| Id Trinity | TRINITY_DN50643_c1_g1_i9 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_449767 |
| Sequence | AACAACAACAACAAAAACAACATAATCTCTCACTCAATTAAAAACTTTGAACAAAATTCTCTTCCATGATTCTGATTCTATGATCACGTTCTTAGCTTCA AATCCATAACAATCAATCTCATTTTTTCTGCAATGGTGGTCTGCAAATGTCGCAAGGCTACTAAGTTGTATTGCTTCGTGCACAAAGTTCCTGTCTGTGG AGAATGTATCTGCTTCCCAGATCACCAAATCTGCGTGATCCGTACATACTCAGAATGGGTTATAGATGGCGAGTATGATTGGCCCCCTAATTGCTGCAAA TGCCAAGTTGTTTTGGAAGAGGGGACTGGATCTCAAACTACCCGACTGGGTTGCTTGCATGTAATCCACACAAATTGCTTGGTCTCGCATATCAAGAGTT TTCCTCCACATACTGCTCCAGCAGGATACGTGTGTCCTTCATGTTCAACTCCGATATGGCCTCCCAAAAGTGTGAAAGATTCAGGTTCTCGTCTTCATTC CAAGTTGAAGGAAGCTATCATGCAGGTTATTTATGAAATGGGTACTTAAGTACTTTAGTTTGTTGGATCACTTTATTATTTTATGTGATAATAATTCAGA AAGATATCTTCACACACAGATGTACTAGGGCAGCCACATATTAAATGGGATTTTATGTTGCAATTGTTGTTTTGGAATATAGATTAGAAAATAGCTTCTA CTTTGAGAGTTTTATGGTAGAACCAGTGACAGAGCCACAAAATTTAACAATGAGGTCAACGCATATTAATAATTTAATACCCATTAGAGATATTTTGGCT AAATTATAAGAAACTCTTTCATTTTGCTTGCAACTATTTATACTTCAATCCTAGTTTCTCGTTAACGCCCTTCTCATTTTTGTCCAGCTACTTCGCGGTG AAGGGATGATATTAAGGCTGATATACCATCTGGAATACTCATTTGAGGCATCATGCCTGATTTTTATTAAATGGAGAATGCCCAGTATTTGTGCTACAGC ACTAATTTACGAGTATAGTGGTAAATGGTAATTTGTGTGATTATTTCTGCTGAAAAATTGGGGTAGCCCCTATTGTAGAAAATATGGTAAAAACCTTAGG TGGTTTTGGCATTTGTGGTGAAGACTTGTAGAAGCCCTAATAAAGAGAGTAATTTGTGTGGAGGGTAGCTAGTTGCTAGAGGCAGGAGACTATTAACAAG GATTTAGATGTTAATGGTTTGTTCACATACAAGATTTACAACATAGACACTGTGAAGTTGTTTGATCGATGTAGTTGATCCCACCTTGTGGGAAAATGCA TGATTATTGTTATTGTTGTGAGTCTGCTCAAAAGCTACCTTTGTTTTGGTTTAATTAGTTATACAAAAAGCATGTTTGCATTTTTCTTGGGTGATACTTT TATGAGTGTAATATATCTATACACTGTTAGTCTAAAGATTTATACACAGTCAGTACAGGATTCGCCATTAATTTGTATTACTTATATTTAAGAGTCAACG ATAATAAATATGGATGGTGGATGATGCAACAACAGTGTAAAAGAATTGTACACTGTCAACGTGTACATTATTTTCTCTACTTTTATTTGCACCTGGAGTT ATTTTCGTCATCTGTTTTCTTCTCATTATGTTAATGAAGTTGTCATTAGTTTTTATTTGTTTTTGTGCAGACTGGTATGGAAAAGAATATCTTTGGAAAT CATCCAGTTTCATTGTCAGTGACAGAATCCCATGGTCCTCCACCTGCTTTTGCTTCCGATCCATTGGTTGGTAAGGAAAATCATGGAAACTCAGACTTAG TAGATGGGTACTCACCTGCAACTGGATCAGAACCTTCTAAACTTTCAATGACAGATATTGTGGAGGTTGATGGTCCTAATTCAGCAGGAAATTTCATACG AGGCTCAAGTCCTGTTGGTCCTGGTGCTACCACAAGGAAGGGTCCAGTCTATGTTGAACGACAGAATTCTGAAATACCATATTATGTTGATGATGAAGAT GTGAATCGTAAAAAGTATGCAAAGAGAGGTGATATAGTCCTGTCAAATGAATTTTTAATATTTTAAAAGCCTAACTATGTTTAATCTCTATGGAGTATGG TTGGTTTGTTTAGTCCCTTGAAAAAATTGGTCCTGAGTCCCCACAACCTAGTTTATTTTGATTTGTGTCAGTGCCATTAGCCAAAATTCGTTAACTGGTG ATGTTGCACTACACCAAGATGACACATGCTACCACACCAAGATGACATGTCAGCACTCAATGAATTTTAGCTAATAGCCAGGGATGGAAATAAAAAATAA ACTATTGGCTGCAGCTGCAGGGACTTCACCTTTTTTTTTCAGGGACTGAAAACAAAACGCCCCCTACTTTACACATATTTAAGCCTATTTTAAAATTTGT GACGTGGTTGTATTTTTTATAAGATAGAAGCTATTAGAAAACACTGACCTTCTGAATTGACATGTAGACTTGAGGCTTCCATTGATCTTCCATGCTGAAG TTGTCTAATTCAATTTATTAATTCAAACTCGCATCTTTGAAAGTGCAGGTCCATTCCGTCATAAGCTTGTTAGAGCATTTCTTCCATTCTGGTCTACTGC TTTACCTACTCTACAAGTGACTGCATCTCCAAAAAGACACGACAAAATGCAGCTGAAACCTGGGAAGGCCGTATGCAGCATCAAAGATCATCAAGGAAGG ACCCTAGAAAAATTCTTCTCCTGATTGCAATTATGGCATGCAGGGCAACTATGGGCATATTGCATTACAGACTAGCACAATGAGGTCCAGGGGAAGAGAT TCTTAATGATGAACAAATTCGACATGGAGTGCCCAGAAAGCTCAGAGACAGTCGTCGGCTCCTATTTTCGATGCTGCTGGTTATGGATGCTTCTGCCTCC TTTCTGGCTGGCTTCCTTATTTGGACCAGTCTCTGATTTTTTTTTGGTAAACATGCAAGTAGGTGGCTGATAATTTTCACCTGGATACCCATAACAGTGA TGGGTTACATAAATCCTTATCAGCCATCTTCGCCCTCAGCTTTGGTGTCCATTTGGAATGTAATTGCAGA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_178809; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_449767
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Zinc finger protein-like 1 homolog from Caenorhabditis with 43.61% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019451406.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |