGAGCTAGACATTGGTGACTTTTGGCAGTTTTATTTCTTTTCTTGAGC TGCACTTTGCTGACTCTATTTTTGGTTTCACTTGAACTTCGCAATAAAAACATTCTTACCCTTCTCATTCTTCTGAGCCTTTTTTTTCCATCAGTGCGTC GCTTCTTTGGGAAGACCTAAACTGGCAATGAGATTTTCAAGGCCATCTCCTGTGACTCGTCTAATGTTATTTGCTATATTTAGTTTGGTAGCAGATTCTT GTTGTGCTGACAGTTTTGTTCATGGATCTTATGCTGCATTTTTCTTTGACTTTACTTTTCGTTCAGGATATGCTTAACTTAATCAGTCATGTTAGGTATC AAGGCCATACAAAATAGCTGAATTCGAGATTATATTTGGGGAGGGCGTCAGTAAACTGGGTTGCATTTTAGATTGTGCAGAAATGATGGATGTTGTCTTA AAGAAAGGCTCTTGGTATAGCTATGGGGACCATCGGTTGGGGCAGGGAAGAGAAAAAGCAATACAGTATCTGAAGGAGAACACGCATCTTTTAGAAGAAA TTGAAAAGGTAGTTCGATCATCCTTGTTAGATGGAACCAACCAAACAAGCCATGCATACACGAAGAATAGTCCAGTACTCTATCAAGATGATGATATTTT TAAGGAAAGTCAATGATAACCAAGCAAATTCTTGTCATGTCTGACTAGCTTGGGAGAAACACTGTGAGCAGATAAAGCTGGAAAAATGCTTTCTTCACGA CAAATGAAGATGGGGTTGGCTTTGATCATTAGACCATTTTTTTTGGTTCATCCTGTTCCATTGGTAAATGTTAATGAGAAGCATGAAAAATACAGAAAAG GGTTCAATGTGTGTCAATCAAGGCATCTTGATTTCTATATTTGGTTCCTATTTACTGCCATAATTGTTTCTTATTGCATGCATTTTCTGTTAGTTTTTCC CCTTCTTTTGATCTTGTTAGTTGGGTGAGCCTACAATTGTTGAAGCTAGACCCAACACAGCTACAAAAACTGTCGTTCAGATACTCCCAGAGTTCCAGTA ATCGGTTG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_178080; 
Additional information-

Expression of Ll_transcript_403664

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_403664

Blastp-
BlastxDNA repair protein recA homolog 1, chloroplastic from Arabidopsis with 76.25% of identity
EggnogCan catalyze the hydrolysis of ATP in the presence of single-stranded DNA, the ATP-dependent uptake of single-stranded DNA by duplex DNA, and the ATP-dependent hybridization of homologous single-stranded DNAs. It interacts with LexA causing its activation and leading to its autocatalytic cleavage (By similarity)(COG0468)
KeggLink to kegg annotations (AT1G79050)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019442250.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;