Ll_transcript_449644

• Id Trinity: TRINITY_DN50667_c0_g1_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_449644
• Sequence: CATTGATTGAATGAAAGGGTCAACACTGTGTCTCTCTTTCATCCCTAACTCTTAACTCTGATTTCTTGCAATCTCAATACAAAATGTTAGCTCGACTCGC CGGAAATCGATTCAACCAAATCCGTCACGTTTTTCATCAGGTTCTTCTTTTTCCCCTTCTTCATTTTCCTCACTTCCCTTTTTCTCATTCATTTTTTTGT TTCAGCCATCGAGAACTTTCTCAACCGCTCTCAATTATCACCTTGATTCTCCGGATAATAAACCTGACCTACCCTGGGAATATTCCGATGCCAACAAAAC TAAGGTATTCTAAAAATTTAAACTTTGAATCTGGGTAACCCTCTTTCACTCTCAAATTCAAAATGCAATAAAAACAAATGTAGCATAAGTAACTGCTTTA AGATTGTTATAAGTTCAATTATCTTGATTCTGTTATAGGTTTTAAATGTCTTTAGTGTTTAACAGAATGACTTAATCACTATAAAGATATTGATTGCTTT CGCGATTTTGAGTTATCTCTCATTTGATTATTCTATATTGCTCTAAGCTTAGTTTTGCCGAATGAAAACTATATATGGTCTTATAGTGAATGTATGAATG CGTTAGAGAGAAGAAAGTTGGGGTTACACCTATTGTATATAGAATTCAATATTAGGTGTTCTTGCATGTATGGAGGAGACCTTTATAAGCCTCGTGTGGA GGGTAGTCATATTGCTAGAGGTTGATGGAAACCGAGAAAAACTATGGGTGGAACCATTAAGAAAATTTTAGATGTAAATAGTTTGTATATAGATATGGTT CATGACAGCCACAAAACATTATAGCCTCTTTTGATCCATTTAGCTGACCCTTCCTAGTTGGAAAATGCTTGGTTTTTTGTGTTATAGTGGATCGGGCTTT GCTCCTTCAAATTTTGGTGGTGTACGTGAAAATTCTTTAAGGGTTTTGCTGTGTTGCAACTTAGTTGGTGTTCATTTTGCCCCACTATTACACTTTTGTG TGACTAGCTTTATGCTAACACTGATTATATGATTAGTTGAGTTCAACAGTTAGGTTTTAAAGCGCTTACTAAAGCAGAAGATAGAGCATAAGTTATGAGG TTAAGGAGATTTTATCTCACTATCCGTCGAACTACAAGCAATCTGCAGTGATCCCTCTGCTGGATCTTGCTCAGCAACAGCATGGGGGTTGGCTCCCTGT TTCTGCAATGAATGCGGTGGCTAAGGTTGTAGAGGTTGCTCCTATTCGTGTATATGAGGTTGCCACATTTTACTCAATGTTCAATCGAGCTAAGGTTGGA AAGTACCATCTTTTGGTTTGTGGAACAACACCTTGTATGATACGAGGTTCTCGAGGAATTGAAGAAGCTTTATTGAAACACTTGGGAGTGAAGCGCAATG AAGTAACGCAAGATGGTTTGTTTTCTGTTGGAGAAATGGAGTGCATGGTGAGTCTTTTCTTCGAACAAGATGTTGCCTTAATTTCAGCTTTGTCTTAGTC TTCAGAGTTGTAGTGTTGCTTGATTGGCACTGGCATGATGAGTGTATACGGTGGGGGGAAATTACATGAAGGACAATTGGATCACTCTATGAATGCAAAA GGTGCTTCGGGTGGTAGCTTTGGAAATGTCTAGTAACAAATATGGATATTATATTCAATTTCAGTAATATTCAATTTTCGAAATAATCTCTTGGATTGAT AGTATAAGAAATACCAGAACAGCCTTTACGGGACATTAATATCTAACCGAGATGAACGTTTTTATTACTATTGAGAATTCAAAAATAGTTTGATAAGTGA GGCACATGCTTTACTTCTGCTTTCACAGGTCCAGACACAATTAAAGCCATATATGTGGAATGTGGTGTATAGGAATGACAGGGTGATGTTGTTGGCCATA GTTTTGTTGATTGACCATTGATTGCATGATTGAAGTTGATGTTTTTATGCAGGGATGCTGTGTAAATGCTCCTATGATTACAGTGGCTGATTATTCAAAT GGATCAGAAGGATATACTTATAATTACTATGAAGATATAACCCCAGAGAAAGTAGCCGAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_178966;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_449644

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.4
• PS1: 0.7
• PS2: 0.5
• PS3: 0.4
• PW1: 0
• PW2: 0.6
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_449644

• Blastp: -
• Blastx: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial from Arabidopsis with 92.31% of identity
• Eggnog: Nadh dehydrogenase(COG1905)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G02580)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019436344.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;