Ll_transcript_450950

• Id Trinity: TRINITY_DN50692_c0_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_450950
• Sequence: CCTACTTCATATTTCATTTAAATATTTAAGATAAAATATTAACCAATATTATATATTTATATATCTTTTTACATACAACATGTCTCACATTTTTTATTTC AGAAAATATTCTTTTCGGTTTTCCACATGTATCATTACAATCAGACAATCATGAGTCGCCAATATCTATAATTGTACTAGGGCTAACTCTCTCAAAGGTA TTTTTCCATTCACAAGAAACCGAGACATTGCTTAAAAGATAATATGTAATTCTAGTTTGTGCAGAGTTAGAGTGAGACAGAGAAAGCTGTTTCATATTCA ATTTTGTTGGAATATGTAGATCTGGGTTTGTCTTTCTATTTCTATTTCTTTTCCCTTTGCTTTCTATTTCTATTTCTTCTTACTTTTTTGCTTATTTTCT GATACTATCTGCTCTACCTCACCTTCAAGTTTGTGTTTTTAAGCTTTTACTTCTACTTTTTTATTGCCCCAACTTCTAAAGTTTTGTGCTTGGTCTTAGT CAATCCACATTTCTCACACACCATCTCAAAGGGTGTCAAATTTTGTGGAGCTACAACCCTAATTGCTGATTTTACTTTTTATTTATTATAGTATCAATTC TTTGCTTTATCATATACTTTCCATTGTTTCATCATGCTTAGTTTTCAATTTTCAGAATTTATATGATATCTAAGGGAACTTGTAAAAAATAGTCAACTTT AGTCATGTTTCCCAATTTGCTGGTGGTGTTGTATTGAATGAATGAATTCTCTGCTAAGCAACCATACTGCAGTGTTTTAAATTGCAATTGCGGTCGCAAT TGCAGTAACGGTTATGGATATTGTGATTGCGGTCATTGTGGTAGTTGCGATGCTGAGTGCATCTGTTGCAGTGTGAATTATTTTGTAATTAAAAAACTAT TTTTGAATTTGATGCGGACTGCGGCCGTCACAATTGTGATTCAGAATCACACCACAATTGCGGTCGCAATTTAAATCACTACTGATATTAAATTTCAAGT TCTCAACGCAGGAATTATAATTTATGGTGCCTTGTTGAGTATAATGACAAATACACTTTATTCGGACCTACTTAACCCATGGTTAAGTGAGCTAGTCCAT GGCAACCGAACCCTACTATTTTGGTGGATCAAGCCGGGTTGGCTAGCAGTCCATAATTCACTTTTGGTGGTATTCCTATCTTGAGGAACCAATATATTTA TGTGTCTTTGTATGCTTGTCTGATTTTCTGCACATTTCTTTATTAACCACTTCCAATATGCAGTTAAGTGTGATATGTTAGTATTGATTTTGATACTATA TTCTGTTTGTTTACTGGTTTGCTGTCAGATAAATGACAAATGTATCATCCGAAGGGCTTTCCTAGTCAAAGTCTAATTAGAAGCAATTCATTAGTTCATG ATCACCATATAGATTGTGGTGGCAGCACAATGGATCCTGCCAATGGAGGAAATAATCTCACCAGCGATCCTAATCTCTCTTCAAAGCAACGTTTACGTTG GACACATGAGCTTCATGAACGCTTTGTGGGTGCTGTGGCACAACTTGGTGGACCAGATCGTGCCACACCCAAAGGGGTCCTCAGAGTTATGGGTGTTCAA GGCTTAACAATTTACCATGTCAAAAGCCATTTACAGAAATATCGTCTGGCAAAATACCTACCTGACTTCTCATCCGATGAAGGAAAAAATGCTGACAAGA AAGAAACTGGGGATATGCTTTCCAACCTTGATGGTCCATCTGGGATGCAGATTACTGAAGCACTAAAGCTTCAAATGGAGGTGCAGAAGCGACTACATGA ACAATTGGAGGTATCTTTTGTTGAACTGATCTAATGGCTTATATTAGCAGATTGTATTATGTACGATTCCTATGATGTTTAATCGTGCAAGAGACGATGA AGTGATGAGATTAATCTTTTGATTAGGGGCCGCTTGTTTAGGCTTAAAAAAAGTGATGTTGGCATTAATGTTTTTATGAAAACTCCAGGTTCTCCTAAAG GTTGAGTTTAAACTTTTCCCCGAATAAACGTTTTTAGTAAAAGCCCAACCAAACAAGCACATAATTTCATAACTGTTTTTTTAATGCCAATCACAGGACA TAGTACATTACATGTATGTACTTCTAATCCAGGGAGAAGAGGATAAAGTTGTTAAATACCTTATGCAATTCTAATCTAGGGAGAAGAGGATAAAGTTACA TGAATGCATCTGCAGGGTATTAGGTTCTGATGTTAGTAAGTTATGCAGTGGAAAAGGCTACTGTTTTAACACGGTGCTGCATCGGTAATTCTGACAGCAA AAGATGATAAGCACACTGTTCTTCATCACATGTTAATGATAATCATAGACAATTTTTATACAACAAGCAAGCCTTAGTTCCACTAGGTTGGGCCGGCTAC ATGGATCAGACAATGTCACAATGTTCTATCATTAATCATGTCCATTGACAAAGCCATATAGACAAATTCTATCTTGTTTATAAATCCAAATTGAACATGC TTTCTCCTTCGAATTTTCAGTTTTGAATCAAGAAAAGGCACAATATACAGAATGGTGAATTATAAACAAGATCCCCAGCTTGTATTTTTTTTTTATGTGA AACAGGTGCAGAGACAGCTACAATTACGAATCGAAGCTCAGGGTAAATACTTGAAAAAGATAATTGAAGAGCAACAGCGTCTCAGTGGGGTTCTTTCAGC AGATGAACCTGGCTCTGGGGTTGCACCCTCAGCTCAAGGAGGTCTGTGCCACAAACATGATAACAAGACTGACCCGGCAACTCCTGACCCAGAAAAGGCT GCCAAAGATCGCGCCCCGGCGAAGAGTCTGTCAAATGAGTCTTTTTCATCTCACGATGAACCACTCACACCGGATTCTGACTGCCACATTGGTTCCTCAG CTGAGAGCCCTAAAGGGGAGAGATCAACCAAGAAGCAAAGAGTAAGCATGGGGGAAGCAGCATATTCTAAATCAGACATGGTGCTTCCACATCAGATACT GGAGTCAAGCATGTCATCATACCAGCAGCCAAACACTGTTCCTTTGCCAAGAGCAATTTGACTCTTCATTGAGGGGTATATCTGGCAGAAATGGTGAGGA GTTGGAGAAGTAATTTGTGATTTGGTGTGATATGTAGATTGTGCACTAGGACTTATTTTAGTTTTTCTGTGTTAAGTTTATTCTTTTAGTTCATTATTTG ACTGAGTTGGTTTGAATTGGGATAGATAGCTTCTTGTCACCACTTTAATTTCATATCACGGTGCCTATGACTGAGAGGCTAACATGATATCTTTGATTAG ACAAAATTGTACCTATGGTTAGGAACAGATGAGTGCTATACAGAAAATTTACTGTAAAAGTCCAAGTTTGTAATATCTAGATGTGTGCATGGGAAAAATG CCTAGTCACTTGCTTCAATAACAGTGTAATTTCAAGCAAGGTTAAAGTGCAAGTGAAATCAAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_179133;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_450950

FPKM

• PAB: 2.5
• PNAB: 6.7
• PS1: 7.1
• PS2: 3.3
• PS3: 3.3
• PW1: 3.8
• PW2: 5.1
• PW3: 3.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_450950

• Blastp: Myb family transcription factor PHL7 from Arabidopsis with 53.55% of identity
• Blastx: Myb family transcription factor PHL7 from Arabidopsis with 84.38% of identity
• Eggnog: Myb-like DNA-binding domain(ENOG4111GBR)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G01060)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019440063.1)
• Pfam: MYB-CC type transfactor, LHEQLE motif (PF14379.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;