Ll_transcript_448967

Id TrinityTRINITY_DN50666_c5_g1_i3
Name TranscriptLl_transcript_448967
SequenceATTAGATTCTATATTCTCTAATATAAATATTTCTAAAATTTGATAAATAAAAATAGTATAATTATCTATATATATATTCTAAATATTTATTTATAAAAAT ATTAGAATTATATATATATAAATAGTTATAAATATAAAAAATTATATATTTTTGTATATAGTATTCTTTGTATAAGAAAAAGAATGAGATTGGTCCTAAT CAATTTACACTCCTTAGGATTGAATTCAATGCAGAGATCAATTTAGTATATAAAACTTTTTCCTGGTCATATCAATAAGGTCATGAACTTTTGATTTATT TTTTTTTTTTAGATATAATGGATTTGCCTGAACCGCTACATGATTTTCTTTTAGTCTTTCTGGGATCCGGTCTTGTATTAGGAAGTCTAGGAGTCGTATT ACTTAACAACCCTATTTTTTCTGCTTTTTCGTTGGGGATGGTTCTTGTTTGTATATCTTTATTCTATATTTTATCAAACTCCCATTTTGTAGCTGCAGCA CAGCTACTTATTTACGTGGGAGCTATAAACATTTTAATCATATTTGCTGTGATGTTCATGAATAGTTCAGAATATTACCAAGACTTTCCTCTTTGGACGG TTGGAAATGGAATTACTTTGATGGTTTGTACAAGTATTTTTGTTTCACTAATAACTACTATTCTAGATACATCATGGTACGGTATTATTTGGACTACAAG ACCAAATCAGATTATAGAGCAAGATTTGATAAGTACTAGTCAACAAATTGGAATTCATTTATCAACAGATTTTTTTCTTCCATTTGAACTCATTTCAATA ATTCTTTTATCTTCTTTGATAGGTGCAATTGTTGTGGCTCGTCAGTAAGAAATCTTTAGAATTAGCAATATAAATCAAAATTAAATTTTGTTCGATTTTA TCACATTTATTTATTTATTTATTATTTGAGTTTAATTCTATGTGAACGTGAAAAAGTGTTTATTATAAATTTATTTAGTTTTTCCAAAATATATTCTTTT GTTCCCGACTTGTTATTGTTATATTCTTTAGTTAATCAAATCCCTTGAATTGTTGTTCATATTGAAATGAATCGAAATTGATAAGGAGTTGGTCAATGAT GCTCGAACATGTACTTGTTTTGAGTGCCTATTTATTTTCTATCGGTATCTATGGATTGATCACGAGCCGAAATATGGTTAGAGCACTTATGTGTCTTGAA CTTATACTGAATGCAGTTAATATAAATTTTGTAACCTTTTCTGATTTTTTTGATAGTCGCCAATTAAAAGGAAATATTTTTTCAATTTTTGTTATAGCTA TTGCAGCCGCTGAAGCAGCTATCGGATTGGCTATTGTTTCCTCAATTTCTCGTAACAGAAAATCAACTCGTATCAATCAATCGAATTTGTTGAATAAATA ATATTTATAATCATAATTAATTCGAAAAAGTTGAATTTAGATATAAGAGTGTAATATTCATCAATTCAAATTAGCATGTTTCTGAAACGTAAGAAATCAA AGTATCTTGGCCTTCTTTCTTTTTATCAATTGATACAGAAGTTTCGATTTTTATTATCAAGATTCTGATCCATTTTTGATTCATCTGGAATCTAAATATA AAATTTATTTACGAGTTTACTAGATTGAAAATTTTAAATTTTTGATGTTCAAAAATTAATATAGATCCGATGTCACATTCAGTCAAAATTTATGATACGT GTATAGGATGTACTCAATGTGTGCGAGCTTGTCCCACAGATGTATTAGAAATGATCCCTTGGGACGGATGTAAAGCTAAGCAAATTGCTTCTGCCCCAAG AACAGAGGACTGTGTTGGTTGTAAAAGGTGTGAATCTGCCTGTCCAACGGATTTCTTAAGCGTTCGAGTTTATTTATGGCATGAAACAACTCGAAGCATG GGTCTAGCTTATTGATACGTTTCAAAAAACACCACACGAATATGTTTTTTTATTGGCAAAAACCCGTGATCAAAATAAAAAAAAGAATCTTATTTTTTCT ATTTTGAGTACGGGTTTTTCTGGCCCAAGTGTATCTTATTTTTATCACGAATTATTTTCCTTGGTTAACAATAGTTGTTGTTTTGCCAATAGCCGGGGGT TCCTTAATTTTCTTATTTCCTCATAGAGGAAATAAGGTAATTAGGTGGTATACTATTTGTATATGCTTAGTGGATCTCCTTCTAACAACCTATGCATTTT GTTATCATTTCAAATTGGATGATCCGTTAATCCAACTGACGGAGAATTATAAATGGATCCAGTTTTTTGATTTTTACTGGAGATTCGGAATAGATGGACT CTCTATAGGACCCATTTTACTGACTGGATTTATCACCACTTTAGCTACTTTAGCGGCTCATCCGGTTACTCGAGAATCCCGATTATTCCATTTCCTAATG TTAGCAATGTATAGTGGTCAAATAGGACTTTTTTCGTCACGAGACATTTTACTTTTTTTCATCATGTGGGAATTCGAATTAATTCCCGTTTATCTACTTT TATCCATGTGGGGGGGGAAGAAACGTTTGTATTCGGCTACAAAGTTTCTTTTATACACTGCGGGGGGTTCCATTTTTTTATTAATGGGAATTCTAGGTAT CGGTTTATATAGTTCTAATGAACCAACATTAAATTTGGAAATGTTAACTAATCGATCGTATCCCTTAGGACTCGAAATCCTATTTTATATAGGATTTCTT ATTGCTTTTGCTGTCAAATTGCCGATTATACCCTTCCATACATGGTTACCAGACACCCATGGAGAAGCACATTACAGCACTTGTATGCTTTTAGCCGGAA TCTTATTAAAAATGGGAGCGTATGGATTGGTTCGAATTAATATGGAATTATTACCCCGCGCTCATTCTATATTTTCTCCCTGGTTAATGATCATAGGTTC CATTCAAATAATCTATGCAGCTTTAACATCTCTGGGTCAACGTAATCTAAAAAAAAGAATAGCCTATTCCTCAGTATCTCATATGGGTTTCATAATTATA GGAATTGGTTCTCTAAGCGATACGGGGCTCAACGGGGCGATTTTACAAATAATCTCTCATGGATTTATCGGTGCCGCGCTCTTTTTCTTGGCGGGAACTG GTTATGATAGACTCCGTCTTCTTTATCTCGACGAAATGGGTGGAATGGCTATCCCAATGCCAAAAATATTCACGATTTTCAGTATCTTTTCGATGGCTTC TCTTGCATTGCCGGGCATGAGTGGTTTTGTTGCAGAATTTATAATTTTTTTTGGAATAATTACAAGCCAAAAATATCTTTTAATGACAAAAATATTAATT ACTTTTGTAACAGCAATTGGAATGATATTAACTCCTATTTATTTATTATCTATGTTACGGCAGATGTTCTATGGATACAAGCTTTTTAATACACCAAACT CTTATTTTTTTGATTCTGGACCGCGAGAATTATTTATTTCGATTTCTATCCTTATACCCGTAATAGGTATTGGTATTTATCCAGATTTCATTTTATCATT TTCGGTTGATAAGGTTGAAGCTATTCTATCTAATTTTTTATAGAGAGTTTTCGTGAATAAATTAATAAAACAAAAAAATAAAAAATAGACCTAAACCTTA CTGACAATGAAAAAAATGATAATAATTTTCTGTTGGATTAACTTAAAAAAAAAATGAATTTGAATTGTAATCAAATATGTTTGTGTTGTTTGTGAGAACC CCTTGAATCATTATATTACTTGATTTAAGGGGTTCTCGATGATTTATGGGAAGTTTTTTTCTTAATCTAATATTTAATCTAATATATATGCTTTCTATAT TTGTATTTGTCACATCCTCCTTTTTTTACTCACCTTAATTTAATTAGATATAAATGAACCATAACTATGTAGTCCTATTCCTAATAAATTGATCCCAAAA TAACATATCCAAATTAAAAAAAAACCCATAGAGGCCACCATTGAAGAATTTACACCTTCCAATTTTTTATTTTTTCTAGTATGTAAATAAATCGCGAATA CGGTCCAAGTAATAAAGGCCCAAGTTTCTTTTGGATCCCAATTCCAATATGATCCCCATGCCTCATTAGCCCATACTGCTCCTGAAAGAATACCTATTGT TAAAAAGATAAAACCTAGACTAATAATACGATAACCCCAACGGTCCAATTGTTGAATAAATTGAGACTTGTAATAATTTCTATAAGAAAAAAAAGAAGTC TTTTGTAAAACATTGTTTCTTTCATTCAGATTTATGTATTTGATCTCAGCAAAAGAAAACAATTCGTTTAAAAAATATAAATTATTGCTTTTACGAACAA TTTGTATGACTTCGCGAACTGTAATGACTAAAATAGCTACGGATAATAATGATCCACATAAAAGAGCTGCATAACTCAATATCATCATACTTACGTGCAT CATTAACCAATGGGATTGAAGAGCGGGTACTAATATTGCGGATTGATGTATTTTGGTTAAAAGACCCGAAGTAGCAAAACCTTGGGTAAACAAAACACTT GGTGCGATTATTGTACTTAAATGGTTTTGTAAACATGGAATCATATGAAAAATGGAAAAACCCCATGAAAGAAAGATTAATGATTCATATAAATCACTAA ATGGTAAATGGCTAGAAAAAATCCAACGAGTAACTAACAATCCCGTTATACAGAAAAAAGTTATTATCATGCCCTTTTCAGACGAATCATATAACCCTAC GATTTCATTCACTAATAAAGTTATCAAATGAATTGAAATTACAATTGATACGACGGAAAATGATATATGAGTTAATATATGCTCTAAGGTTGAAAATATC ATAAAAATAAAATAAAAACAAAGAAAGGTCTGAATACTAGGAATAGAATATAAATTGGGAAGTGAATTCGTTATAGGACTTACTCTTTTCGAAGATCAAA TGCCATGCCGCCACTCGGACTCGAACCGAGATGCTCGAGCACTGCTTCCTAAGAGCAGCGTGTCTACCAATTTCACCATAGCGGCTTACTCGAAATCATA ATAACCTATTTTTAGTCAATCGTCGATATGCAAAGACTCGATAAAAATGTTATATTTTTTTAGTAAACATTAAACTTATAAATAAAATAAATAAGAATTC G BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_178961; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_448967

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_448967

BlastpNAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic from Morus with 98.02% of identity
BlastxNAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic from Soja with 88.73% of identity
Eggnog-
Kegg-
CantataDBLink to cantataDB annotations (CNT0001954)
Mirbaseosa-MIR5079b (MI0026007)
Ncbi proteinLink to NCBI protein (YP_008963654.1)
PfamNADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L (PF00420.23)
RfamtRNA (RF00005)
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;