Ll_transcript_402611

• Id Trinity: TRINITY_DN50561_c1_g1_i12
• Name Transcript: Ll_transcript_402611
• Sequence: ATCTGATTATAAGCTCTTTATATATCTTAAATGGCAGGGCAATAGAGCAATAGCAGAAATCCAGTTTGCGGATTACATTTATCCGGCTTTTGATCAGGCA TGTTCCCTTAACATGGCTAGAAATTATTCAAAGCTTCGGTTGATAGGTAATTTCCCATTTCTTGTTTTCAGATTGTCAATGAAGCTGCAAAATTCAGATA CCGGAGCGGGAACCAATTTAATTGTGGTGGTTTAACAATCAGAGCCCCTTATGGAGCTGTTGGCCATGGTGGGCATTACCACTCGCAATCGCCCGAGGCT TTCTTCTGCCATGTTCCCGGTATTAAAGTATGAATCGTTCATTTGGACTTCATAACCTTATTTTTATAGCTGCAATTTTTCTGCACTCGAAGGAGTTACT TTGCAATGAATACTTGGATTACTTGGTGTATATGGAATATTATGTTTGAAATTTACTCTAATTTTGGCGTCGTTCGATCCATGTAGCCGATCATACCTAG CAGGATAAAGGTTTGGTTGTTGTTGTTTGTTTTTTCGGTTTGCTGGGGTAATCAATTGTATGTGCTTGCAAAATTGTTCAAAATAGTGAAAAGATTGATC CTATTAACATAAGTTATATGAAGGTGGGATAGTAGAGACAGAAAATCGTCGCGAAGTAGTGGAGTAAATTCTTACATTGGTTTGTAATTTAGTACGGCGT CTTGAAAGATAGCAGTGCTATGGTTGATAAAATACAGGCTGAAGACATCTGCATTTAAATGCAAACAACCTTAATCTGGTCGCGGTTGACAACAATGAAG TTTGGTTTAAAGTTTTACCTTCCCAAACCCCGAAATCCCGAACCGCTTGAGGTTGGAAAACTGAACCACATCCCTGATCCCACCGGTTTTCAGTTTTCCC GACCCAATCCCGCTTCATCTCCGACCCCGACACACATATAAGGGTAGTTTCGTAAAACCCTTATATATAAAAAGTCTCCACTTTACTATAATATGTATAT GTGTGTGTAATTAAGGGTTCTGGACGAGTATCACCAAATTAGAACCCGAACCTGTCGGGGATGAAAAAACAAACCCGAACCCGAACCCAGTCAAATCCAG TTTTCCCTGGCAAACTTGGTATAGTTCGGAGGGGTACCCAAAAATTTGAGTTATGTTGCCATCCCTAATAGAATTAGGATTGTGGATAATTAAATGAAGG AAACCGGGTAACTGAACGCCTCTCGATGGTAAGTCCGGAGAAGCATGTGGCTTAGATTGCGATAGGTGGTGTTTAAGGACTGAAATTTGCTTTATAGGGT GCTTTGGACATTTATTGAAAAAATTAGTTTCTGATATAAGAACTTTCAGTTACATTCTGTCAAATTCATATGAGGTACATGGTTGACACATTTTCCTTAA ATCTCTTACAATCGTTTCTCTTATAGGTAGTTATTCCTCGAAGTCCGCGGCAAGCGAAAGGGTTATTACTATCTTGCATAAGAGATCCAAATCCTGTTGT ATTTTTTGAACCAAAGGTTGCATTCTACCCGAATAATCTTACTGAATTGTGTGCACATATTTATGGTATGTGAGAATTTTGAAATTTTAATCATGTGAGT CTTGGTTTCAGTGGCTTTACCGTTTGGCCGTTGAAGAAGTACCCGAGGATGAATATATGTTACCTTTATCCGAGGCCGAGGTATATAAGTCACACTAAAT GCTAGAAGGGAAAGAAGTTCTAAGCAATATTATATATACTTATGAACTCGATACGATGAAACAGTTACCCTGGCTGAATATTGAAATATGTGCACAGGTG GTTCGGCAGGGTTCGGATATTACGCTGGTTGGGTGGGGAGCTCAATTAGCAATAATGGAACAAGCTTGTCTTGATGCTGAGAAAGTAAGACTCTTCTTTT TACACTGAGAACATGGATGCTGCATTATTCACCCAATGTCTGATTTGATAGTGTAACTACATACTTATTTTATTTGGTTTCCCGCGAATTCCCACCGGAG GGTAGAACTAATCCCTCGAGCATAGCCAGGCTTGTCCTTCCCACTAGTACTTTCTCCCGGTATTGAACCATGGTTCTCTCATGCGGCCGTAGTGCGCCTC TACCACGTGTAACTACATGCTCACACCTCTCTTATTTTTCTAATCAATTCATACACTATTACACCACTTAATGAATTAATCATAATTCTGATATATACTT CAGAACAGAGTCCTAATATATCTGTCATAGTATATACTTATCTATGTTGGAATTGTAATGTTAATGTGAGATTCTGCAGGAGGGAATTTCTTGTGAACTG ATAGATCTGAAGACACTAATACCTTGGGATAAAGAAACAGTGGAAGCCTCAGTTAAGAAAACTGGAAGATTGCTTATTAGTCATGAAGCTCCTGTAACTG GAGGTTTTGGTGCCGAAATCTCAGCTTCCATTGTCGAACGCTGCTTCTCAAGGGTATGCTCCAACCTTTATGTATATAACTTGGCATGTTGTCCATGACT TTCGATGCTACTCTGTCCACACTATAAAGGGCGGGCCGGTGTAAGAGGCTCCTACTTAGTGGAGTCTGGGCAGGGTAGGTATATGCAGCCTTACCTTCGC AATCAGAAAGACTGTTTTCAGGATTTGAACCCGAGACTTCATGGTCACCAAGCAATAACCTACTATTGCACCAAGCTCAAACTACGATCCCCTAAAATTA AACAAGCACATGTAACATTGATTTATGTCATAGGAGTTTCTAGCACAATATTGCATTTGTGAAGATAGGTAAATAAAAGAGGATATGGAAATAGAAAAGG GTAGGGCTTTGGGGCAAGACATTTTTGAAAGATGGAGTCAAGAACATAAGAGCATACAAGAACAAGCTTAGCCTAGTGATACTCTCACAAACATATTTTA CTCTCATTGAGTCGCTACCAATAAGCTGGTAGTGACTCAATGAAATCAATGACTATAAGTTCCTAAGGTCATGAGTTCGAGTCACAGAGACTCCTTATTG GAGGAATAAGATATTGCATGGAGTATTTAAGCTTAAGGGTGGTACAGAAATGGACCGAGAGGGGTCGCATGTCAAGGCTGCAGTGTTACAGAAATGGTTA TACATTTACCTTCTAGAATTGAATTCAACTTGGACATGTCTCTCAAACATGTCTTTCTCTTTTGTTTGTGGTGCAGTTAGAAGCACCTGTTGCAAGAGTT TGTGGTCTAGACACTCCTTTTCCACTGGTTTTTGAACCCTTCTACATGCCAAACAAGAACAAGATATTGGATGCAATCAAATCAACTATAGATTATTGAT GAGCTTCATCATAACTTTTTGGCCTTTTACATGATCTTGAAATCAACATCATAATGATCATGTTATGGGCTAGAGAATCATTAGTTTGATTCAGACCATG AAGTTAGGAAAGAAACATAAATTCATTGTGCAATTTTCTCCAAATGTAAAAAATTAAACATCACAACATAATGGCCATGTAGTATATGTTTCTTTTACAA CACCCTTTGTGCTAAGAAATGTGAAATATTTGAGGAAATGAACTCCTCTCCAGTATTGGGACACGAGGATAAGATGTTTTTATACGTTATAATTGAATCC AGTACTGAACTCTCCAGGACTAAACAGGAGCTCAATCTATATTTGAGGGGAATGGTAATAAATGGATCCTTTCGGTTCCTTAAACCCCAAGTCAAAGACT TCCACAAAACTGTATCCATTTTCATGAACATTTCATGTAATATCTCCTACCTATAAGATCAACTGGAAATCCATAGATGTCAAGTTTTGGTCCCATGCCA TGAACTTCTTTTGGTTGTCTCTGTCAGTGTTGAACATATATTGTATTATAGTTTTAAACACTCTTAATCGTATTCTATTAGCGACAACAACCAAACCTTA TTCTTAATATGTGAGGTCAGCTCCTAATCATATTCTGTAACATTTTATATTTCTTTTATCGAATCCTCATAATAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_178140;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_402611

FPKM

• PAB: 1.7
• PNAB: 0.4
• PS1: 0.6
• PS2: 0.7
• PS3: 1.1
• PW1: 0.8
• PW2: 1.2
• PW3: 1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_402611

• Blastp: -
• Blastx: 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta 1, mitochondrial from Arabidopsis with 98.21% of identity
• Eggnog: Dehydrogenase, E1 component(COG0022)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G55510)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019448466.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;