Id Trinity | TRINITY_DN50666_c5_g1_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_448964 |
Sequence | ATTAGATTCTATATTCTCTAATATAAATATTTCTAAAATTTGATAAATAAAAATAGTATAATTATCTATATATATATTCTAAATATTTATTTATAAAAAT ATTAGAATTATATATATATAAATAGTTATAAATATAAAAAATTATATATTTTTGTATATAGTATTCTTTGTATAAGAAAAAGAATGAGATTGGTCCTAAT CAATTTACACTCCTTAGGATTGAATTCAATGCAGAGATCAATTTAGTATATAAAACTTTTTCCTGGTCATATCAATAAGGTCATGAACTTTTGATTTATT TTTTTTTTTTAGATATAATGGATTTGCCTGAACCGCTACATGATTTTCTTTTAGTCTTTCTGGGATCCGGTCTTGTATTAGGAAGTCTAGGAGTCGTATT ACTTAACAACCCTATTTTTTCTGCTTTTTCGTTGGGGATGGTTCTTGTTTGTATATCTTTATTCTATATTTTATCAAACTCCCATTTTGTAGCTGCAGCA CAGCTACTTATTTACGTGGGAGCTATAAACATTTTAATCATATTTGCTGTGATGTTCATGAATAGTTCAGAATATTACCAAGACTTTCCTCTTTGGACGG TTGGAAATGGAATTACTTTGATGGTTTGTACAAGTATTTTTGTTTCACTAATAACTACTATTCTAGATACATCATGGTACGGTATTATTTGGACTACAAG ACCAAATCAGATTATAGAGCAAGATTTGATAAGTACTAGTCAACAAATTGGAATTCATTTATCAACAGATTTTTTTCTTCCATTTGAACTCATTTCAATA ATTCTTTTATCTTCTTTGATAGGTGCAATTGTTGTGGCTCGTCAGTAAGAAATCTTTAGAATTAGCAATATAAATCAAAATTAAATTTTGTTCGATTTTA 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Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_178961; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_448964
Blastp | NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic from Morus with 98.02% of identity |
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Blastx | NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic from Soja with 88.73% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0001954) |
Mirbase | osa-MIR5079b (MI0026007) |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (YP_008963654.1) |
Pfam | NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L (PF00420.23) |
Rfam | tRNA (RF00005) |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |